Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0011.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
DPFKIKFC_204829246712GroEL0.0folding of newly synthesized proteins, preventing misfolding and aggregation86.9196.70BAA04222

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
DPFKIKFC_10.01.00.0
DPFKIKFC_20.01.00.0
DPFKIKFC_30.01.00.0
DPFKIKFC_40.01.00.0
DPFKIKFC_50.01.00.0
DPFKIKFC_60.01.00.0
DPFKIKFC_70.01.00.0
DPFKIKFC_80.01.00.0
DPFKIKFC_90.01.00.0
DPFKIKFC_100.01.00.0
DPFKIKFC_110.01.00.0
DPFKIKFC_120.01.00.0
DPFKIKFC_130.01.00.0
DPFKIKFC_140.01.00.0
DPFKIKFC_150.01.00.0
DPFKIKFC_160.01.00.0
DPFKIKFC_170.01.00.0
DPFKIKFC_180.01.00.0
DPFKIKFC_190.01.00.0
DPFKIKFC_200.01.00.0
DPFKIKFC_210.01.00.0
DPFKIKFC_220.01.00.0
DPFKIKFC_230.01.00.0
DPFKIKFC_240.01.00.0
DPFKIKFC_250.01.00.0
DPFKIKFC_260.01.00.0
DPFKIKFC_270.01.00.0
DPFKIKFC_280.01.00.0
DPFKIKFC_290.01.00.0
DPFKIKFC_300.01.00.0
DPFKIKFC_310.01.00.0
DPFKIKFC_321.00.01.0
DPFKIKFC_330.01.00.0
DPFKIKFC_340.01.00.0
DPFKIKFC_350.01.00.0
DPFKIKFC_360.01.00.0
DPFKIKFC_370.01.00.0
DPFKIKFC_380.01.00.0
DPFKIKFC_390.01.00.0
DPFKIKFC_400.01.00.0
DPFKIKFC_410.01.00.0
DPFKIKFC_420.01.00.0
DPFKIKFC_430.01.00.0
DPFKIKFC_440.01.00.0
DPFKIKFC_450.01.00.0
DPFKIKFC_460.01.00.0
DPFKIKFC_470.01.00.0
DPFKIKFC_480.01.00.0
DPFKIKFC_490.01.00.0
DPFKIKFC_500.01.00.0
DPFKIKFC_510.01.00.0
DPFKIKFC_520.01.00.0
DPFKIKFC_530.01.00.0
DPFKIKFC_540.01.00.0
DPFKIKFC_550.01.00.0
DPFKIKFC_560.01.00.0
DPFKIKFC_570.01.00.0
DPFKIKFC_580.01.00.0
DPFKIKFC_590.01.00.0
DPFKIKFC_600.01.00.0
DPFKIKFC_610.01.00.0
DPFKIKFC_620.01.00.0
DPFKIKFC_630.01.00.0
DPFKIKFC_640.01.00.0
DPFKIKFC_650.01.00.0
DPFKIKFC_660.01.00.0
DPFKIKFC_670.01.00.0
DPFKIKFC_680.01.00.0
DPFKIKFC_690.01.00.0
DPFKIKFC_700.01.00.0
DPFKIKFC_710.01.00.0
DPFKIKFC_720.01.00.0
DPFKIKFC_730.01.00.0
DPFKIKFC_740.01.00.0
DPFKIKFC_750.01.00.0
DPFKIKFC_761.00.01.0
DPFKIKFC_770.01.00.0
DPFKIKFC_780.01.00.0
DPFKIKFC_791.00.01.0
DPFKIKFC_800.01.00.0
DPFKIKFC_810.01.00.0
DPFKIKFC_820.01.00.0
DPFKIKFC_830.01.00.0
DPFKIKFC_840.01.00.0
DPFKIKFC_850.01.00.0
DPFKIKFC_860.01.00.0
DPFKIKFC_870.01.00.0
DPFKIKFC_881.00.01.0
DPFKIKFC_890.01.00.0
DPFKIKFC_900.01.00.0
DPFKIKFC_910.01.00.0
DPFKIKFC_920.01.00.0
DPFKIKFC_930.01.00.0
DPFKIKFC_940.01.00.0
DPFKIKFC_950.01.00.0
DPFKIKFC_960.01.00.0
DPFKIKFC_970.01.00.0
DPFKIKFC_981.00.01.0
DPFKIKFC_991.00.01.0
DPFKIKFC_1001.00.01.0
DPFKIKFC_1011.00.01.0
DPFKIKFC_1020.01.00.0
DPFKIKFC_1030.01.00.0
DPFKIKFC_1040.01.00.0
DPFKIKFC_1050.01.00.0
DPFKIKFC_1060.01.00.0
DPFKIKFC_1070.01.00.0
DPFKIKFC_1080.01.00.0
DPFKIKFC_1090.01.00.0
DPFKIKFC_1100.01.00.0
DPFKIKFC_1110.01.00.0
DPFKIKFC_1120.01.00.0
DPFKIKFC_1130.01.00.0
DPFKIKFC_1140.01.00.0
DPFKIKFC_1151.00.01.0
DPFKIKFC_1160.01.00.0
DPFKIKFC_1170.01.00.0
DPFKIKFC_1180.01.00.0
DPFKIKFC_1190.01.00.0
DPFKIKFC_1200.01.00.0
DPFKIKFC_1210.01.00.0
DPFKIKFC_1220.01.00.0
DPFKIKFC_1230.01.00.0
DPFKIKFC_1240.01.00.0
DPFKIKFC_1250.01.00.0
DPFKIKFC_1260.01.00.0
DPFKIKFC_1271.00.01.0
DPFKIKFC_1280.01.00.0
DPFKIKFC_1290.01.00.0
DPFKIKFC_1301.00.01.0
DPFKIKFC_1310.01.00.0
DPFKIKFC_1320.01.00.0
DPFKIKFC_1330.01.00.0
DPFKIKFC_1340.01.00.0
DPFKIKFC_1350.01.00.0
DPFKIKFC_1361.00.01.0
DPFKIKFC_1370.01.00.0
DPFKIKFC_1380.01.00.0
DPFKIKFC_1390.01.00.0
DPFKIKFC_1400.01.00.0
DPFKIKFC_1410.01.00.0
DPFKIKFC_1420.01.00.0
DPFKIKFC_1430.01.00.0
DPFKIKFC_1441.00.01.0
DPFKIKFC_1450.01.00.0
DPFKIKFC_1460.01.00.0
DPFKIKFC_1470.01.00.0
DPFKIKFC_1480.01.00.0
DPFKIKFC_1490.01.00.0
DPFKIKFC_1501.00.01.0
DPFKIKFC_1510.01.00.0
DPFKIKFC_1520.01.00.0
DPFKIKFC_1530.01.00.0
DPFKIKFC_1541.00.01.0
DPFKIKFC_1550.01.00.0
DPFKIKFC_1560.01.00.0
DPFKIKFC_1570.01.00.0
DPFKIKFC_1581.00.01.0
DPFKIKFC_1590.01.00.0
DPFKIKFC_1600.01.00.0
DPFKIKFC_1610.01.00.0
DPFKIKFC_1620.01.00.0
DPFKIKFC_1631.00.01.0
DPFKIKFC_1641.00.01.0
DPFKIKFC_1651.00.01.0
DPFKIKFC_1660.01.00.0
DPFKIKFC_1670.01.00.0
DPFKIKFC_1680.01.00.0
DPFKIKFC_1690.01.00.0
DPFKIKFC_1701.00.01.0
DPFKIKFC_1711.00.01.0
DPFKIKFC_1720.01.00.0
DPFKIKFC_1730.01.00.0
DPFKIKFC_1741.00.01.0
DPFKIKFC_1751.00.01.0
DPFKIKFC_1761.00.01.0
DPFKIKFC_1771.00.01.0
DPFKIKFC_1780.01.00.0
DPFKIKFC_1790.01.00.0
DPFKIKFC_1800.01.00.0
DPFKIKFC_1811.00.01.0
DPFKIKFC_1820.01.00.0
DPFKIKFC_1830.01.00.0
DPFKIKFC_1840.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
DPFKIKFC_194022253806FalseMyoviridaeVOG8816,
DPFKIKFC_491628125045FalseMyoviridae/

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements