Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
PIJKPNMN_10.01.00.0
PIJKPNMN_20.01.00.0
PIJKPNMN_30.01.00.0
PIJKPNMN_40.01.00.0
PIJKPNMN_50.01.00.0
PIJKPNMN_60.01.00.0
PIJKPNMN_70.01.00.0
PIJKPNMN_80.01.00.0
PIJKPNMN_90.01.00.0
PIJKPNMN_100.01.00.0
PIJKPNMN_110.01.00.0
PIJKPNMN_120.01.00.0
PIJKPNMN_130.01.00.0
PIJKPNMN_140.01.00.0
PIJKPNMN_150.01.00.0
PIJKPNMN_160.01.00.0
PIJKPNMN_170.01.00.0
PIJKPNMN_180.01.00.0
PIJKPNMN_190.01.00.0
PIJKPNMN_200.01.00.0
PIJKPNMN_210.01.00.0
PIJKPNMN_220.01.00.0
PIJKPNMN_230.01.00.0
PIJKPNMN_240.01.00.0
PIJKPNMN_250.01.00.0
PIJKPNMN_260.01.00.0
PIJKPNMN_270.01.00.0
PIJKPNMN_280.01.00.0
PIJKPNMN_290.01.00.0
PIJKPNMN_300.01.00.0
PIJKPNMN_310.01.00.0
PIJKPNMN_320.01.00.0
PIJKPNMN_330.01.00.0
PIJKPNMN_340.01.00.0
PIJKPNMN_350.01.00.0
PIJKPNMN_360.01.00.0
PIJKPNMN_370.01.00.0
PIJKPNMN_380.01.00.0
PIJKPNMN_390.01.00.0
PIJKPNMN_400.01.00.0
PIJKPNMN_410.01.00.0
PIJKPNMN_420.01.00.0
PIJKPNMN_430.01.00.0
PIJKPNMN_440.01.00.0
PIJKPNMN_450.01.00.0
PIJKPNMN_460.01.00.0
PIJKPNMN_470.01.00.0
PIJKPNMN_480.01.00.0
PIJKPNMN_490.01.00.0
PIJKPNMN_500.01.00.0
PIJKPNMN_510.01.00.0
PIJKPNMN_520.01.00.0
PIJKPNMN_530.01.00.0
PIJKPNMN_540.01.00.0
PIJKPNMN_550.01.00.0
PIJKPNMN_560.01.00.0
PIJKPNMN_570.01.00.0
PIJKPNMN_580.01.00.0
PIJKPNMN_590.01.00.0
PIJKPNMN_600.01.00.0
PIJKPNMN_610.01.00.0
PIJKPNMN_620.01.00.0
PIJKPNMN_631.00.01.0
PIJKPNMN_640.01.00.0
PIJKPNMN_651.00.01.0
PIJKPNMN_660.01.00.0
PIJKPNMN_670.01.00.0
PIJKPNMN_680.01.00.0
PIJKPNMN_690.01.00.0
PIJKPNMN_700.01.00.0
PIJKPNMN_710.01.00.0
PIJKPNMN_720.01.00.0
PIJKPNMN_730.01.00.0
PIJKPNMN_740.01.00.0
PIJKPNMN_750.01.00.0
PIJKPNMN_761.00.01.0
PIJKPNMN_770.01.00.0
PIJKPNMN_780.01.00.0
PIJKPNMN_790.01.00.0
PIJKPNMN_800.01.00.0
PIJKPNMN_810.01.00.0
PIJKPNMN_820.01.00.0
PIJKPNMN_830.01.00.0
PIJKPNMN_840.01.00.0
PIJKPNMN_850.01.00.0
PIJKPNMN_861.00.01.0
PIJKPNMN_870.01.00.0
PIJKPNMN_880.01.00.0
PIJKPNMN_890.01.00.0
PIJKPNMN_901.00.01.0
PIJKPNMN_910.01.00.0
PIJKPNMN_920.01.00.0
PIJKPNMN_931.00.01.0
PIJKPNMN_941.00.01.0
PIJKPNMN_950.01.00.0
PIJKPNMN_960.01.00.0
PIJKPNMN_970.01.00.0
PIJKPNMN_980.01.00.0
PIJKPNMN_990.01.00.0
PIJKPNMN_1000.01.00.0
PIJKPNMN_1011.00.01.0
PIJKPNMN_1021.00.01.0
PIJKPNMN_1031.00.01.0
PIJKPNMN_1041.00.01.0
PIJKPNMN_1050.01.00.0
PIJKPNMN_1060.01.00.0
PIJKPNMN_1070.01.00.0
PIJKPNMN_1081.00.01.0
PIJKPNMN_1091.00.01.0
PIJKPNMN_1101.00.01.0
PIJKPNMN_1111.00.01.0
PIJKPNMN_1120.01.00.0
PIJKPNMN_1131.00.01.0
PIJKPNMN_1140.01.00.0
PIJKPNMN_1150.01.00.0
PIJKPNMN_1160.01.00.0
PIJKPNMN_1170.01.00.0
PIJKPNMN_1181.00.01.0
PIJKPNMN_1190.01.00.0
PIJKPNMN_1201.00.01.0
PIJKPNMN_1210.01.00.0
PIJKPNMN_1221.00.01.0
PIJKPNMN_1230.01.00.0
PIJKPNMN_1241.00.01.0
PIJKPNMN_1251.00.01.0
PIJKPNMN_1260.01.00.0
PIJKPNMN_1271.00.01.0
PIJKPNMN_1281.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements