Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
NPHICILA_10.01.00.0
NPHICILA_20.01.00.0
NPHICILA_30.01.00.0
NPHICILA_40.01.00.0
NPHICILA_50.01.00.0
NPHICILA_60.01.00.0
NPHICILA_70.01.00.0
NPHICILA_80.01.00.0
NPHICILA_90.01.00.0
NPHICILA_100.01.00.0
NPHICILA_110.01.00.0
NPHICILA_120.01.00.0
NPHICILA_130.01.00.0
NPHICILA_140.01.00.0
NPHICILA_150.01.00.0
NPHICILA_160.01.00.0
NPHICILA_170.01.00.0
NPHICILA_180.01.00.0
NPHICILA_190.01.00.0
NPHICILA_200.01.00.0
NPHICILA_210.01.00.0
NPHICILA_220.01.00.0
NPHICILA_230.01.00.0
NPHICILA_240.01.00.0
NPHICILA_250.01.00.0
NPHICILA_260.01.00.0
NPHICILA_270.01.00.0
NPHICILA_280.01.00.0
NPHICILA_290.01.00.0
NPHICILA_300.01.00.0
NPHICILA_310.01.00.0
NPHICILA_320.01.00.0
NPHICILA_330.01.00.0
NPHICILA_340.01.00.0
NPHICILA_350.01.00.0
NPHICILA_360.01.00.0
NPHICILA_370.01.00.0
NPHICILA_380.01.00.0
NPHICILA_390.01.00.0
NPHICILA_400.01.00.0
NPHICILA_410.01.00.0
NPHICILA_420.01.00.0
NPHICILA_430.01.00.0
NPHICILA_440.01.00.0
NPHICILA_450.01.00.0
NPHICILA_460.01.00.0
NPHICILA_470.01.00.0
NPHICILA_480.01.00.0
NPHICILA_490.01.00.0
NPHICILA_500.01.00.0
NPHICILA_510.01.00.0
NPHICILA_520.01.00.0
NPHICILA_530.01.00.0
NPHICILA_540.01.00.0
NPHICILA_550.01.00.0
NPHICILA_560.01.00.0
NPHICILA_570.01.00.0
NPHICILA_580.01.00.0
NPHICILA_590.01.00.0
NPHICILA_600.01.00.0
NPHICILA_610.01.00.0
NPHICILA_620.01.00.0
NPHICILA_630.01.00.0
NPHICILA_641.00.01.0
NPHICILA_650.01.00.0
NPHICILA_660.01.00.0
NPHICILA_671.00.01.0
NPHICILA_680.01.00.0
NPHICILA_690.01.00.0
NPHICILA_700.01.00.0
NPHICILA_710.01.00.0
NPHICILA_720.01.00.0
NPHICILA_731.00.01.0
NPHICILA_740.01.00.0
NPHICILA_751.00.01.0
NPHICILA_760.01.00.0
NPHICILA_770.01.00.0
NPHICILA_780.01.00.0
NPHICILA_790.01.00.0
NPHICILA_801.00.01.0
NPHICILA_810.01.00.0
NPHICILA_820.01.00.0
NPHICILA_830.01.00.0
NPHICILA_841.00.01.0
NPHICILA_850.01.00.0
NPHICILA_861.00.01.0
NPHICILA_871.00.01.0
NPHICILA_880.01.00.0
NPHICILA_890.01.00.0
NPHICILA_900.01.00.0
NPHICILA_910.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements