Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 2 | 0 | 0 | 2.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| GBJGDCJK_228 | 6154 | 6813 | catA1 | ARO:3002683 | catA1 | 100.00 | 100.00 | V00622.1 |
| GBJGDCJK_228 | 800 | 1660 | TEM-116 | ARO:3000979 | TEM-116 | 100.00 | 100.00 | U36911.1 |
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| GBJGDCJK_228 | 800 | 1660 | blaTEM-116 | Amoxicillin, Ampicillin, Cephalothin, Piperacillin, Ticarcillin | 100.00 | 100.00 | AY425988 |
| GBJGDCJK_228 | 6154 | 6813 | catA1 | Chloramphenicol | 99.85 | 100.00 | V00622 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| GBJGDCJK_228 | 800 | 1657 | blaTEM-116 | broad-spectrum class A beta-lactamase TEM-116 | ALLELEX | 100.00 | 100.00 | WP_000027050.1 |
| GBJGDCJK_228 | 6157 | 6813 | catA1 | type A-1 chloramphenicol O-acetyltransferase | EXACTX | 100.00 | 100.00 | WP_000412211.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| GBJGDCJK_228 | 4970 | 5649 | repUS2 | 682 / 681 | 99.27 | BFU30316 |
| GBJGDCJK_228 | 2075 | 2205 | ColRNAI | 131 / 130 | 87.02 | DQ298019 |
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| GBJGDCJK_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_2 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_4 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_14 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_20 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_21 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_23 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_25 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_26 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_27 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_30 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_31 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_32 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_33 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_34 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_35 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_37 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_38 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_40 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_41 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_42 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_43 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_45 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_48 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_49 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_50 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_51 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_52 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_53 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_54 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_56 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_57 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_58 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_59 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_60 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_61 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_62 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_63 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_64 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_65 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_67 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_68 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_70 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_71 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_72 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_73 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_74 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_75 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_76 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_78 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_79 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_80 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_81 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_82 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_83 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_84 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_85 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_86 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_87 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_88 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_89 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_90 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_91 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_92 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_93 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_94 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_95 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_96 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_97 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_98 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_99 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_100 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_101 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_102 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_103 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_104 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_105 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_106 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_107 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_108 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_109 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_110 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_111 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_112 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_113 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_114 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_115 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_116 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_117 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_118 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_119 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_120 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_121 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_122 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_123 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_124 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_125 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_126 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_127 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_128 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_129 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_130 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_131 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_132 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_133 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_134 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_135 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_136 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_137 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_138 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_139 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_140 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_141 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_142 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_143 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_144 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_145 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_146 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_147 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_148 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_149 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_150 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_151 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_152 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_153 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_154 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_155 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_156 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_157 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_158 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_159 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_160 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_161 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_162 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_163 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_164 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_165 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_166 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_167 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_168 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_169 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_170 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_171 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_172 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_173 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_174 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_175 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_176 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_177 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_178 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_179 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_180 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_181 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_182 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_183 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_184 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_185 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_186 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_187 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_188 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_189 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_190 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_191 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_192 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_193 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_194 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_195 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_196 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_197 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_198 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_199 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_200 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_201 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_202 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_203 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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| GBJGDCJK_205 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_206 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_207 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_208 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_209 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_210 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_211 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_212 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_213 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_214 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_215 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_216 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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| GBJGDCJK_222 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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| GBJGDCJK_226 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_227 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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| GBJGDCJK_229 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_230 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_231 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_232 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_233 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_234 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_235 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_236 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_237 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_238 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_239 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_240 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_241 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_242 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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| GBJGDCJK_244 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_245 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_246 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_247 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_248 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_249 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_250 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_251 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_252 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_253 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_254 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_255 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_256 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| GBJGDCJK_257 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_258 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_259 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_260 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_261 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| GBJGDCJK_262 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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Prophage
Phigaro
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