Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
NODMDCJF_10.01.00.0
NODMDCJF_20.01.00.0
NODMDCJF_30.01.00.0
NODMDCJF_40.01.00.0
NODMDCJF_50.01.00.0
NODMDCJF_60.01.00.0
NODMDCJF_70.01.00.0
NODMDCJF_80.01.00.0
NODMDCJF_90.01.00.0
NODMDCJF_100.01.00.0
NODMDCJF_110.01.00.0
NODMDCJF_120.01.00.0
NODMDCJF_130.01.00.0
NODMDCJF_140.01.00.0
NODMDCJF_151.00.01.0
NODMDCJF_160.01.00.0
NODMDCJF_170.01.00.0
NODMDCJF_180.01.00.0
NODMDCJF_190.01.00.0
NODMDCJF_200.01.00.0
NODMDCJF_210.01.00.0
NODMDCJF_220.01.00.0
NODMDCJF_230.01.00.0
NODMDCJF_240.01.00.0
NODMDCJF_251.00.01.0
NODMDCJF_261.00.01.0
NODMDCJF_270.01.00.0
NODMDCJF_280.01.00.0
NODMDCJF_290.01.00.0
NODMDCJF_300.01.00.0
NODMDCJF_310.01.00.0
NODMDCJF_320.01.00.0
NODMDCJF_330.01.00.0
NODMDCJF_340.01.00.0
NODMDCJF_350.01.00.0
NODMDCJF_361.00.01.0
NODMDCJF_370.01.00.0
NODMDCJF_381.00.01.0
NODMDCJF_391.00.01.0
NODMDCJF_400.01.00.0
NODMDCJF_410.01.00.0
NODMDCJF_420.01.00.0
NODMDCJF_430.01.00.0
NODMDCJF_441.00.01.0
NODMDCJF_450.01.00.0
NODMDCJF_461.00.01.0
NODMDCJF_471.00.01.0
NODMDCJF_480.01.00.0
NODMDCJF_491.00.01.0
NODMDCJF_501.00.01.0
NODMDCJF_510.01.00.0
NODMDCJF_521.00.01.0
NODMDCJF_530.01.00.0
NODMDCJF_540.01.00.0
NODMDCJF_550.01.00.0
NODMDCJF_560.01.00.0
NODMDCJF_570.01.00.0
NODMDCJF_580.01.00.0
NODMDCJF_591.00.01.0
NODMDCJF_600.01.00.0
NODMDCJF_610.01.00.0
NODMDCJF_620.01.00.0
NODMDCJF_630.01.00.0
NODMDCJF_641.00.01.0
NODMDCJF_650.01.00.0
NODMDCJF_661.00.01.0
NODMDCJF_670.01.00.0
NODMDCJF_681.00.01.0
NODMDCJF_690.01.00.0
NODMDCJF_701.00.01.0
NODMDCJF_710.01.00.0
NODMDCJF_720.01.00.0
NODMDCJF_730.01.00.0
NODMDCJF_740.01.00.0
NODMDCJF_750.01.00.0
NODMDCJF_760.01.00.0
NODMDCJF_770.01.00.0
NODMDCJF_780.01.00.0
NODMDCJF_790.01.00.0
NODMDCJF_801.00.01.0
NODMDCJF_810.01.00.0
NODMDCJF_820.01.00.0
NODMDCJF_831.00.01.0
NODMDCJF_840.01.00.0
NODMDCJF_850.01.00.0
NODMDCJF_861.00.01.0
NODMDCJF_870.01.00.0
NODMDCJF_881.00.01.0
NODMDCJF_890.01.00.0
NODMDCJF_900.01.00.0
NODMDCJF_910.01.00.0
NODMDCJF_920.01.00.0
NODMDCJF_931.00.01.0
NODMDCJF_940.01.00.0
NODMDCJF_950.01.00.0
NODMDCJF_960.01.00.0
NODMDCJF_971.00.01.0
NODMDCJF_980.01.00.0
NODMDCJF_990.01.00.0
NODMDCJF_1001.00.01.0
NODMDCJF_1010.01.00.0
NODMDCJF_1020.01.00.0
NODMDCJF_1030.01.00.0
NODMDCJF_1040.01.00.0
NODMDCJF_1050.01.00.0
NODMDCJF_1061.00.01.0
NODMDCJF_1070.01.00.0
NODMDCJF_1080.01.00.0
NODMDCJF_1091.00.01.0
NODMDCJF_1100.01.00.0
NODMDCJF_1111.00.01.0
NODMDCJF_1120.01.00.0
NODMDCJF_1130.01.00.0
NODMDCJF_1140.01.00.0
NODMDCJF_1151.00.01.0
NODMDCJF_1161.00.01.0
NODMDCJF_1170.01.00.0
NODMDCJF_1180.01.00.0
NODMDCJF_1190.01.00.0
NODMDCJF_1200.01.00.0
NODMDCJF_1210.01.00.0
NODMDCJF_1221.00.01.0
NODMDCJF_1231.00.01.0
NODMDCJF_1241.00.01.0
NODMDCJF_1250.01.00.0
NODMDCJF_1261.00.01.0
NODMDCJF_1271.00.01.0
NODMDCJF_1281.00.01.0
NODMDCJF_1291.00.01.0
NODMDCJF_1300.01.00.0
NODMDCJF_1310.01.00.0
NODMDCJF_1320.01.00.0
NODMDCJF_1331.00.01.0
NODMDCJF_1340.01.00.0
NODMDCJF_1350.01.00.0
NODMDCJF_1361.00.01.0
NODMDCJF_1370.01.00.0
NODMDCJF_1380.01.00.0
NODMDCJF_1390.01.00.0
NODMDCJF_1400.01.00.0
NODMDCJF_1410.01.00.0
NODMDCJF_1421.00.01.0
NODMDCJF_1431.00.01.0
NODMDCJF_1440.01.00.0
NODMDCJF_1451.00.01.0
NODMDCJF_1460.01.00.0
NODMDCJF_1470.01.00.0
NODMDCJF_1481.00.01.0
NODMDCJF_1490.01.00.0
NODMDCJF_1501.00.01.0
NODMDCJF_1510.01.00.0
NODMDCJF_1520.01.00.0
NODMDCJF_1531.00.01.0
NODMDCJF_1540.01.00.0
NODMDCJF_1551.00.01.0
NODMDCJF_1561.00.01.0
NODMDCJF_1570.01.00.0
NODMDCJF_1581.00.01.0
NODMDCJF_1590.01.00.0
NODMDCJF_1600.01.00.0
NODMDCJF_1610.01.00.0
NODMDCJF_1621.00.01.0
NODMDCJF_1631.00.01.0
NODMDCJF_1641.00.01.0
NODMDCJF_1651.00.01.0
NODMDCJF_1661.00.01.0
NODMDCJF_1671.00.01.0
NODMDCJF_1680.01.00.0
NODMDCJF_1690.01.00.0
NODMDCJF_1701.00.01.0
NODMDCJF_1710.01.00.0
NODMDCJF_1720.01.00.0
NODMDCJF_1731.00.01.0
NODMDCJF_1741.00.01.0
NODMDCJF_1750.01.00.0
NODMDCJF_1760.01.00.0
NODMDCJF_1771.00.01.0
NODMDCJF_1780.01.00.0
NODMDCJF_1791.00.01.0
NODMDCJF_1800.01.00.0
NODMDCJF_1810.01.00.0
NODMDCJF_1821.00.01.0
NODMDCJF_1831.00.01.0
NODMDCJF_1841.00.01.0
NODMDCJF_1850.01.00.0
NODMDCJF_1860.01.00.0
NODMDCJF_1870.01.00.0
NODMDCJF_1880.01.00.0
NODMDCJF_1890.01.00.0
NODMDCJF_1900.01.00.0
NODMDCJF_1911.00.01.0
NODMDCJF_1921.00.01.0
NODMDCJF_1930.01.00.0
NODMDCJF_1940.01.00.0
NODMDCJF_1950.01.00.0
NODMDCJF_1961.00.01.0
NODMDCJF_1971.00.01.0
NODMDCJF_1981.00.01.0
NODMDCJF_1990.01.00.0
NODMDCJF_2001.00.01.0
NODMDCJF_2011.00.01.0
NODMDCJF_2020.01.00.0
NODMDCJF_2031.00.01.0
NODMDCJF_2040.01.00.0
NODMDCJF_2050.01.00.0
NODMDCJF_2061.00.01.0
NODMDCJF_2071.00.01.0
NODMDCJF_2080.01.00.0
NODMDCJF_2091.00.01.0
NODMDCJF_2101.00.01.0
NODMDCJF_2110.01.00.0
NODMDCJF_2121.00.01.0
NODMDCJF_2131.00.01.0
NODMDCJF_2140.01.00.0
NODMDCJF_2150.01.00.0
NODMDCJF_2160.01.00.0
NODMDCJF_2171.00.01.0
NODMDCJF_2180.01.00.0
NODMDCJF_2191.00.01.0
NODMDCJF_2201.00.01.0
NODMDCJF_2210.01.00.0
NODMDCJF_2221.00.01.0
NODMDCJF_2231.00.01.0
NODMDCJF_2240.01.00.0
NODMDCJF_2250.01.00.0
NODMDCJF_2261.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements