Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
BACJKEAA_10.01.00.0
BACJKEAA_20.01.00.0
BACJKEAA_30.01.00.0
BACJKEAA_40.01.00.0
BACJKEAA_50.01.00.0
BACJKEAA_60.01.00.0
BACJKEAA_70.01.00.0
BACJKEAA_80.01.00.0
BACJKEAA_90.01.00.0
BACJKEAA_100.01.00.0
BACJKEAA_110.01.00.0
BACJKEAA_120.01.00.0
BACJKEAA_130.01.00.0
BACJKEAA_140.01.00.0
BACJKEAA_150.01.00.0
BACJKEAA_160.01.00.0
BACJKEAA_170.01.00.0
BACJKEAA_180.01.00.0
BACJKEAA_190.01.00.0
BACJKEAA_200.01.00.0
BACJKEAA_210.01.00.0
BACJKEAA_220.01.00.0
BACJKEAA_230.01.00.0
BACJKEAA_240.01.00.0
BACJKEAA_250.01.00.0
BACJKEAA_260.01.00.0
BACJKEAA_270.01.00.0
BACJKEAA_280.01.00.0
BACJKEAA_290.01.00.0
BACJKEAA_300.01.00.0
BACJKEAA_310.01.00.0
BACJKEAA_320.01.00.0
BACJKEAA_330.01.00.0
BACJKEAA_340.01.00.0
BACJKEAA_350.01.00.0
BACJKEAA_360.01.00.0
BACJKEAA_370.01.00.0
BACJKEAA_380.01.00.0
BACJKEAA_390.01.00.0
BACJKEAA_400.01.00.0
BACJKEAA_410.01.00.0
BACJKEAA_420.01.00.0
BACJKEAA_430.01.00.0
BACJKEAA_440.01.00.0
BACJKEAA_450.01.00.0
BACJKEAA_460.01.00.0
BACJKEAA_470.01.00.0
BACJKEAA_480.01.00.0
BACJKEAA_490.01.00.0
BACJKEAA_500.01.00.0
BACJKEAA_510.01.00.0
BACJKEAA_520.01.00.0
BACJKEAA_530.01.00.0
BACJKEAA_540.01.00.0
BACJKEAA_550.01.00.0
BACJKEAA_560.01.00.0
BACJKEAA_570.01.00.0
BACJKEAA_580.01.00.0
BACJKEAA_590.01.00.0
BACJKEAA_600.01.00.0
BACJKEAA_610.01.00.0
BACJKEAA_620.01.00.0
BACJKEAA_630.01.00.0
BACJKEAA_641.00.01.0
BACJKEAA_650.01.00.0
BACJKEAA_660.01.00.0
BACJKEAA_670.01.00.0
BACJKEAA_680.01.00.0
BACJKEAA_690.01.00.0
BACJKEAA_700.01.00.0
BACJKEAA_710.01.00.0
BACJKEAA_720.01.00.0
BACJKEAA_730.01.00.0
BACJKEAA_740.01.00.0
BACJKEAA_750.01.00.0
BACJKEAA_760.01.00.0
BACJKEAA_770.01.00.0
BACJKEAA_780.01.00.0
BACJKEAA_790.01.00.0
BACJKEAA_800.01.00.0
BACJKEAA_810.01.00.0
BACJKEAA_820.01.00.0
BACJKEAA_831.00.01.0
BACJKEAA_840.01.00.0
BACJKEAA_850.01.00.0
BACJKEAA_860.01.00.0
BACJKEAA_871.00.01.0
BACJKEAA_880.01.00.0
BACJKEAA_890.01.00.0
BACJKEAA_900.01.00.0
BACJKEAA_910.01.00.0
BACJKEAA_920.01.00.0
BACJKEAA_931.00.01.0
BACJKEAA_940.01.00.0
BACJKEAA_950.01.00.0
BACJKEAA_960.01.00.0
BACJKEAA_970.01.00.0
BACJKEAA_980.01.00.0
BACJKEAA_990.01.00.0
BACJKEAA_1001.00.01.0
BACJKEAA_1010.01.00.0
BACJKEAA_1021.00.01.0
BACJKEAA_1030.01.00.0
BACJKEAA_1040.01.00.0
BACJKEAA_1050.01.00.0
BACJKEAA_1060.01.00.0
BACJKEAA_1071.00.01.0
BACJKEAA_1081.00.01.0
BACJKEAA_1090.01.00.0
BACJKEAA_1101.00.01.0
BACJKEAA_1111.00.01.0
BACJKEAA_1121.00.01.0
BACJKEAA_1130.01.00.0
BACJKEAA_1140.01.00.0
BACJKEAA_1150.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
BACJKEAA_68444113417FalseUnknownVOG2154,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements