Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0011.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
OKAMCPFK_374702648606GroEL0.0folding of newly synthesized proteins, preventing misfolding and aggregation87.2996.70BAA04222

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
OKAMCPFK_10.01.00.0
OKAMCPFK_20.01.00.0
OKAMCPFK_30.01.00.0
OKAMCPFK_40.01.00.0
OKAMCPFK_50.01.00.0
OKAMCPFK_60.01.00.0
OKAMCPFK_70.01.00.0
OKAMCPFK_80.01.00.0
OKAMCPFK_90.01.00.0
OKAMCPFK_100.01.00.0
OKAMCPFK_110.01.00.0
OKAMCPFK_120.01.00.0
OKAMCPFK_130.01.00.0
OKAMCPFK_140.01.00.0
OKAMCPFK_150.01.00.0
OKAMCPFK_160.01.00.0
OKAMCPFK_170.01.00.0
OKAMCPFK_180.01.00.0
OKAMCPFK_190.01.00.0
OKAMCPFK_200.01.00.0
OKAMCPFK_210.01.00.0
OKAMCPFK_220.01.00.0
OKAMCPFK_230.01.00.0
OKAMCPFK_240.01.00.0
OKAMCPFK_250.01.00.0
OKAMCPFK_260.01.00.0
OKAMCPFK_270.01.00.0
OKAMCPFK_280.01.00.0
OKAMCPFK_290.01.00.0
OKAMCPFK_300.01.00.0
OKAMCPFK_310.01.00.0
OKAMCPFK_320.01.00.0
OKAMCPFK_330.01.00.0
OKAMCPFK_340.01.00.0
OKAMCPFK_350.01.00.0
OKAMCPFK_360.01.00.0
OKAMCPFK_370.01.00.0
OKAMCPFK_380.01.00.0
OKAMCPFK_390.01.00.0
OKAMCPFK_400.01.00.0
OKAMCPFK_410.01.00.0
OKAMCPFK_420.01.00.0
OKAMCPFK_430.01.00.0
OKAMCPFK_440.01.00.0
OKAMCPFK_450.01.00.0
OKAMCPFK_460.01.00.0
OKAMCPFK_470.01.00.0
OKAMCPFK_480.01.00.0
OKAMCPFK_490.01.00.0
OKAMCPFK_500.01.00.0
OKAMCPFK_510.01.00.0
OKAMCPFK_520.01.00.0
OKAMCPFK_530.01.00.0
OKAMCPFK_540.01.00.0
OKAMCPFK_550.01.00.0
OKAMCPFK_560.01.00.0
OKAMCPFK_570.01.00.0
OKAMCPFK_580.01.00.0
OKAMCPFK_590.01.00.0
OKAMCPFK_600.01.00.0
OKAMCPFK_610.01.00.0
OKAMCPFK_620.01.00.0
OKAMCPFK_630.01.00.0
OKAMCPFK_640.01.00.0
OKAMCPFK_650.01.00.0
OKAMCPFK_660.01.00.0
OKAMCPFK_670.01.00.0
OKAMCPFK_680.01.00.0
OKAMCPFK_690.01.00.0
OKAMCPFK_700.01.00.0
OKAMCPFK_710.01.00.0
OKAMCPFK_720.01.00.0
OKAMCPFK_730.01.00.0
OKAMCPFK_740.01.00.0
OKAMCPFK_750.01.00.0
OKAMCPFK_760.01.00.0
OKAMCPFK_771.00.01.0
OKAMCPFK_780.01.00.0
OKAMCPFK_791.00.01.0
OKAMCPFK_800.01.00.0
OKAMCPFK_810.01.00.0
OKAMCPFK_820.01.00.0
OKAMCPFK_830.01.00.0
OKAMCPFK_841.00.01.0
OKAMCPFK_851.00.01.0
OKAMCPFK_860.01.00.0
OKAMCPFK_870.01.00.0
OKAMCPFK_880.01.00.0
OKAMCPFK_890.01.00.0
OKAMCPFK_900.01.00.0
OKAMCPFK_910.01.00.0
OKAMCPFK_920.01.00.0
OKAMCPFK_930.01.00.0
OKAMCPFK_941.00.01.0
OKAMCPFK_950.01.00.0
OKAMCPFK_961.00.01.0
OKAMCPFK_970.01.00.0
OKAMCPFK_980.01.00.0
OKAMCPFK_990.01.00.0
OKAMCPFK_1000.01.00.0
OKAMCPFK_1010.01.00.0
OKAMCPFK_1020.01.00.0
OKAMCPFK_1030.01.00.0
OKAMCPFK_1040.01.00.0
OKAMCPFK_1050.01.00.0
OKAMCPFK_1061.00.01.0
OKAMCPFK_1070.01.00.0
OKAMCPFK_1080.01.00.0
OKAMCPFK_1090.01.00.0
OKAMCPFK_1100.01.00.0
OKAMCPFK_1110.01.00.0
OKAMCPFK_1120.01.00.0
OKAMCPFK_1130.01.00.0
OKAMCPFK_1140.01.00.0
OKAMCPFK_1151.00.01.0
OKAMCPFK_1161.00.01.0
OKAMCPFK_1170.01.00.0
OKAMCPFK_1180.01.00.0
OKAMCPFK_1190.01.00.0
OKAMCPFK_1201.00.01.0
OKAMCPFK_1210.01.00.0
OKAMCPFK_1221.00.01.0
OKAMCPFK_1230.01.00.0
OKAMCPFK_1240.01.00.0
OKAMCPFK_1250.01.00.0
OKAMCPFK_1261.00.01.0
OKAMCPFK_1271.00.01.0
OKAMCPFK_1280.01.00.0
OKAMCPFK_1290.01.00.0
OKAMCPFK_1300.01.00.0
OKAMCPFK_1311.00.01.0
OKAMCPFK_1321.00.01.0
OKAMCPFK_1330.01.00.0
OKAMCPFK_1340.01.00.0
OKAMCPFK_1351.00.01.0
OKAMCPFK_1360.01.00.0
OKAMCPFK_1370.01.00.0
OKAMCPFK_1380.01.00.0
OKAMCPFK_1390.01.00.0
OKAMCPFK_1401.00.01.0
OKAMCPFK_1411.00.01.0
OKAMCPFK_1421.00.01.0
OKAMCPFK_1430.01.00.0
OKAMCPFK_1441.00.01.0
OKAMCPFK_1450.01.00.0
OKAMCPFK_1461.00.01.0
OKAMCPFK_1470.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
OKAMCPFK_351516031559FalseSiphoviridaeVOG4564,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements