Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
1011.41

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
PAKHLGPN_282368624651CfxA2ARO:3003002CfxA2100.00100.00AF118110.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
PAKHLGPN_282368624651cfxA3Ampicillin99.90100.00AF472622
PAKHLGPN_282368624651cfxA4Unknown Beta-lactam99.90100.00AY769933
PAKHLGPN_282368624651cfxA5Unknown Beta-lactam99.90100.00AY769934
PAKHLGPN_282368624651cfxACefoxitin, Ampicillin99.90100.00U38243

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
PAKHLGPN_282368924651cfxACfxA family broad-spectrum class A beta-lactamaseEXACTX100.00100.00WP_004339683.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
PAKHLGPN_99113769832GroEL0.0folding of newly synthesized proteins, preventing misfolding and aggregation87.1894.50BAA04222

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
PAKHLGPN_10.01.00.0
PAKHLGPN_20.01.00.0
PAKHLGPN_30.01.00.0
PAKHLGPN_40.01.00.0
PAKHLGPN_50.01.00.0
PAKHLGPN_60.01.00.0
PAKHLGPN_70.01.00.0
PAKHLGPN_80.01.00.0
PAKHLGPN_90.01.00.0
PAKHLGPN_100.01.00.0
PAKHLGPN_110.01.00.0
PAKHLGPN_120.01.00.0
PAKHLGPN_130.01.00.0
PAKHLGPN_140.01.00.0
PAKHLGPN_150.01.00.0
PAKHLGPN_160.01.00.0
PAKHLGPN_170.01.00.0
PAKHLGPN_180.01.00.0
PAKHLGPN_190.01.00.0
PAKHLGPN_200.01.00.0
PAKHLGPN_210.01.00.0
PAKHLGPN_220.01.00.0
PAKHLGPN_230.01.00.0
PAKHLGPN_240.01.00.0
PAKHLGPN_250.01.00.0
PAKHLGPN_260.01.00.0
PAKHLGPN_270.01.00.0
PAKHLGPN_280.01.00.0
PAKHLGPN_290.01.00.0
PAKHLGPN_300.01.00.0
PAKHLGPN_310.01.00.0
PAKHLGPN_320.01.00.0
PAKHLGPN_330.01.00.0
PAKHLGPN_341.00.01.0
PAKHLGPN_350.01.00.0
PAKHLGPN_360.01.00.0
PAKHLGPN_370.01.00.0
PAKHLGPN_380.01.00.0
PAKHLGPN_391.00.01.0
PAKHLGPN_401.00.01.0
PAKHLGPN_410.01.00.0
PAKHLGPN_420.01.00.0
PAKHLGPN_430.01.00.0
PAKHLGPN_440.01.00.0
PAKHLGPN_450.01.00.0
PAKHLGPN_460.01.00.0
PAKHLGPN_470.01.00.0
PAKHLGPN_480.01.00.0
PAKHLGPN_490.01.00.0
PAKHLGPN_500.01.00.0
PAKHLGPN_510.01.00.0
PAKHLGPN_520.01.00.0
PAKHLGPN_530.01.00.0
PAKHLGPN_540.01.00.0
PAKHLGPN_550.01.00.0
PAKHLGPN_561.00.01.0
PAKHLGPN_570.01.00.0
PAKHLGPN_580.01.00.0
PAKHLGPN_591.00.01.0
PAKHLGPN_600.01.00.0
PAKHLGPN_610.01.00.0
PAKHLGPN_620.01.00.0
PAKHLGPN_631.00.01.0
PAKHLGPN_640.01.00.0
PAKHLGPN_650.01.00.0
PAKHLGPN_660.01.00.0
PAKHLGPN_670.01.00.0
PAKHLGPN_680.01.00.0
PAKHLGPN_690.01.00.0
PAKHLGPN_700.01.00.0
PAKHLGPN_710.01.00.0
PAKHLGPN_720.01.00.0
PAKHLGPN_731.00.01.0
PAKHLGPN_741.00.01.0
PAKHLGPN_751.00.01.0
PAKHLGPN_760.01.00.0
PAKHLGPN_770.01.00.0
PAKHLGPN_780.01.00.0
PAKHLGPN_790.01.00.0
PAKHLGPN_800.01.00.0
PAKHLGPN_811.00.01.0
PAKHLGPN_820.01.00.0
PAKHLGPN_830.01.00.0
PAKHLGPN_840.01.00.0
PAKHLGPN_850.01.00.0
PAKHLGPN_860.01.00.0
PAKHLGPN_871.00.01.0
PAKHLGPN_881.00.01.0
PAKHLGPN_891.00.01.0
PAKHLGPN_900.01.00.0
PAKHLGPN_910.01.00.0
PAKHLGPN_920.01.00.0
PAKHLGPN_930.01.00.0
PAKHLGPN_940.01.00.0
PAKHLGPN_950.01.00.0
PAKHLGPN_960.01.00.0
PAKHLGPN_970.01.00.0
PAKHLGPN_980.01.00.0
PAKHLGPN_990.01.00.0
PAKHLGPN_1000.01.00.0
PAKHLGPN_1010.01.00.0
PAKHLGPN_1021.00.01.0
PAKHLGPN_1030.01.00.0
PAKHLGPN_1040.01.00.0
PAKHLGPN_1050.01.00.0
PAKHLGPN_1060.01.00.0
PAKHLGPN_1070.01.00.0
PAKHLGPN_1081.00.01.0
PAKHLGPN_1090.01.00.0
PAKHLGPN_1100.01.00.0
PAKHLGPN_1110.01.00.0
PAKHLGPN_1120.01.00.0
PAKHLGPN_1130.01.00.0
PAKHLGPN_1140.01.00.0
PAKHLGPN_1150.01.00.0
PAKHLGPN_1160.01.00.0
PAKHLGPN_1170.01.00.0
PAKHLGPN_1181.00.01.0
PAKHLGPN_1190.01.00.0
PAKHLGPN_1200.01.00.0
PAKHLGPN_1210.01.00.0
PAKHLGPN_1220.01.00.0
PAKHLGPN_1230.01.00.0
PAKHLGPN_1240.01.00.0
PAKHLGPN_1250.01.00.0
PAKHLGPN_1260.01.00.0
PAKHLGPN_1271.00.01.0
PAKHLGPN_1281.00.01.0
PAKHLGPN_1291.00.01.0
PAKHLGPN_1300.01.00.0
PAKHLGPN_1310.01.00.0
PAKHLGPN_1321.00.01.0
PAKHLGPN_1331.00.01.0
PAKHLGPN_1340.01.00.0
PAKHLGPN_1351.00.01.0
PAKHLGPN_1361.00.01.0
PAKHLGPN_1370.01.00.0
PAKHLGPN_1380.01.00.0
PAKHLGPN_1390.01.00.0
PAKHLGPN_1400.01.00.0
PAKHLGPN_1411.00.01.0
PAKHLGPN_1421.00.01.0
PAKHLGPN_1430.01.00.0
PAKHLGPN_1440.01.00.0
PAKHLGPN_1450.01.00.0
PAKHLGPN_1460.01.00.0
PAKHLGPN_1470.01.00.0
PAKHLGPN_1480.01.00.0
PAKHLGPN_1490.01.00.0
PAKHLGPN_1500.01.00.0
PAKHLGPN_1511.00.01.0
PAKHLGPN_1520.01.00.0
PAKHLGPN_1530.01.00.0
PAKHLGPN_1540.01.00.0
PAKHLGPN_1550.01.00.0
PAKHLGPN_1560.01.00.0
PAKHLGPN_1570.01.00.0
PAKHLGPN_1580.01.00.0
PAKHLGPN_1590.01.00.0
PAKHLGPN_1600.01.00.0
PAKHLGPN_1610.01.00.0
PAKHLGPN_1620.01.00.0
PAKHLGPN_1630.01.00.0
PAKHLGPN_1641.00.01.0
PAKHLGPN_1650.01.00.0
PAKHLGPN_1661.00.01.0
PAKHLGPN_1670.01.00.0
PAKHLGPN_1680.01.00.0
PAKHLGPN_1690.01.00.0
PAKHLGPN_1700.01.00.0
PAKHLGPN_1710.01.00.0
PAKHLGPN_1720.01.00.0
PAKHLGPN_1730.01.00.0
PAKHLGPN_1740.01.00.0
PAKHLGPN_1751.00.01.0
PAKHLGPN_1761.00.01.0
PAKHLGPN_1770.01.00.0
PAKHLGPN_1780.01.00.0
PAKHLGPN_1790.01.00.0
PAKHLGPN_1801.00.01.0
PAKHLGPN_1810.01.00.0
PAKHLGPN_1820.01.00.0
PAKHLGPN_1831.00.01.0
PAKHLGPN_1841.00.01.0
PAKHLGPN_1850.01.00.0
PAKHLGPN_1860.01.00.0
PAKHLGPN_1870.01.00.0
PAKHLGPN_1880.01.00.0
PAKHLGPN_1890.01.00.0
PAKHLGPN_1900.01.00.0
PAKHLGPN_1910.01.00.0
PAKHLGPN_1920.01.00.0
PAKHLGPN_1930.01.00.0
PAKHLGPN_1940.01.00.0
PAKHLGPN_1950.01.00.0
PAKHLGPN_1960.01.00.0
PAKHLGPN_1970.01.00.0
PAKHLGPN_1980.01.00.0
PAKHLGPN_1990.01.00.0
PAKHLGPN_2000.01.00.0
PAKHLGPN_2010.01.00.0
PAKHLGPN_2020.01.00.0
PAKHLGPN_2030.01.00.0
PAKHLGPN_2041.00.01.0
PAKHLGPN_2050.01.00.0
PAKHLGPN_2060.01.00.0
PAKHLGPN_2070.01.00.0
PAKHLGPN_2080.01.00.0
PAKHLGPN_2090.01.00.0
PAKHLGPN_2100.01.00.0
PAKHLGPN_2110.01.00.0
PAKHLGPN_2121.00.01.0
PAKHLGPN_2130.01.00.0
PAKHLGPN_2140.01.00.0
PAKHLGPN_2150.01.00.0
PAKHLGPN_2160.01.00.0
PAKHLGPN_2170.01.00.0
PAKHLGPN_2181.00.01.0
PAKHLGPN_2190.01.00.0
PAKHLGPN_2200.01.00.0
PAKHLGPN_2210.01.00.0
PAKHLGPN_2220.01.00.0
PAKHLGPN_2230.01.00.0
PAKHLGPN_2240.01.00.0
PAKHLGPN_2250.01.00.0
PAKHLGPN_2261.00.01.0
PAKHLGPN_2270.01.00.0
PAKHLGPN_2280.01.00.0
PAKHLGPN_2290.01.00.0
PAKHLGPN_2300.01.00.0
PAKHLGPN_2310.01.00.0
PAKHLGPN_2320.01.00.0
PAKHLGPN_2330.01.00.0
PAKHLGPN_2341.00.01.0
PAKHLGPN_2350.01.00.0
PAKHLGPN_2361.00.01.0
PAKHLGPN_2371.00.01.0
PAKHLGPN_2380.01.00.0
PAKHLGPN_2391.00.01.0
PAKHLGPN_2401.00.01.0
PAKHLGPN_2410.01.00.0
PAKHLGPN_2420.01.00.0
PAKHLGPN_2430.01.00.0
PAKHLGPN_2440.01.00.0
PAKHLGPN_2451.00.01.0
PAKHLGPN_2460.01.00.0
PAKHLGPN_2470.01.00.0
PAKHLGPN_2480.01.00.0
PAKHLGPN_2491.00.01.0
PAKHLGPN_2500.01.00.0
PAKHLGPN_2510.01.00.0
PAKHLGPN_2521.00.01.0
PAKHLGPN_2530.01.00.0
PAKHLGPN_2540.01.00.0
PAKHLGPN_2550.01.00.0
PAKHLGPN_2560.01.00.0
PAKHLGPN_2570.01.00.0
PAKHLGPN_2580.01.00.0
PAKHLGPN_2590.01.00.0
PAKHLGPN_2600.01.00.0
PAKHLGPN_2610.01.00.0
PAKHLGPN_2620.01.00.0
PAKHLGPN_2631.00.01.0
PAKHLGPN_2641.00.01.0
PAKHLGPN_2650.01.00.0
PAKHLGPN_2661.00.01.0
PAKHLGPN_2670.01.00.0
PAKHLGPN_2680.01.00.0
PAKHLGPN_2690.01.00.0
PAKHLGPN_2701.00.01.0
PAKHLGPN_2710.01.00.0
PAKHLGPN_2721.00.01.0
PAKHLGPN_2730.01.00.0
PAKHLGPN_2740.01.00.0
PAKHLGPN_2750.01.00.0
PAKHLGPN_2760.01.00.0
PAKHLGPN_2770.01.00.0
PAKHLGPN_2781.00.01.0
PAKHLGPN_2790.01.00.0
PAKHLGPN_2801.00.01.0
PAKHLGPN_2810.01.00.0
PAKHLGPN_2821.00.01.0
PAKHLGPN_2830.01.00.0
PAKHLGPN_2841.00.01.0
PAKHLGPN_2850.01.00.0
PAKHLGPN_2860.01.00.0
PAKHLGPN_2870.01.00.0
PAKHLGPN_2880.01.00.0
PAKHLGPN_2890.01.00.0
PAKHLGPN_2901.00.01.0
PAKHLGPN_2910.01.00.0
PAKHLGPN_2920.01.00.0
PAKHLGPN_2931.00.01.0
PAKHLGPN_2940.01.00.0
PAKHLGPN_2950.01.00.0
PAKHLGPN_2960.01.00.0
PAKHLGPN_2971.00.01.0
PAKHLGPN_2981.00.01.0
PAKHLGPN_2991.00.01.0
PAKHLGPN_3001.00.01.0
PAKHLGPN_3010.01.00.0
PAKHLGPN_3021.00.01.0
PAKHLGPN_3031.00.01.0
PAKHLGPN_3041.00.01.0
PAKHLGPN_3050.01.00.0
PAKHLGPN_3060.01.00.0
PAKHLGPN_3070.01.00.0
PAKHLGPN_3081.00.01.0
PAKHLGPN_3091.00.01.0
PAKHLGPN_3100.01.00.0
PAKHLGPN_3110.01.00.0
PAKHLGPN_3120.01.00.0
PAKHLGPN_3130.01.00.0
PAKHLGPN_3140.01.00.0
PAKHLGPN_3150.01.00.0
PAKHLGPN_3160.01.00.0
PAKHLGPN_3170.01.00.0
PAKHLGPN_3180.01.00.0
PAKHLGPN_3190.01.00.0
PAKHLGPN_3201.00.01.0
PAKHLGPN_3210.01.00.0
PAKHLGPN_3220.01.00.0
PAKHLGPN_3231.00.01.0
PAKHLGPN_3241.00.01.0
PAKHLGPN_3250.01.00.0
PAKHLGPN_3260.01.00.0
PAKHLGPN_3271.00.01.0
PAKHLGPN_3281.00.01.0
PAKHLGPN_3290.01.00.0
PAKHLGPN_3301.00.01.0
PAKHLGPN_3311.00.01.0
PAKHLGPN_3320.01.00.0
PAKHLGPN_3331.00.01.0
PAKHLGPN_3341.00.01.0
PAKHLGPN_3350.01.00.0
PAKHLGPN_3360.01.00.0
PAKHLGPN_3370.01.00.0
PAKHLGPN_3381.00.01.0
PAKHLGPN_3390.01.00.0
PAKHLGPN_3400.01.00.0
PAKHLGPN_3410.01.00.0
PAKHLGPN_3420.01.00.0
PAKHLGPN_3430.01.00.0
PAKHLGPN_3441.00.01.0
PAKHLGPN_3451.00.01.0
PAKHLGPN_3460.01.00.0
PAKHLGPN_3470.01.00.0
PAKHLGPN_3480.01.00.0
PAKHLGPN_3490.01.00.0
PAKHLGPN_3501.00.01.0
PAKHLGPN_3510.01.00.0
PAKHLGPN_3520.01.00.0
PAKHLGPN_3530.01.00.0
PAKHLGPN_3541.00.01.0
PAKHLGPN_3551.00.01.0
PAKHLGPN_3561.00.01.0
PAKHLGPN_3570.01.00.0
PAKHLGPN_3580.01.00.0
PAKHLGPN_3590.01.00.0
PAKHLGPN_3600.01.00.0
PAKHLGPN_3611.00.01.0
PAKHLGPN_3621.00.01.0
PAKHLGPN_3631.00.01.0
PAKHLGPN_3641.00.01.0
PAKHLGPN_3650.01.00.0
PAKHLGPN_3661.00.01.0
PAKHLGPN_3670.01.00.0
PAKHLGPN_3681.00.01.0
PAKHLGPN_3690.01.00.0
PAKHLGPN_3700.01.00.0
PAKHLGPN_3710.01.00.0
PAKHLGPN_3720.01.00.0
PAKHLGPN_3730.01.00.0
PAKHLGPN_3740.01.00.0
PAKHLGPN_3751.00.01.0
PAKHLGPN_3761.00.01.0
PAKHLGPN_3770.01.00.0
PAKHLGPN_3781.00.01.0
PAKHLGPN_3791.00.01.0
PAKHLGPN_3800.01.00.0
PAKHLGPN_3810.01.00.0
PAKHLGPN_3820.01.00.0
PAKHLGPN_3830.01.00.0
PAKHLGPN_3840.01.00.0
PAKHLGPN_3850.01.00.0
PAKHLGPN_3860.01.00.0
PAKHLGPN_3871.00.01.0
PAKHLGPN_3881.00.01.0
PAKHLGPN_3891.00.01.0
PAKHLGPN_3901.00.01.0
PAKHLGPN_3910.01.00.0
PAKHLGPN_3921.00.01.0
PAKHLGPN_3931.00.01.0
PAKHLGPN_3940.01.00.0
PAKHLGPN_3950.01.00.0
PAKHLGPN_3960.01.00.0
PAKHLGPN_3970.01.00.0
PAKHLGPN_3980.01.00.0
PAKHLGPN_3991.00.01.0
PAKHLGPN_4000.01.00.0
PAKHLGPN_4011.00.01.0
PAKHLGPN_4021.00.01.0
PAKHLGPN_4030.01.00.0
PAKHLGPN_4040.01.00.0
PAKHLGPN_4050.01.00.0
PAKHLGPN_4060.01.00.0
PAKHLGPN_4070.01.00.0
PAKHLGPN_4080.01.00.0
PAKHLGPN_4090.01.00.0
PAKHLGPN_4101.00.01.0
PAKHLGPN_4110.01.00.0
PAKHLGPN_4121.00.01.0
PAKHLGPN_4130.01.00.0
PAKHLGPN_4141.00.01.0
PAKHLGPN_4151.00.01.0
PAKHLGPN_4160.01.00.0
PAKHLGPN_4170.01.00.0
PAKHLGPN_4181.00.01.0
PAKHLGPN_4190.01.00.0
PAKHLGPN_4200.01.00.0
PAKHLGPN_4211.00.01.0
PAKHLGPN_4221.00.01.0
PAKHLGPN_4231.00.01.0
PAKHLGPN_4240.01.00.0
PAKHLGPN_4251.00.01.0
PAKHLGPN_4260.01.00.0
PAKHLGPN_4271.00.01.0
PAKHLGPN_4280.01.00.0
PAKHLGPN_4291.00.01.0
PAKHLGPN_4300.01.00.0
PAKHLGPN_4311.00.01.0
PAKHLGPN_4320.01.00.0
PAKHLGPN_4331.00.01.0
PAKHLGPN_4341.00.01.0
PAKHLGPN_4350.01.00.0
PAKHLGPN_4360.01.00.0
PAKHLGPN_4370.01.00.0
PAKHLGPN_4380.01.00.0
PAKHLGPN_4391.00.01.0
PAKHLGPN_4401.00.01.0
PAKHLGPN_4411.00.01.0
PAKHLGPN_4420.01.00.0
PAKHLGPN_4430.01.00.0
PAKHLGPN_4441.00.01.0
PAKHLGPN_4451.00.01.0
PAKHLGPN_4460.01.00.0
PAKHLGPN_4470.01.00.0
PAKHLGPN_4480.01.00.0
PAKHLGPN_4490.01.00.0
PAKHLGPN_4501.00.01.0
PAKHLGPN_4510.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements