Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 0 | 0 | 1 | 1.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MGEBAGBN_12 | 23709 | 22129 | GroEL | 0.0 | folding of newly synthesized proteins, preventing misfolding and aggregation | 87.29 | 96.70 | BAA04222 |
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| MGEBAGBN_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_2 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_4 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_14 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_20 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_21 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_23 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_25 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_26 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_27 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_30 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_31 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_32 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_33 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_34 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_35 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_37 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_38 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_40 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_41 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_42 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_43 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_45 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_48 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_49 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_50 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_51 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_52 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_53 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_54 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_56 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_57 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_58 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_59 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MGEBAGBN_60 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_61 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MGEBAGBN_62 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_63 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_64 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_65 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MGEBAGBN_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_67 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MGEBAGBN_68 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MGEBAGBN_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_70 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MGEBAGBN_71 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_72 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_73 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_74 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_75 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| MGEBAGBN_76 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_78 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_79 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_80 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| MGEBAGBN_81 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)
Prophage
Phigaro
| Query ID | Begin | End | Transposable | Taxonomy | pVOGs |
|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||
Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)