Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
IFFOJIKN_10.01.00.0
IFFOJIKN_20.01.00.0
IFFOJIKN_30.01.00.0
IFFOJIKN_40.01.00.0
IFFOJIKN_50.01.00.0
IFFOJIKN_60.01.00.0
IFFOJIKN_70.01.00.0
IFFOJIKN_80.01.00.0
IFFOJIKN_90.01.00.0
IFFOJIKN_100.01.00.0
IFFOJIKN_110.01.00.0
IFFOJIKN_120.01.00.0
IFFOJIKN_130.01.00.0
IFFOJIKN_140.01.00.0
IFFOJIKN_150.01.00.0
IFFOJIKN_160.01.00.0
IFFOJIKN_170.01.00.0
IFFOJIKN_180.01.00.0
IFFOJIKN_190.01.00.0
IFFOJIKN_200.01.00.0
IFFOJIKN_210.01.00.0
IFFOJIKN_220.01.00.0
IFFOJIKN_230.01.00.0
IFFOJIKN_240.01.00.0
IFFOJIKN_250.01.00.0
IFFOJIKN_260.01.00.0
IFFOJIKN_270.01.00.0
IFFOJIKN_280.01.00.0
IFFOJIKN_290.01.00.0
IFFOJIKN_300.01.00.0
IFFOJIKN_310.01.00.0
IFFOJIKN_320.01.00.0
IFFOJIKN_330.01.00.0
IFFOJIKN_340.01.00.0
IFFOJIKN_350.01.00.0
IFFOJIKN_360.01.00.0
IFFOJIKN_370.01.00.0
IFFOJIKN_380.01.00.0
IFFOJIKN_390.01.00.0
IFFOJIKN_400.01.00.0
IFFOJIKN_410.01.00.0
IFFOJIKN_420.01.00.0
IFFOJIKN_430.01.00.0
IFFOJIKN_440.01.00.0
IFFOJIKN_451.00.01.0
IFFOJIKN_460.01.00.0
IFFOJIKN_470.01.00.0
IFFOJIKN_481.00.01.0
IFFOJIKN_490.01.00.0
IFFOJIKN_500.01.00.0
IFFOJIKN_510.01.00.0
IFFOJIKN_520.01.00.0
IFFOJIKN_530.01.00.0
IFFOJIKN_540.01.00.0
IFFOJIKN_551.00.01.0
IFFOJIKN_561.00.01.0
IFFOJIKN_571.00.01.0
IFFOJIKN_580.01.00.0
IFFOJIKN_590.01.00.0
IFFOJIKN_601.00.01.0
IFFOJIKN_610.01.00.0
IFFOJIKN_621.00.01.0
IFFOJIKN_630.01.00.0
IFFOJIKN_640.01.00.0
IFFOJIKN_650.01.00.0
IFFOJIKN_660.01.00.0
IFFOJIKN_671.00.01.0
IFFOJIKN_680.01.00.0
IFFOJIKN_690.01.00.0
IFFOJIKN_700.01.00.0
IFFOJIKN_710.01.00.0
IFFOJIKN_721.00.01.0
IFFOJIKN_731.00.01.0
IFFOJIKN_740.01.00.0
IFFOJIKN_751.00.01.0
IFFOJIKN_760.01.00.0
IFFOJIKN_770.01.00.0
IFFOJIKN_780.01.00.0
IFFOJIKN_791.00.01.0
IFFOJIKN_801.00.01.0
IFFOJIKN_810.01.00.0
IFFOJIKN_821.00.01.0
IFFOJIKN_831.00.01.0
IFFOJIKN_840.01.00.0
IFFOJIKN_851.00.01.0
IFFOJIKN_860.01.00.0
IFFOJIKN_870.01.00.0
IFFOJIKN_881.00.01.0
IFFOJIKN_890.01.00.0
IFFOJIKN_900.01.00.0
IFFOJIKN_910.01.00.0
IFFOJIKN_921.00.01.0
IFFOJIKN_930.01.00.0
IFFOJIKN_940.01.00.0
IFFOJIKN_950.01.00.0
IFFOJIKN_960.01.00.0
IFFOJIKN_971.00.01.0
IFFOJIKN_981.00.01.0
IFFOJIKN_990.01.00.0
IFFOJIKN_1001.00.01.0
IFFOJIKN_1011.00.01.0
IFFOJIKN_1021.00.01.0
IFFOJIKN_1030.01.00.0
IFFOJIKN_1040.01.00.0
IFFOJIKN_1050.01.00.0
IFFOJIKN_1061.00.01.0
IFFOJIKN_1071.00.01.0
IFFOJIKN_1081.00.01.0
IFFOJIKN_1091.00.01.0
IFFOJIKN_1101.00.01.0
IFFOJIKN_1110.01.00.0
IFFOJIKN_1121.00.01.0
IFFOJIKN_1131.00.01.0
IFFOJIKN_1141.00.01.0
IFFOJIKN_1150.01.00.0
IFFOJIKN_1160.01.00.0
IFFOJIKN_1171.00.01.0
IFFOJIKN_1181.00.01.0
IFFOJIKN_1191.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements