Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0011.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
JGCIKFAG_4740895669GroEL0.0folding of newly synthesized proteins, preventing misfolding and aggregation87.4896.70BAA04222

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
JGCIKFAG_10.01.00.0
JGCIKFAG_20.01.00.0
JGCIKFAG_30.01.00.0
JGCIKFAG_40.01.00.0
JGCIKFAG_50.01.00.0
JGCIKFAG_60.01.00.0
JGCIKFAG_70.01.00.0
JGCIKFAG_80.01.00.0
JGCIKFAG_90.01.00.0
JGCIKFAG_100.01.00.0
JGCIKFAG_110.01.00.0
JGCIKFAG_120.01.00.0
JGCIKFAG_130.01.00.0
JGCIKFAG_140.01.00.0
JGCIKFAG_150.01.00.0
JGCIKFAG_160.01.00.0
JGCIKFAG_170.01.00.0
JGCIKFAG_180.01.00.0
JGCIKFAG_190.01.00.0
JGCIKFAG_200.01.00.0
JGCIKFAG_210.01.00.0
JGCIKFAG_220.01.00.0
JGCIKFAG_231.00.01.0
JGCIKFAG_240.01.00.0
JGCIKFAG_250.01.00.0
JGCIKFAG_260.01.00.0
JGCIKFAG_270.01.00.0
JGCIKFAG_280.01.00.0
JGCIKFAG_290.01.00.0
JGCIKFAG_300.01.00.0
JGCIKFAG_310.01.00.0
JGCIKFAG_320.01.00.0
JGCIKFAG_330.01.00.0
JGCIKFAG_340.01.00.0
JGCIKFAG_350.01.00.0
JGCIKFAG_360.01.00.0
JGCIKFAG_370.01.00.0
JGCIKFAG_380.01.00.0
JGCIKFAG_390.01.00.0
JGCIKFAG_400.01.00.0
JGCIKFAG_410.01.00.0
JGCIKFAG_420.01.00.0
JGCIKFAG_430.01.00.0
JGCIKFAG_440.01.00.0
JGCIKFAG_450.01.00.0
JGCIKFAG_460.01.00.0
JGCIKFAG_470.01.00.0
JGCIKFAG_480.01.00.0
JGCIKFAG_490.01.00.0
JGCIKFAG_500.01.00.0
JGCIKFAG_510.01.00.0
JGCIKFAG_520.01.00.0
JGCIKFAG_530.01.00.0
JGCIKFAG_541.00.01.0
JGCIKFAG_550.01.00.0
JGCIKFAG_560.01.00.0
JGCIKFAG_570.01.00.0
JGCIKFAG_580.01.00.0
JGCIKFAG_590.01.00.0
JGCIKFAG_600.01.00.0
JGCIKFAG_610.01.00.0
JGCIKFAG_620.01.00.0
JGCIKFAG_630.01.00.0
JGCIKFAG_640.01.00.0
JGCIKFAG_650.01.00.0
JGCIKFAG_660.01.00.0
JGCIKFAG_670.01.00.0
JGCIKFAG_680.01.00.0
JGCIKFAG_690.01.00.0
JGCIKFAG_700.01.00.0
JGCIKFAG_710.01.00.0
JGCIKFAG_720.01.00.0
JGCIKFAG_730.01.00.0
JGCIKFAG_740.01.00.0
JGCIKFAG_750.01.00.0
JGCIKFAG_760.01.00.0
JGCIKFAG_770.01.00.0
JGCIKFAG_780.01.00.0
JGCIKFAG_790.01.00.0
JGCIKFAG_800.01.00.0
JGCIKFAG_810.01.00.0
JGCIKFAG_820.01.00.0
JGCIKFAG_830.01.00.0
JGCIKFAG_840.01.00.0
JGCIKFAG_850.01.00.0
JGCIKFAG_861.00.01.0
JGCIKFAG_871.00.01.0
JGCIKFAG_880.01.00.0
JGCIKFAG_890.01.00.0
JGCIKFAG_900.01.00.0
JGCIKFAG_910.01.00.0
JGCIKFAG_920.01.00.0
JGCIKFAG_930.01.00.0
JGCIKFAG_940.01.00.0
JGCIKFAG_950.01.00.0
JGCIKFAG_960.01.00.0
JGCIKFAG_970.01.00.0
JGCIKFAG_980.01.00.0
JGCIKFAG_991.00.01.0
JGCIKFAG_1000.01.00.0
JGCIKFAG_1010.01.00.0
JGCIKFAG_1020.01.00.0
JGCIKFAG_1030.01.00.0
JGCIKFAG_1040.01.00.0
JGCIKFAG_1050.01.00.0
JGCIKFAG_1060.01.00.0
JGCIKFAG_1070.01.00.0
JGCIKFAG_1080.01.00.0
JGCIKFAG_1090.01.00.0
JGCIKFAG_1100.01.00.0
JGCIKFAG_1110.01.00.0
JGCIKFAG_1120.01.00.0
JGCIKFAG_1130.01.00.0
JGCIKFAG_1140.01.00.0
JGCIKFAG_1150.01.00.0
JGCIKFAG_1160.01.00.0
JGCIKFAG_1171.00.01.0
JGCIKFAG_1180.01.00.0
JGCIKFAG_1190.01.00.0
JGCIKFAG_1200.01.00.0
JGCIKFAG_1210.01.00.0
JGCIKFAG_1220.01.00.0
JGCIKFAG_1231.00.01.0
JGCIKFAG_1240.01.00.0
JGCIKFAG_1250.01.00.0
JGCIKFAG_1260.01.00.0
JGCIKFAG_1271.00.01.0
JGCIKFAG_1280.01.00.0
JGCIKFAG_1290.01.00.0
JGCIKFAG_1300.01.00.0
JGCIKFAG_1311.00.01.0
JGCIKFAG_1321.00.01.0
JGCIKFAG_1330.01.00.0
JGCIKFAG_1341.00.01.0
JGCIKFAG_1350.01.00.0
JGCIKFAG_1360.01.00.0
JGCIKFAG_1370.01.00.0
JGCIKFAG_1381.00.01.0
JGCIKFAG_1390.01.00.0
JGCIKFAG_1401.00.01.0
JGCIKFAG_1410.01.00.0
JGCIKFAG_1420.01.00.0
JGCIKFAG_1430.01.00.0
JGCIKFAG_1441.00.01.0
JGCIKFAG_1450.01.00.0
JGCIKFAG_1460.01.00.0
JGCIKFAG_1470.01.00.0
JGCIKFAG_1481.00.01.0
JGCIKFAG_1490.01.00.0
JGCIKFAG_1500.01.00.0
JGCIKFAG_1510.01.00.0
JGCIKFAG_1520.01.00.0
JGCIKFAG_1531.00.01.0
JGCIKFAG_1540.01.00.0
JGCIKFAG_1550.01.00.0
JGCIKFAG_1560.01.00.0
JGCIKFAG_1570.01.00.0
JGCIKFAG_1580.01.00.0
JGCIKFAG_1590.01.00.0
JGCIKFAG_1600.01.00.0
JGCIKFAG_1610.01.00.0
JGCIKFAG_1620.01.00.0
JGCIKFAG_1630.01.00.0
JGCIKFAG_1640.01.00.0
JGCIKFAG_1650.01.00.0
JGCIKFAG_1660.01.00.0
JGCIKFAG_1670.01.00.0
JGCIKFAG_1680.01.00.0
JGCIKFAG_1690.01.00.0
JGCIKFAG_1701.00.01.0
JGCIKFAG_1711.00.01.0
JGCIKFAG_1721.00.01.0
JGCIKFAG_1730.01.00.0
JGCIKFAG_1741.00.01.0
JGCIKFAG_1751.00.01.0
JGCIKFAG_1761.00.01.0
JGCIKFAG_1771.00.01.0
JGCIKFAG_1780.01.00.0
JGCIKFAG_1791.00.01.0
JGCIKFAG_1801.00.01.0
JGCIKFAG_1810.01.00.0
JGCIKFAG_1820.01.00.0
JGCIKFAG_1831.00.01.0
JGCIKFAG_1840.01.00.0
JGCIKFAG_1850.01.00.0
JGCIKFAG_1861.00.01.0
JGCIKFAG_1871.00.01.0
JGCIKFAG_1880.01.00.0
JGCIKFAG_1891.00.01.0
JGCIKFAG_1900.01.00.0
JGCIKFAG_1910.01.00.0
JGCIKFAG_1920.01.00.0
JGCIKFAG_1931.00.01.0
JGCIKFAG_1941.00.01.0
JGCIKFAG_1950.01.00.0
JGCIKFAG_1960.01.00.0
JGCIKFAG_1970.01.00.0
JGCIKFAG_1981.00.01.0
JGCIKFAG_1990.01.00.0
JGCIKFAG_2000.01.00.0
JGCIKFAG_2010.01.00.0
JGCIKFAG_2021.00.01.0
JGCIKFAG_2030.01.00.0
JGCIKFAG_2040.01.00.0
JGCIKFAG_2051.00.01.0
JGCIKFAG_2060.01.00.0
JGCIKFAG_2071.00.01.0
JGCIKFAG_2080.01.00.0
JGCIKFAG_2091.00.01.0
JGCIKFAG_2100.01.00.0
JGCIKFAG_2110.01.00.0
JGCIKFAG_2120.01.00.0
JGCIKFAG_2130.01.00.0
JGCIKFAG_2141.00.01.0
JGCIKFAG_2150.01.00.0
JGCIKFAG_2160.01.00.0
JGCIKFAG_2171.00.01.0
JGCIKFAG_2181.00.01.0
JGCIKFAG_2190.01.00.0
JGCIKFAG_2200.01.00.0
JGCIKFAG_2210.01.00.0
JGCIKFAG_2221.00.01.0
JGCIKFAG_2230.01.00.0
JGCIKFAG_2240.01.00.0
JGCIKFAG_2251.00.01.0
JGCIKFAG_2260.01.00.0
JGCIKFAG_2270.01.00.0
JGCIKFAG_2280.01.00.0
JGCIKFAG_2290.01.00.0
JGCIKFAG_2300.01.00.0
JGCIKFAG_2310.01.00.0
JGCIKFAG_2320.01.00.0
JGCIKFAG_2330.01.00.0
JGCIKFAG_2340.01.00.0
JGCIKFAG_2361.00.01.0
JGCIKFAG_2370.01.00.0
JGCIKFAG_2380.01.00.0
JGCIKFAG_2391.00.01.0
JGCIKFAG_2400.01.00.0
JGCIKFAG_2410.01.00.0
JGCIKFAG_2420.01.00.0
JGCIKFAG_2431.00.01.0
JGCIKFAG_2440.01.00.0
JGCIKFAG_2450.01.00.0
JGCIKFAG_2461.00.01.0
JGCIKFAG_2471.00.01.0
JGCIKFAG_2480.01.00.0
JGCIKFAG_2490.01.00.0
JGCIKFAG_2501.00.01.0
JGCIKFAG_2511.00.01.0
JGCIKFAG_2520.01.00.0
JGCIKFAG_2530.01.00.0
JGCIKFAG_2540.01.00.0
JGCIKFAG_2550.01.00.0
JGCIKFAG_2560.01.00.0
JGCIKFAG_2571.00.01.0
JGCIKFAG_2581.00.01.0
JGCIKFAG_2590.01.00.0
JGCIKFAG_2600.01.00.0
JGCIKFAG_2611.00.01.0
JGCIKFAG_2620.01.00.0
JGCIKFAG_2631.00.01.0
JGCIKFAG_2640.01.00.0
JGCIKFAG_2651.00.01.0
JGCIKFAG_2660.01.00.0
JGCIKFAG_2670.01.00.0
JGCIKFAG_2681.00.01.0
JGCIKFAG_2691.00.01.0
JGCIKFAG_2700.01.00.0
JGCIKFAG_2711.00.01.0
JGCIKFAG_2720.01.00.0
JGCIKFAG_2731.00.01.0
JGCIKFAG_2740.01.00.0
JGCIKFAG_2750.01.00.0
JGCIKFAG_2760.01.00.0
JGCIKFAG_2770.01.00.0
JGCIKFAG_2780.01.00.0
JGCIKFAG_2790.01.00.0
JGCIKFAG_2800.01.00.0
JGCIKFAG_2810.01.00.0
JGCIKFAG_2820.01.00.0
JGCIKFAG_2830.01.00.0
JGCIKFAG_2840.01.00.0
JGCIKFAG_2850.01.00.0
JGCIKFAG_2860.01.00.0
JGCIKFAG_2881.00.01.0
JGCIKFAG_2891.00.01.0
JGCIKFAG_2900.01.00.0
JGCIKFAG_2910.01.00.0
JGCIKFAG_2920.01.00.0
JGCIKFAG_2930.01.00.0
JGCIKFAG_2940.01.00.0
JGCIKFAG_2951.00.01.0
JGCIKFAG_2961.00.01.0
JGCIKFAG_2971.00.01.0
JGCIKFAG_2980.01.00.0
JGCIKFAG_2991.00.01.0
JGCIKFAG_3000.01.00.0
JGCIKFAG_3011.00.01.0
JGCIKFAG_3021.00.01.0
JGCIKFAG_3031.00.01.0
JGCIKFAG_3040.01.00.0
JGCIKFAG_3050.01.00.0
JGCIKFAG_3060.01.00.0
JGCIKFAG_3071.00.01.0
JGCIKFAG_3080.01.00.0
JGCIKFAG_3090.01.00.0
JGCIKFAG_3101.00.01.0
JGCIKFAG_3110.01.00.0
JGCIKFAG_3120.01.00.0
JGCIKFAG_3131.00.01.0
JGCIKFAG_3141.00.01.0
JGCIKFAG_3150.01.00.0
JGCIKFAG_3161.00.01.0
JGCIKFAG_3171.00.01.0
JGCIKFAG_3181.00.01.0
JGCIKFAG_3191.00.01.0
JGCIKFAG_3200.01.00.0
JGCIKFAG_3211.00.01.0
JGCIKFAG_3221.00.01.0
JGCIKFAG_3231.00.01.0
JGCIKFAG_3241.00.01.0
JGCIKFAG_3251.00.01.0
JGCIKFAG_3260.01.00.0
JGCIKFAG_3271.00.01.0
JGCIKFAG_3280.01.00.0
JGCIKFAG_3291.00.01.0
JGCIKFAG_3301.00.01.0
JGCIKFAG_3310.01.00.0
JGCIKFAG_3320.01.00.0
JGCIKFAG_3331.00.01.0
JGCIKFAG_3341.00.01.0
JGCIKFAG_3350.01.00.0
JGCIKFAG_3360.01.00.0
JGCIKFAG_3370.01.00.0
JGCIKFAG_3380.01.00.0
JGCIKFAG_3391.00.01.0
JGCIKFAG_3400.01.00.0
JGCIKFAG_3410.01.00.0
JGCIKFAG_3421.00.01.0
JGCIKFAG_3431.00.01.0
JGCIKFAG_3441.00.01.0
JGCIKFAG_3450.01.00.0
JGCIKFAG_3461.00.01.0
JGCIKFAG_3470.01.00.0
JGCIKFAG_3481.00.01.0
JGCIKFAG_3491.00.01.0
JGCIKFAG_3500.01.00.0
JGCIKFAG_3511.00.01.0
JGCIKFAG_3520.01.00.0
JGCIKFAG_3530.01.00.0
JGCIKFAG_3541.00.01.0
JGCIKFAG_3551.00.01.0
JGCIKFAG_3561.00.01.0
JGCIKFAG_3571.00.01.0
JGCIKFAG_3581.00.01.0
JGCIKFAG_3591.00.01.0
JGCIKFAG_3601.00.01.0
JGCIKFAG_3611.00.01.0
JGCIKFAG_3620.01.00.0
JGCIKFAG_3631.00.01.0
JGCIKFAG_3640.01.00.0
JGCIKFAG_3650.01.00.0
JGCIKFAG_3660.01.00.0
JGCIKFAG_3670.01.00.0
JGCIKFAG_3681.00.01.0
JGCIKFAG_3691.00.01.0
JGCIKFAG_3701.00.01.0
JGCIKFAG_3711.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements