Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
COPCJJKO_10.01.00.0
COPCJJKO_20.01.00.0
COPCJJKO_30.01.00.0
COPCJJKO_40.01.00.0
COPCJJKO_50.01.00.0
COPCJJKO_60.01.00.0
COPCJJKO_70.01.00.0
COPCJJKO_80.01.00.0
COPCJJKO_90.01.00.0
COPCJJKO_100.01.00.0
COPCJJKO_110.01.00.0
COPCJJKO_120.01.00.0
COPCJJKO_130.01.00.0
COPCJJKO_140.01.00.0
COPCJJKO_150.01.00.0
COPCJJKO_160.01.00.0
COPCJJKO_170.01.00.0
COPCJJKO_180.01.00.0
COPCJJKO_190.01.00.0
COPCJJKO_200.01.00.0
COPCJJKO_210.01.00.0
COPCJJKO_220.01.00.0
COPCJJKO_230.01.00.0
COPCJJKO_240.01.00.0
COPCJJKO_250.01.00.0
COPCJJKO_260.01.00.0
COPCJJKO_270.01.00.0
COPCJJKO_280.01.00.0
COPCJJKO_290.01.00.0
COPCJJKO_300.01.00.0
COPCJJKO_310.01.00.0
COPCJJKO_320.01.00.0
COPCJJKO_330.01.00.0
COPCJJKO_340.01.00.0
COPCJJKO_350.01.00.0
COPCJJKO_360.01.00.0
COPCJJKO_370.01.00.0
COPCJJKO_380.01.00.0
COPCJJKO_390.01.00.0
COPCJJKO_400.01.00.0
COPCJJKO_410.01.00.0
COPCJJKO_420.01.00.0
COPCJJKO_430.01.00.0
COPCJJKO_440.01.00.0
COPCJJKO_450.01.00.0
COPCJJKO_460.01.00.0
COPCJJKO_470.01.00.0
COPCJJKO_481.00.01.0
COPCJJKO_490.01.00.0
COPCJJKO_500.01.00.0
COPCJJKO_510.01.00.0
COPCJJKO_520.01.00.0
COPCJJKO_530.01.00.0
COPCJJKO_540.01.00.0
COPCJJKO_550.01.00.0
COPCJJKO_560.01.00.0
COPCJJKO_570.01.00.0
COPCJJKO_580.01.00.0
COPCJJKO_590.01.00.0
COPCJJKO_600.01.00.0
COPCJJKO_610.01.00.0
COPCJJKO_620.01.00.0
COPCJJKO_630.01.00.0
COPCJJKO_640.01.00.0
COPCJJKO_650.01.00.0
COPCJJKO_660.01.00.0
COPCJJKO_670.01.00.0
COPCJJKO_680.01.00.0
COPCJJKO_690.01.00.0
COPCJJKO_700.01.00.0
COPCJJKO_710.01.00.0
COPCJJKO_720.01.00.0
COPCJJKO_730.01.00.0
COPCJJKO_740.01.00.0
COPCJJKO_750.01.00.0
COPCJJKO_760.01.00.0
COPCJJKO_770.01.00.0
COPCJJKO_780.01.00.0
COPCJJKO_790.01.00.0
COPCJJKO_800.01.00.0
COPCJJKO_810.01.00.0
COPCJJKO_820.01.00.0
COPCJJKO_830.01.00.0
COPCJJKO_840.01.00.0
COPCJJKO_850.01.00.0
COPCJJKO_860.01.00.0
COPCJJKO_870.01.00.0
COPCJJKO_880.01.00.0
COPCJJKO_890.01.00.0
COPCJJKO_900.01.00.0
COPCJJKO_910.01.00.0
COPCJJKO_920.01.00.0
COPCJJKO_930.01.00.0
COPCJJKO_940.01.00.0
COPCJJKO_951.00.01.0
COPCJJKO_960.01.00.0
COPCJJKO_970.01.00.0
COPCJJKO_981.00.01.0
COPCJJKO_990.01.00.0
COPCJJKO_1000.01.00.0
COPCJJKO_1010.01.00.0
COPCJJKO_1020.01.00.0
COPCJJKO_1030.01.00.0
COPCJJKO_1040.01.00.0
COPCJJKO_1050.01.00.0
COPCJJKO_1060.01.00.0
COPCJJKO_1070.01.00.0
COPCJJKO_1080.01.00.0
COPCJJKO_1090.01.00.0
COPCJJKO_1100.01.00.0
COPCJJKO_1110.01.00.0
COPCJJKO_1120.01.00.0
COPCJJKO_1130.01.00.0
COPCJJKO_1140.01.00.0
COPCJJKO_1150.01.00.0
COPCJJKO_1161.00.01.0
COPCJJKO_1170.01.00.0
COPCJJKO_1180.01.00.0
COPCJJKO_1190.01.00.0
COPCJJKO_1201.00.01.0
COPCJJKO_1211.00.01.0
COPCJJKO_1220.01.00.0
COPCJJKO_1231.00.01.0
COPCJJKO_1241.00.01.0
COPCJJKO_1250.01.00.0
COPCJJKO_1260.01.00.0
COPCJJKO_1270.01.00.0
COPCJJKO_1281.00.01.0
COPCJJKO_1290.01.00.0
COPCJJKO_1300.01.00.0
COPCJJKO_1310.01.00.0
COPCJJKO_1320.01.00.0
COPCJJKO_1330.01.00.0
COPCJJKO_1340.01.00.0
COPCJJKO_1350.01.00.0
COPCJJKO_1360.01.00.0
COPCJJKO_1370.01.00.0
COPCJJKO_1380.01.00.0
COPCJJKO_1390.01.00.0
COPCJJKO_1400.01.00.0
COPCJJKO_1411.00.01.0
COPCJJKO_1420.01.00.0
COPCJJKO_1430.01.00.0
COPCJJKO_1440.01.00.0
COPCJJKO_1450.01.00.0
COPCJJKO_1460.01.00.0
COPCJJKO_1470.01.00.0
COPCJJKO_1481.00.01.0
COPCJJKO_1490.01.00.0
COPCJJKO_1500.01.00.0
COPCJJKO_1510.01.00.0
COPCJJKO_1520.01.00.0
COPCJJKO_1530.01.00.0
COPCJJKO_1540.01.00.0
COPCJJKO_1550.01.00.0
COPCJJKO_1560.01.00.0
COPCJJKO_1571.00.01.0
COPCJJKO_1580.01.00.0
COPCJJKO_1591.00.01.0
COPCJJKO_1600.01.00.0
COPCJJKO_1610.01.00.0
COPCJJKO_1620.01.00.0
COPCJJKO_1630.01.00.0
COPCJJKO_1640.01.00.0
COPCJJKO_1650.01.00.0
COPCJJKO_1660.01.00.0
COPCJJKO_1670.01.00.0
COPCJJKO_1681.00.01.0
COPCJJKO_1690.01.00.0
COPCJJKO_1700.01.00.0
COPCJJKO_1710.01.00.0
COPCJJKO_1720.01.00.0
COPCJJKO_1730.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements