Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
1001.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
ICGLFAJH_263882939719CblA-1ARO:3002999CblA-197.64100.00GQ343019.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
ICGLFAJH_263882939716cblACblA family class A beta-lactamaseBLASTX97.64100.00WP_005827792.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
ICGLFAJH_10.01.00.0
ICGLFAJH_20.01.00.0
ICGLFAJH_30.01.00.0
ICGLFAJH_40.01.00.0
ICGLFAJH_50.01.00.0
ICGLFAJH_60.01.00.0
ICGLFAJH_70.01.00.0
ICGLFAJH_80.01.00.0
ICGLFAJH_90.01.00.0
ICGLFAJH_100.01.00.0
ICGLFAJH_110.01.00.0
ICGLFAJH_120.01.00.0
ICGLFAJH_130.01.00.0
ICGLFAJH_140.01.00.0
ICGLFAJH_150.01.00.0
ICGLFAJH_160.01.00.0
ICGLFAJH_170.01.00.0
ICGLFAJH_180.01.00.0
ICGLFAJH_190.01.00.0
ICGLFAJH_200.01.00.0
ICGLFAJH_210.01.00.0
ICGLFAJH_220.01.00.0
ICGLFAJH_230.01.00.0
ICGLFAJH_240.01.00.0
ICGLFAJH_250.01.00.0
ICGLFAJH_260.01.00.0
ICGLFAJH_270.01.00.0
ICGLFAJH_280.01.00.0
ICGLFAJH_290.01.00.0
ICGLFAJH_300.01.00.0
ICGLFAJH_310.01.00.0
ICGLFAJH_320.01.00.0
ICGLFAJH_330.01.00.0
ICGLFAJH_340.01.00.0
ICGLFAJH_350.01.00.0
ICGLFAJH_360.01.00.0
ICGLFAJH_370.01.00.0
ICGLFAJH_380.01.00.0
ICGLFAJH_390.01.00.0
ICGLFAJH_400.01.00.0
ICGLFAJH_410.01.00.0
ICGLFAJH_420.01.00.0
ICGLFAJH_430.01.00.0
ICGLFAJH_441.00.01.0
ICGLFAJH_450.01.00.0
ICGLFAJH_460.01.00.0
ICGLFAJH_470.01.00.0
ICGLFAJH_480.01.00.0
ICGLFAJH_490.01.00.0
ICGLFAJH_500.01.00.0
ICGLFAJH_510.01.00.0
ICGLFAJH_520.01.00.0
ICGLFAJH_530.01.00.0
ICGLFAJH_540.01.00.0
ICGLFAJH_550.01.00.0
ICGLFAJH_560.01.00.0
ICGLFAJH_570.01.00.0
ICGLFAJH_580.01.00.0
ICGLFAJH_590.01.00.0
ICGLFAJH_600.01.00.0
ICGLFAJH_610.01.00.0
ICGLFAJH_620.01.00.0
ICGLFAJH_630.01.00.0
ICGLFAJH_640.01.00.0
ICGLFAJH_650.01.00.0
ICGLFAJH_661.00.01.0
ICGLFAJH_670.01.00.0
ICGLFAJH_680.01.00.0
ICGLFAJH_691.00.01.0
ICGLFAJH_700.01.00.0
ICGLFAJH_710.01.00.0
ICGLFAJH_720.01.00.0
ICGLFAJH_730.01.00.0
ICGLFAJH_740.01.00.0
ICGLFAJH_750.01.00.0
ICGLFAJH_760.01.00.0
ICGLFAJH_770.01.00.0
ICGLFAJH_780.01.00.0
ICGLFAJH_790.01.00.0
ICGLFAJH_800.01.00.0
ICGLFAJH_810.01.00.0
ICGLFAJH_820.01.00.0
ICGLFAJH_830.01.00.0
ICGLFAJH_840.01.00.0
ICGLFAJH_850.01.00.0
ICGLFAJH_860.01.00.0
ICGLFAJH_870.01.00.0
ICGLFAJH_881.00.01.0
ICGLFAJH_890.01.00.0
ICGLFAJH_900.01.00.0
ICGLFAJH_910.01.00.0
ICGLFAJH_920.01.00.0
ICGLFAJH_930.01.00.0
ICGLFAJH_940.01.00.0
ICGLFAJH_950.01.00.0
ICGLFAJH_960.01.00.0
ICGLFAJH_970.01.00.0
ICGLFAJH_980.01.00.0
ICGLFAJH_990.01.00.0
ICGLFAJH_1000.01.00.0
ICGLFAJH_1010.01.00.0
ICGLFAJH_1020.01.00.0
ICGLFAJH_1030.01.00.0
ICGLFAJH_1040.01.00.0
ICGLFAJH_1050.01.00.0
ICGLFAJH_1061.00.01.0
ICGLFAJH_1071.00.01.0
ICGLFAJH_1080.01.00.0
ICGLFAJH_1090.01.00.0
ICGLFAJH_1100.01.00.0
ICGLFAJH_1110.01.00.0
ICGLFAJH_1120.01.00.0
ICGLFAJH_1130.01.00.0
ICGLFAJH_1140.01.00.0
ICGLFAJH_1150.01.00.0
ICGLFAJH_1160.01.00.0
ICGLFAJH_1171.00.01.0
ICGLFAJH_1180.01.00.0
ICGLFAJH_1191.00.01.0
ICGLFAJH_1201.00.01.0
ICGLFAJH_1210.01.00.0
ICGLFAJH_1221.00.01.0
ICGLFAJH_1230.01.00.0
ICGLFAJH_1241.00.01.0
ICGLFAJH_1250.01.00.0
ICGLFAJH_1260.01.00.0
ICGLFAJH_1270.01.00.0
ICGLFAJH_1280.01.00.0
ICGLFAJH_1290.01.00.0
ICGLFAJH_1300.01.00.0
ICGLFAJH_1310.01.00.0
ICGLFAJH_1320.01.00.0
ICGLFAJH_1330.01.00.0
ICGLFAJH_1341.00.01.0
ICGLFAJH_1351.00.01.0
ICGLFAJH_1360.01.00.0
ICGLFAJH_1370.01.00.0
ICGLFAJH_1380.01.00.0
ICGLFAJH_1391.00.01.0
ICGLFAJH_1400.01.00.0
ICGLFAJH_1411.00.01.0
ICGLFAJH_1420.01.00.0
ICGLFAJH_1431.00.01.0
ICGLFAJH_1440.01.00.0
ICGLFAJH_1451.00.01.0
ICGLFAJH_1460.01.00.0
ICGLFAJH_1471.00.01.0
ICGLFAJH_1480.01.00.0
ICGLFAJH_1490.01.00.0
ICGLFAJH_1500.01.00.0
ICGLFAJH_1510.01.00.0
ICGLFAJH_1520.01.00.0
ICGLFAJH_1530.01.00.0
ICGLFAJH_1540.01.00.0
ICGLFAJH_1550.01.00.0
ICGLFAJH_1561.00.01.0
ICGLFAJH_1570.01.00.0
ICGLFAJH_1581.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements