Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
POPHFAJL_10.01.00.0
POPHFAJL_20.01.00.0
POPHFAJL_30.01.00.0
POPHFAJL_40.01.00.0
POPHFAJL_50.01.00.0
POPHFAJL_60.01.00.0
POPHFAJL_70.01.00.0
POPHFAJL_80.01.00.0
POPHFAJL_90.01.00.0
POPHFAJL_100.01.00.0
POPHFAJL_110.01.00.0
POPHFAJL_120.01.00.0
POPHFAJL_130.01.00.0
POPHFAJL_140.01.00.0
POPHFAJL_150.01.00.0
POPHFAJL_160.01.00.0
POPHFAJL_170.01.00.0
POPHFAJL_180.01.00.0
POPHFAJL_190.01.00.0
POPHFAJL_200.01.00.0
POPHFAJL_210.01.00.0
POPHFAJL_220.01.00.0
POPHFAJL_230.01.00.0
POPHFAJL_240.01.00.0
POPHFAJL_250.01.00.0
POPHFAJL_260.01.00.0
POPHFAJL_270.01.00.0
POPHFAJL_280.01.00.0
POPHFAJL_290.01.00.0
POPHFAJL_300.01.00.0
POPHFAJL_310.01.00.0
POPHFAJL_320.01.00.0
POPHFAJL_330.01.00.0
POPHFAJL_340.01.00.0
POPHFAJL_350.01.00.0
POPHFAJL_360.01.00.0
POPHFAJL_370.01.00.0
POPHFAJL_380.01.00.0
POPHFAJL_390.01.00.0
POPHFAJL_401.00.01.0
POPHFAJL_410.01.00.0
POPHFAJL_420.01.00.0
POPHFAJL_430.01.00.0
POPHFAJL_440.01.00.0
POPHFAJL_450.01.00.0
POPHFAJL_460.01.00.0
POPHFAJL_470.01.00.0
POPHFAJL_480.01.00.0
POPHFAJL_490.01.00.0
POPHFAJL_500.01.00.0
POPHFAJL_510.01.00.0
POPHFAJL_520.01.00.0
POPHFAJL_530.01.00.0
POPHFAJL_541.00.01.0
POPHFAJL_550.01.00.0
POPHFAJL_561.00.01.0
POPHFAJL_570.01.00.0
POPHFAJL_580.01.00.0
POPHFAJL_590.01.00.0
POPHFAJL_600.01.00.0
POPHFAJL_610.01.00.0
POPHFAJL_620.01.00.0
POPHFAJL_630.01.00.0
POPHFAJL_640.01.00.0
POPHFAJL_650.01.00.0
POPHFAJL_660.01.00.0
POPHFAJL_670.01.00.0
POPHFAJL_680.01.00.0
POPHFAJL_691.00.01.0
POPHFAJL_700.01.00.0
POPHFAJL_710.01.00.0
POPHFAJL_720.01.00.0
POPHFAJL_730.01.00.0
POPHFAJL_740.01.00.0
POPHFAJL_750.01.00.0
POPHFAJL_761.00.01.0
POPHFAJL_770.01.00.0
POPHFAJL_780.01.00.0
POPHFAJL_790.01.00.0
POPHFAJL_800.01.00.0
POPHFAJL_810.01.00.0
POPHFAJL_820.01.00.0
POPHFAJL_830.01.00.0
POPHFAJL_840.01.00.0
POPHFAJL_850.01.00.0
POPHFAJL_860.01.00.0
POPHFAJL_871.00.01.0
POPHFAJL_881.00.01.0
POPHFAJL_890.01.00.0
POPHFAJL_900.01.00.0
POPHFAJL_910.01.00.0
POPHFAJL_920.01.00.0
POPHFAJL_930.01.00.0
POPHFAJL_941.00.01.0
POPHFAJL_950.01.00.0
POPHFAJL_960.01.00.0
POPHFAJL_970.01.00.0
POPHFAJL_980.01.00.0
POPHFAJL_990.01.00.0
POPHFAJL_1000.01.00.0
POPHFAJL_1011.00.01.0
POPHFAJL_1021.00.01.0
POPHFAJL_1030.01.00.0
POPHFAJL_1040.01.00.0
POPHFAJL_1051.00.01.0
POPHFAJL_1061.00.01.0
POPHFAJL_1071.00.01.0
POPHFAJL_1081.00.01.0
POPHFAJL_1090.01.00.0
POPHFAJL_1100.01.00.0
POPHFAJL_1110.01.00.0
POPHFAJL_1121.00.01.0
POPHFAJL_1131.00.01.0
POPHFAJL_1141.00.01.0
POPHFAJL_1150.01.00.0
POPHFAJL_1160.01.00.0
POPHFAJL_1171.00.01.0
POPHFAJL_1180.01.00.0
POPHFAJL_1191.00.01.0
POPHFAJL_1200.01.00.0
POPHFAJL_1210.01.00.0
POPHFAJL_1221.00.01.0
POPHFAJL_1230.01.00.0
POPHFAJL_1240.01.00.0
POPHFAJL_1250.01.00.0
POPHFAJL_1260.01.00.0
POPHFAJL_1270.01.00.0
POPHFAJL_1280.01.00.0
POPHFAJL_1291.00.01.0
POPHFAJL_1300.01.00.0
POPHFAJL_1311.00.01.0
POPHFAJL_1321.00.01.0
POPHFAJL_1331.00.01.0
POPHFAJL_1340.01.00.0
POPHFAJL_1350.01.00.0
POPHFAJL_1360.01.00.0
POPHFAJL_1371.00.01.0
POPHFAJL_1380.01.00.0
POPHFAJL_1390.01.00.0
POPHFAJL_1401.00.01.0
POPHFAJL_1410.01.00.0
POPHFAJL_1420.01.00.0
POPHFAJL_1430.01.00.0
POPHFAJL_1441.00.01.0
POPHFAJL_1460.01.00.0
POPHFAJL_1470.01.00.0
POPHFAJL_1481.00.01.0
POPHFAJL_1491.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
POPHFAJL_40693115180FalseSiphoviridaeVOG0198,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements