Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
GACJGOEM_10.01.00.0
GACJGOEM_20.01.00.0
GACJGOEM_30.01.00.0
GACJGOEM_40.01.00.0
GACJGOEM_50.01.00.0
GACJGOEM_60.01.00.0
GACJGOEM_70.01.00.0
GACJGOEM_80.01.00.0
GACJGOEM_90.01.00.0
GACJGOEM_100.01.00.0
GACJGOEM_111.00.01.0
GACJGOEM_120.01.00.0
GACJGOEM_130.01.00.0
GACJGOEM_140.01.00.0
GACJGOEM_150.01.00.0
GACJGOEM_160.01.00.0
GACJGOEM_170.01.00.0
GACJGOEM_180.01.00.0
GACJGOEM_191.00.01.0
GACJGOEM_200.01.00.0
GACJGOEM_210.01.00.0
GACJGOEM_220.01.00.0
GACJGOEM_230.01.00.0
GACJGOEM_240.01.00.0
GACJGOEM_250.01.00.0
GACJGOEM_260.01.00.0
GACJGOEM_270.01.00.0
GACJGOEM_280.01.00.0
GACJGOEM_290.01.00.0
GACJGOEM_300.01.00.0
GACJGOEM_310.01.00.0
GACJGOEM_320.01.00.0
GACJGOEM_330.01.00.0
GACJGOEM_341.00.01.0
GACJGOEM_350.01.00.0
GACJGOEM_360.01.00.0
GACJGOEM_370.01.00.0
GACJGOEM_380.01.00.0
GACJGOEM_390.01.00.0
GACJGOEM_400.01.00.0
GACJGOEM_410.01.00.0
GACJGOEM_420.01.00.0
GACJGOEM_430.01.00.0
GACJGOEM_440.01.00.0
GACJGOEM_450.01.00.0
GACJGOEM_460.01.00.0
GACJGOEM_470.01.00.0
GACJGOEM_480.01.00.0
GACJGOEM_490.01.00.0
GACJGOEM_500.01.00.0
GACJGOEM_510.01.00.0
GACJGOEM_520.01.00.0
GACJGOEM_530.01.00.0
GACJGOEM_540.01.00.0
GACJGOEM_550.01.00.0
GACJGOEM_561.00.01.0
GACJGOEM_570.01.00.0
GACJGOEM_580.01.00.0
GACJGOEM_590.01.00.0
GACJGOEM_600.01.00.0
GACJGOEM_610.01.00.0
GACJGOEM_620.01.00.0
GACJGOEM_630.01.00.0
GACJGOEM_640.01.00.0
GACJGOEM_650.01.00.0
GACJGOEM_660.01.00.0
GACJGOEM_670.01.00.0
GACJGOEM_680.01.00.0
GACJGOEM_690.01.00.0
GACJGOEM_701.00.01.0
GACJGOEM_710.01.00.0
GACJGOEM_720.01.00.0
GACJGOEM_730.01.00.0
GACJGOEM_740.01.00.0
GACJGOEM_750.01.00.0
GACJGOEM_760.01.00.0
GACJGOEM_770.01.00.0
GACJGOEM_780.01.00.0
GACJGOEM_790.01.00.0
GACJGOEM_801.00.01.0
GACJGOEM_810.01.00.0
GACJGOEM_820.01.00.0
GACJGOEM_830.01.00.0
GACJGOEM_840.01.00.0
GACJGOEM_851.00.01.0
GACJGOEM_860.01.00.0
GACJGOEM_870.01.00.0
GACJGOEM_880.01.00.0
GACJGOEM_890.01.00.0
GACJGOEM_901.00.01.0
GACJGOEM_910.01.00.0
GACJGOEM_920.01.00.0
GACJGOEM_930.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements