Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
1001.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
IKMFIFOJ_142070421606cepAARO:3003559cepA100.00100.00U05883.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
IKMFIFOJ_142070421606cepAUnknown Beta-lactam100.00100.00L13472

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
IKMFIFOJ_142070721606cepACepA family extended-spectrum class A beta-lactamaseEXACTX100.00100.00WP_005795628.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
IKMFIFOJ_10.01.00.0
IKMFIFOJ_20.01.00.0
IKMFIFOJ_30.01.00.0
IKMFIFOJ_40.01.00.0
IKMFIFOJ_50.01.00.0
IKMFIFOJ_60.01.00.0
IKMFIFOJ_70.01.00.0
IKMFIFOJ_80.01.00.0
IKMFIFOJ_90.01.00.0
IKMFIFOJ_100.01.00.0
IKMFIFOJ_110.01.00.0
IKMFIFOJ_120.01.00.0
IKMFIFOJ_130.01.00.0
IKMFIFOJ_140.01.00.0
IKMFIFOJ_150.01.00.0
IKMFIFOJ_160.01.00.0
IKMFIFOJ_170.01.00.0
IKMFIFOJ_180.01.00.0
IKMFIFOJ_190.01.00.0
IKMFIFOJ_200.01.00.0
IKMFIFOJ_210.01.00.0
IKMFIFOJ_220.01.00.0
IKMFIFOJ_230.01.00.0
IKMFIFOJ_240.01.00.0
IKMFIFOJ_250.01.00.0
IKMFIFOJ_260.01.00.0
IKMFIFOJ_270.01.00.0
IKMFIFOJ_280.01.00.0
IKMFIFOJ_290.01.00.0
IKMFIFOJ_300.01.00.0
IKMFIFOJ_310.01.00.0
IKMFIFOJ_320.01.00.0
IKMFIFOJ_330.01.00.0
IKMFIFOJ_340.01.00.0
IKMFIFOJ_350.01.00.0
IKMFIFOJ_360.01.00.0
IKMFIFOJ_370.01.00.0
IKMFIFOJ_380.01.00.0
IKMFIFOJ_390.01.00.0
IKMFIFOJ_400.01.00.0
IKMFIFOJ_410.01.00.0
IKMFIFOJ_420.01.00.0
IKMFIFOJ_430.01.00.0
IKMFIFOJ_440.01.00.0
IKMFIFOJ_450.01.00.0
IKMFIFOJ_460.01.00.0
IKMFIFOJ_470.01.00.0
IKMFIFOJ_480.01.00.0
IKMFIFOJ_490.01.00.0
IKMFIFOJ_500.01.00.0
IKMFIFOJ_510.01.00.0
IKMFIFOJ_520.01.00.0
IKMFIFOJ_530.01.00.0
IKMFIFOJ_541.00.01.0
IKMFIFOJ_550.01.00.0
IKMFIFOJ_560.01.00.0
IKMFIFOJ_570.01.00.0
IKMFIFOJ_580.01.00.0
IKMFIFOJ_590.01.00.0
IKMFIFOJ_600.01.00.0
IKMFIFOJ_610.01.00.0
IKMFIFOJ_620.01.00.0
IKMFIFOJ_630.01.00.0
IKMFIFOJ_640.01.00.0
IKMFIFOJ_650.01.00.0
IKMFIFOJ_660.01.00.0
IKMFIFOJ_670.01.00.0
IKMFIFOJ_680.01.00.0
IKMFIFOJ_690.01.00.0
IKMFIFOJ_700.01.00.0
IKMFIFOJ_710.01.00.0
IKMFIFOJ_720.01.00.0
IKMFIFOJ_730.01.00.0
IKMFIFOJ_741.00.01.0
IKMFIFOJ_750.01.00.0
IKMFIFOJ_760.01.00.0
IKMFIFOJ_770.01.00.0
IKMFIFOJ_780.01.00.0
IKMFIFOJ_790.01.00.0
IKMFIFOJ_800.01.00.0
IKMFIFOJ_810.01.00.0
IKMFIFOJ_820.01.00.0
IKMFIFOJ_830.01.00.0
IKMFIFOJ_840.01.00.0
IKMFIFOJ_850.01.00.0
IKMFIFOJ_860.01.00.0
IKMFIFOJ_870.01.00.0
IKMFIFOJ_880.01.00.0
IKMFIFOJ_891.00.01.0
IKMFIFOJ_900.01.00.0
IKMFIFOJ_910.01.00.0
IKMFIFOJ_920.01.00.0
IKMFIFOJ_930.01.00.0
IKMFIFOJ_940.01.00.0
IKMFIFOJ_950.01.00.0
IKMFIFOJ_960.01.00.0
IKMFIFOJ_970.01.00.0
IKMFIFOJ_981.00.01.0
IKMFIFOJ_990.01.00.0
IKMFIFOJ_1000.01.00.0
IKMFIFOJ_1011.00.01.0
IKMFIFOJ_1020.01.00.0
IKMFIFOJ_1030.01.00.0
IKMFIFOJ_1040.01.00.0
IKMFIFOJ_1050.01.00.0
IKMFIFOJ_1061.00.01.0
IKMFIFOJ_1070.01.00.0
IKMFIFOJ_1080.01.00.0
IKMFIFOJ_1090.01.00.0
IKMFIFOJ_1100.01.00.0
IKMFIFOJ_1110.01.00.0
IKMFIFOJ_1120.01.00.0
IKMFIFOJ_1131.00.01.0
IKMFIFOJ_1140.01.00.0
IKMFIFOJ_1150.01.00.0
IKMFIFOJ_1160.01.00.0
IKMFIFOJ_1170.01.00.0
IKMFIFOJ_1180.01.00.0
IKMFIFOJ_1190.01.00.0
IKMFIFOJ_1200.01.00.0
IKMFIFOJ_1210.01.00.0
IKMFIFOJ_1221.00.01.0
IKMFIFOJ_1230.01.00.0
IKMFIFOJ_1240.01.00.0
IKMFIFOJ_1250.01.00.0
IKMFIFOJ_1261.00.01.0
IKMFIFOJ_1270.01.00.0
IKMFIFOJ_1280.01.00.0
IKMFIFOJ_1290.01.00.0
IKMFIFOJ_1300.01.00.0
IKMFIFOJ_1310.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements