Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
LIOOBEFL_10.01.00.0
LIOOBEFL_20.01.00.0
LIOOBEFL_30.01.00.0
LIOOBEFL_40.01.00.0
LIOOBEFL_50.01.00.0
LIOOBEFL_60.01.00.0
LIOOBEFL_70.01.00.0
LIOOBEFL_80.01.00.0
LIOOBEFL_90.01.00.0
LIOOBEFL_100.01.00.0
LIOOBEFL_110.01.00.0
LIOOBEFL_120.01.00.0
LIOOBEFL_130.01.00.0
LIOOBEFL_140.01.00.0
LIOOBEFL_150.01.00.0
LIOOBEFL_160.01.00.0
LIOOBEFL_170.01.00.0
LIOOBEFL_180.01.00.0
LIOOBEFL_190.01.00.0
LIOOBEFL_200.01.00.0
LIOOBEFL_210.01.00.0
LIOOBEFL_220.01.00.0
LIOOBEFL_230.01.00.0
LIOOBEFL_240.01.00.0
LIOOBEFL_250.01.00.0
LIOOBEFL_260.01.00.0
LIOOBEFL_270.01.00.0
LIOOBEFL_280.01.00.0
LIOOBEFL_290.01.00.0
LIOOBEFL_300.01.00.0
LIOOBEFL_310.01.00.0
LIOOBEFL_320.01.00.0
LIOOBEFL_330.01.00.0
LIOOBEFL_340.01.00.0
LIOOBEFL_350.01.00.0
LIOOBEFL_360.01.00.0
LIOOBEFL_370.01.00.0
LIOOBEFL_380.01.00.0
LIOOBEFL_390.01.00.0
LIOOBEFL_401.00.01.0
LIOOBEFL_410.01.00.0
LIOOBEFL_420.01.00.0
LIOOBEFL_431.00.01.0
LIOOBEFL_440.01.00.0
LIOOBEFL_450.01.00.0
LIOOBEFL_461.00.01.0
LIOOBEFL_470.01.00.0
LIOOBEFL_480.01.00.0
LIOOBEFL_490.01.00.0
LIOOBEFL_500.01.00.0
LIOOBEFL_510.01.00.0
LIOOBEFL_521.00.01.0
LIOOBEFL_530.01.00.0
LIOOBEFL_540.01.00.0
LIOOBEFL_550.01.00.0
LIOOBEFL_560.01.00.0
LIOOBEFL_570.01.00.0
LIOOBEFL_580.01.00.0
LIOOBEFL_590.01.00.0
LIOOBEFL_600.01.00.0
LIOOBEFL_610.01.00.0
LIOOBEFL_621.00.01.0
LIOOBEFL_630.01.00.0
LIOOBEFL_640.01.00.0
LIOOBEFL_650.01.00.0
LIOOBEFL_660.01.00.0
LIOOBEFL_670.01.00.0
LIOOBEFL_680.01.00.0
LIOOBEFL_690.01.00.0
LIOOBEFL_701.00.01.0
LIOOBEFL_711.00.01.0
LIOOBEFL_720.01.00.0
LIOOBEFL_730.01.00.0
LIOOBEFL_740.01.00.0
LIOOBEFL_750.01.00.0
LIOOBEFL_760.01.00.0
LIOOBEFL_771.00.01.0
LIOOBEFL_780.01.00.0
LIOOBEFL_790.01.00.0
LIOOBEFL_800.01.00.0
LIOOBEFL_810.01.00.0
LIOOBEFL_821.00.01.0
LIOOBEFL_830.01.00.0
LIOOBEFL_840.01.00.0
LIOOBEFL_850.01.00.0
LIOOBEFL_860.01.00.0
LIOOBEFL_870.01.00.0
LIOOBEFL_880.01.00.0
LIOOBEFL_890.01.00.0
LIOOBEFL_900.01.00.0
LIOOBEFL_910.01.00.0
LIOOBEFL_921.00.01.0
LIOOBEFL_931.00.01.0
LIOOBEFL_940.01.00.0
LIOOBEFL_950.01.00.0
LIOOBEFL_960.01.00.0
LIOOBEFL_970.01.00.0
LIOOBEFL_981.00.01.0
LIOOBEFL_990.01.00.0
LIOOBEFL_1000.01.00.0
LIOOBEFL_1010.01.00.0
LIOOBEFL_1020.01.00.0
LIOOBEFL_1030.01.00.0
LIOOBEFL_1041.00.01.0
LIOOBEFL_1050.01.00.0
LIOOBEFL_1060.01.00.0
LIOOBEFL_1070.01.00.0
LIOOBEFL_1080.01.00.0
LIOOBEFL_1090.01.00.0
LIOOBEFL_1100.01.00.0
LIOOBEFL_1110.01.00.0
LIOOBEFL_1120.01.00.0
LIOOBEFL_1131.00.01.0
LIOOBEFL_1140.01.00.0
LIOOBEFL_1150.01.00.0
LIOOBEFL_1160.01.00.0
LIOOBEFL_1170.01.00.0
LIOOBEFL_1180.01.00.0
LIOOBEFL_1190.01.00.0
LIOOBEFL_1200.01.00.0
LIOOBEFL_1210.01.00.0
LIOOBEFL_1220.01.00.0
LIOOBEFL_1230.01.00.0
LIOOBEFL_1241.00.01.0
LIOOBEFL_1250.01.00.0
LIOOBEFL_1260.01.00.0
LIOOBEFL_1271.00.01.0
LIOOBEFL_1280.01.00.0
LIOOBEFL_1290.01.00.0
LIOOBEFL_1301.00.01.0
LIOOBEFL_1310.01.00.0
LIOOBEFL_1321.00.01.0
LIOOBEFL_1330.01.00.0
LIOOBEFL_1340.01.00.0
LIOOBEFL_1350.01.00.0
LIOOBEFL_1360.01.00.0
LIOOBEFL_1370.01.00.0
LIOOBEFL_1381.00.01.0
LIOOBEFL_1390.01.00.0
LIOOBEFL_1401.00.01.0
LIOOBEFL_1410.01.00.0
LIOOBEFL_1420.01.00.0
LIOOBEFL_1430.01.00.0
LIOOBEFL_1440.01.00.0
LIOOBEFL_1450.01.00.0
LIOOBEFL_1460.01.00.0
LIOOBEFL_1470.01.00.0
LIOOBEFL_1480.01.00.0
LIOOBEFL_1490.01.00.0
LIOOBEFL_1500.01.00.0
LIOOBEFL_1510.01.00.0
LIOOBEFL_1520.01.00.0
LIOOBEFL_1530.01.00.0
LIOOBEFL_1540.01.00.0
LIOOBEFL_1550.01.00.0
LIOOBEFL_1560.01.00.0
LIOOBEFL_1570.01.00.0
LIOOBEFL_1580.01.00.0
LIOOBEFL_1591.00.01.0
LIOOBEFL_1600.01.00.0
LIOOBEFL_1610.01.00.0
LIOOBEFL_1620.01.00.0
LIOOBEFL_1631.00.01.0
LIOOBEFL_1640.01.00.0
LIOOBEFL_1650.01.00.0
LIOOBEFL_1660.01.00.0
LIOOBEFL_1671.00.01.0
LIOOBEFL_1680.01.00.0
LIOOBEFL_1691.00.01.0
LIOOBEFL_1701.00.01.0
LIOOBEFL_1710.01.00.0
LIOOBEFL_1720.01.00.0
LIOOBEFL_1730.01.00.0
LIOOBEFL_1740.01.00.0
LIOOBEFL_1750.01.00.0
LIOOBEFL_1761.00.01.0
LIOOBEFL_1771.00.01.0
LIOOBEFL_1781.00.01.0
LIOOBEFL_1790.01.00.0
LIOOBEFL_1800.01.00.0
LIOOBEFL_1810.01.00.0
LIOOBEFL_1820.01.00.0
LIOOBEFL_1830.01.00.0
LIOOBEFL_1840.01.00.0
LIOOBEFL_1850.01.00.0
LIOOBEFL_1860.01.00.0
LIOOBEFL_1870.01.00.0
LIOOBEFL_1880.01.00.0
LIOOBEFL_1891.00.01.0
LIOOBEFL_1900.01.00.0
LIOOBEFL_1910.01.00.0
LIOOBEFL_1921.00.01.0
LIOOBEFL_1930.01.00.0
LIOOBEFL_1940.01.00.0
LIOOBEFL_1951.00.01.0
LIOOBEFL_1960.01.00.0
LIOOBEFL_1970.01.00.0
LIOOBEFL_1980.01.00.0
LIOOBEFL_1990.01.00.0
LIOOBEFL_2001.00.01.0
LIOOBEFL_2010.01.00.0
LIOOBEFL_2020.01.00.0
LIOOBEFL_2030.01.00.0
LIOOBEFL_2041.00.01.0
LIOOBEFL_2050.01.00.0
LIOOBEFL_2060.01.00.0
LIOOBEFL_2070.01.00.0
LIOOBEFL_2081.00.01.0
LIOOBEFL_2090.01.00.0
LIOOBEFL_2101.00.01.0
LIOOBEFL_2110.01.00.0
LIOOBEFL_2120.01.00.0
LIOOBEFL_2130.01.00.0
LIOOBEFL_2140.01.00.0
LIOOBEFL_2151.00.01.0
LIOOBEFL_2161.00.01.0
LIOOBEFL_2170.01.00.0
LIOOBEFL_2180.01.00.0
LIOOBEFL_2190.01.00.0
LIOOBEFL_2201.00.01.0
LIOOBEFL_2210.01.00.0
LIOOBEFL_2221.00.01.0
LIOOBEFL_2230.01.00.0
LIOOBEFL_2240.01.00.0
LIOOBEFL_2250.01.00.0
LIOOBEFL_2261.00.01.0
LIOOBEFL_2270.01.00.0
LIOOBEFL_2280.01.00.0
LIOOBEFL_2290.01.00.0
LIOOBEFL_2300.01.00.0
LIOOBEFL_2311.00.01.0
LIOOBEFL_2321.00.01.0
LIOOBEFL_2331.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements