Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
MFAJOCNA_10.01.00.0
MFAJOCNA_20.01.00.0
MFAJOCNA_30.01.00.0
MFAJOCNA_40.01.00.0
MFAJOCNA_50.01.00.0
MFAJOCNA_60.01.00.0
MFAJOCNA_70.01.00.0
MFAJOCNA_80.01.00.0
MFAJOCNA_90.01.00.0
MFAJOCNA_100.01.00.0
MFAJOCNA_110.01.00.0
MFAJOCNA_120.01.00.0
MFAJOCNA_130.01.00.0
MFAJOCNA_140.01.00.0
MFAJOCNA_150.01.00.0
MFAJOCNA_160.01.00.0
MFAJOCNA_170.01.00.0
MFAJOCNA_180.01.00.0
MFAJOCNA_190.01.00.0
MFAJOCNA_200.01.00.0
MFAJOCNA_210.01.00.0
MFAJOCNA_220.01.00.0
MFAJOCNA_230.01.00.0
MFAJOCNA_240.01.00.0
MFAJOCNA_250.01.00.0
MFAJOCNA_260.01.00.0
MFAJOCNA_270.01.00.0
MFAJOCNA_280.01.00.0
MFAJOCNA_290.01.00.0
MFAJOCNA_300.01.00.0
MFAJOCNA_310.01.00.0
MFAJOCNA_320.01.00.0
MFAJOCNA_330.01.00.0
MFAJOCNA_341.00.01.0
MFAJOCNA_350.01.00.0
MFAJOCNA_360.01.00.0
MFAJOCNA_370.01.00.0
MFAJOCNA_380.01.00.0
MFAJOCNA_390.01.00.0
MFAJOCNA_400.01.00.0
MFAJOCNA_410.01.00.0
MFAJOCNA_420.01.00.0
MFAJOCNA_430.01.00.0
MFAJOCNA_440.01.00.0
MFAJOCNA_450.01.00.0
MFAJOCNA_460.01.00.0
MFAJOCNA_470.01.00.0
MFAJOCNA_480.01.00.0
MFAJOCNA_490.01.00.0
MFAJOCNA_500.01.00.0
MFAJOCNA_510.01.00.0
MFAJOCNA_520.01.00.0
MFAJOCNA_531.00.01.0
MFAJOCNA_541.00.01.0
MFAJOCNA_550.01.00.0
MFAJOCNA_560.01.00.0
MFAJOCNA_570.01.00.0
MFAJOCNA_580.01.00.0
MFAJOCNA_590.01.00.0
MFAJOCNA_600.01.00.0
MFAJOCNA_610.01.00.0
MFAJOCNA_620.01.00.0
MFAJOCNA_630.01.00.0
MFAJOCNA_640.01.00.0
MFAJOCNA_650.01.00.0
MFAJOCNA_660.01.00.0
MFAJOCNA_671.00.01.0
MFAJOCNA_680.01.00.0
MFAJOCNA_691.00.01.0
MFAJOCNA_701.00.01.0
MFAJOCNA_710.01.00.0
MFAJOCNA_720.01.00.0
MFAJOCNA_731.00.01.0
MFAJOCNA_741.00.01.0
MFAJOCNA_750.01.00.0
MFAJOCNA_760.01.00.0
MFAJOCNA_770.01.00.0
MFAJOCNA_780.01.00.0
MFAJOCNA_791.00.01.0
MFAJOCNA_801.00.01.0
MFAJOCNA_811.00.01.0
MFAJOCNA_820.01.00.0
MFAJOCNA_830.01.00.0
MFAJOCNA_840.01.00.0
MFAJOCNA_851.00.01.0
MFAJOCNA_860.01.00.0
MFAJOCNA_871.00.01.0
MFAJOCNA_881.00.01.0
MFAJOCNA_890.01.00.0
MFAJOCNA_900.01.00.0
MFAJOCNA_911.00.01.0
MFAJOCNA_921.00.01.0
MFAJOCNA_930.01.00.0
MFAJOCNA_941.00.01.0
MFAJOCNA_951.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
MFAJOCNA_31250139629FalseMyoviridaeVOG6815,
MFAJOCNA_86445182951FalseMyoviridaeVOG4862,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements