Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
GCCKEJEH_29031112fumB0.0fumarate hydratase class I80.0567.52AAL23124

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
GCCKEJEH_10.01.00.0
GCCKEJEH_20.01.00.0
GCCKEJEH_30.01.00.0
GCCKEJEH_40.01.00.0
GCCKEJEH_50.01.00.0
GCCKEJEH_60.01.00.0
GCCKEJEH_70.01.00.0
GCCKEJEH_80.01.00.0
GCCKEJEH_90.01.00.0
GCCKEJEH_100.01.00.0
GCCKEJEH_110.01.00.0
GCCKEJEH_120.01.00.0
GCCKEJEH_130.01.00.0
GCCKEJEH_140.01.00.0
GCCKEJEH_150.01.00.0
GCCKEJEH_160.01.00.0
GCCKEJEH_170.01.00.0
GCCKEJEH_180.01.00.0
GCCKEJEH_190.01.00.0
GCCKEJEH_200.01.00.0
GCCKEJEH_210.01.00.0
GCCKEJEH_220.01.00.0
GCCKEJEH_230.01.00.0
GCCKEJEH_240.01.00.0
GCCKEJEH_250.01.00.0
GCCKEJEH_261.00.01.0
GCCKEJEH_270.01.00.0
GCCKEJEH_280.01.00.0
GCCKEJEH_290.01.00.0
GCCKEJEH_300.01.00.0
GCCKEJEH_310.01.00.0
GCCKEJEH_320.01.00.0
GCCKEJEH_330.01.00.0
GCCKEJEH_340.01.00.0
GCCKEJEH_350.01.00.0
GCCKEJEH_361.00.01.0
GCCKEJEH_370.01.00.0
GCCKEJEH_380.01.00.0
GCCKEJEH_391.00.01.0
GCCKEJEH_400.01.00.0
GCCKEJEH_410.01.00.0
GCCKEJEH_420.01.00.0
GCCKEJEH_430.01.00.0
GCCKEJEH_440.01.00.0
GCCKEJEH_450.01.00.0
GCCKEJEH_460.01.00.0
GCCKEJEH_470.01.00.0
GCCKEJEH_480.01.00.0
GCCKEJEH_490.01.00.0
GCCKEJEH_501.00.01.0
GCCKEJEH_510.01.00.0
GCCKEJEH_520.01.00.0
GCCKEJEH_530.01.00.0
GCCKEJEH_541.00.01.0
GCCKEJEH_550.01.00.0
GCCKEJEH_561.00.01.0
GCCKEJEH_570.01.00.0
GCCKEJEH_580.01.00.0
GCCKEJEH_590.01.00.0
GCCKEJEH_600.01.00.0
GCCKEJEH_610.01.00.0
GCCKEJEH_620.01.00.0
GCCKEJEH_630.01.00.0
GCCKEJEH_640.01.00.0
GCCKEJEH_650.01.00.0
GCCKEJEH_660.01.00.0
GCCKEJEH_670.01.00.0
GCCKEJEH_680.01.00.0
GCCKEJEH_690.01.00.0
GCCKEJEH_700.01.00.0
GCCKEJEH_710.01.00.0
GCCKEJEH_720.01.00.0
GCCKEJEH_730.01.00.0
GCCKEJEH_740.01.00.0
GCCKEJEH_750.01.00.0
GCCKEJEH_760.01.00.0
GCCKEJEH_770.01.00.0
GCCKEJEH_780.01.00.0
GCCKEJEH_790.01.00.0
GCCKEJEH_800.01.00.0
GCCKEJEH_810.01.00.0
GCCKEJEH_820.01.00.0
GCCKEJEH_830.01.00.0
GCCKEJEH_840.01.00.0
GCCKEJEH_850.01.00.0
GCCKEJEH_860.01.00.0
GCCKEJEH_870.01.00.0
GCCKEJEH_880.01.00.0
GCCKEJEH_890.01.00.0
GCCKEJEH_900.01.00.0
GCCKEJEH_910.01.00.0
GCCKEJEH_921.00.01.0
GCCKEJEH_930.01.00.0
GCCKEJEH_940.01.00.0
GCCKEJEH_951.00.01.0
GCCKEJEH_960.01.00.0
GCCKEJEH_971.00.01.0
GCCKEJEH_981.00.01.0
GCCKEJEH_990.01.00.0
GCCKEJEH_1000.01.00.0
GCCKEJEH_1010.01.00.0
GCCKEJEH_1020.01.00.0
GCCKEJEH_1030.01.00.0
GCCKEJEH_1040.01.00.0
GCCKEJEH_1051.00.01.0
GCCKEJEH_1060.01.00.0
GCCKEJEH_1071.00.01.0
GCCKEJEH_1080.01.00.0
GCCKEJEH_1091.00.01.0
GCCKEJEH_1100.01.00.0
GCCKEJEH_1111.00.01.0
GCCKEJEH_1120.01.00.0
GCCKEJEH_1130.01.00.0
GCCKEJEH_1140.01.00.0
GCCKEJEH_1150.01.00.0
GCCKEJEH_1160.01.00.0
GCCKEJEH_1170.01.00.0
GCCKEJEH_1180.01.00.0
GCCKEJEH_1190.01.00.0
GCCKEJEH_1200.01.00.0
GCCKEJEH_1210.01.00.0
GCCKEJEH_1220.01.00.0
GCCKEJEH_1230.01.00.0
GCCKEJEH_1241.00.01.0
GCCKEJEH_1250.01.00.0
GCCKEJEH_1260.01.00.0
GCCKEJEH_1270.01.00.0
GCCKEJEH_1280.01.00.0
GCCKEJEH_1290.01.00.0
GCCKEJEH_1300.01.00.0
GCCKEJEH_1310.01.00.0
GCCKEJEH_1321.00.01.0
GCCKEJEH_1330.01.00.0
GCCKEJEH_1340.01.00.0
GCCKEJEH_1350.01.00.0
GCCKEJEH_1360.01.00.0
GCCKEJEH_1370.01.00.0
GCCKEJEH_1380.01.00.0
GCCKEJEH_1391.00.01.0
GCCKEJEH_1400.01.00.0
GCCKEJEH_1410.01.00.0
GCCKEJEH_1420.01.00.0
GCCKEJEH_1430.01.00.0
GCCKEJEH_1440.01.00.0
GCCKEJEH_1450.01.00.0
GCCKEJEH_1460.01.00.0
GCCKEJEH_1470.01.00.0
GCCKEJEH_1480.01.00.0
GCCKEJEH_1490.01.00.0
GCCKEJEH_1500.01.00.0
GCCKEJEH_1510.01.00.0
GCCKEJEH_1521.00.01.0
GCCKEJEH_1530.01.00.0
GCCKEJEH_1540.01.00.0
GCCKEJEH_1550.01.00.0
GCCKEJEH_1560.01.00.0
GCCKEJEH_1571.00.01.0
GCCKEJEH_1580.01.00.0
GCCKEJEH_1590.01.00.0
GCCKEJEH_1600.01.00.0
GCCKEJEH_1610.01.00.0
GCCKEJEH_1620.01.00.0
GCCKEJEH_1630.01.00.0
GCCKEJEH_1640.01.00.0
GCCKEJEH_1650.01.00.0
GCCKEJEH_1660.01.00.0
GCCKEJEH_1671.00.01.0
GCCKEJEH_1680.01.00.0
GCCKEJEH_1690.01.00.0
GCCKEJEH_1700.01.00.0
GCCKEJEH_1710.01.00.0
GCCKEJEH_1720.01.00.0
GCCKEJEH_1730.01.00.0
GCCKEJEH_1740.01.00.0
GCCKEJEH_1750.01.00.0
GCCKEJEH_1760.01.00.0
GCCKEJEH_1770.01.00.0
GCCKEJEH_1781.00.01.0
GCCKEJEH_1790.01.00.0
GCCKEJEH_1800.01.00.0
GCCKEJEH_1810.01.00.0
GCCKEJEH_1821.00.01.0
GCCKEJEH_1830.01.00.0
GCCKEJEH_1840.01.00.0
GCCKEJEH_1851.00.01.0
GCCKEJEH_1860.01.00.0
GCCKEJEH_1870.01.00.0
GCCKEJEH_1881.00.01.0
GCCKEJEH_1890.01.00.0
GCCKEJEH_1900.01.00.0
GCCKEJEH_1910.01.00.0
GCCKEJEH_1920.01.00.0
GCCKEJEH_1931.00.01.0
GCCKEJEH_1940.01.00.0
GCCKEJEH_1950.01.00.0
GCCKEJEH_1960.01.00.0
GCCKEJEH_1971.00.01.0
GCCKEJEH_1981.00.01.0
GCCKEJEH_1990.01.00.0
GCCKEJEH_2001.00.01.0
GCCKEJEH_2010.01.00.0
GCCKEJEH_2020.01.00.0
GCCKEJEH_2030.01.00.0
GCCKEJEH_2040.01.00.0
GCCKEJEH_2050.01.00.0
GCCKEJEH_2060.01.00.0
GCCKEJEH_2070.01.00.0
GCCKEJEH_2080.01.00.0
GCCKEJEH_2091.00.01.0
GCCKEJEH_2100.01.00.0
GCCKEJEH_2110.01.00.0
GCCKEJEH_2121.00.01.0
GCCKEJEH_2130.01.00.0
GCCKEJEH_2140.01.00.0
GCCKEJEH_2150.01.00.0
GCCKEJEH_2160.01.00.0
GCCKEJEH_2170.01.00.0
GCCKEJEH_2180.01.00.0
GCCKEJEH_2190.01.00.0
GCCKEJEH_2200.01.00.0
GCCKEJEH_2210.01.00.0
GCCKEJEH_2221.00.01.0
GCCKEJEH_2231.00.01.0
GCCKEJEH_2240.01.00.0
GCCKEJEH_2251.00.01.0
GCCKEJEH_2260.01.00.0
GCCKEJEH_2270.01.00.0
GCCKEJEH_2280.01.00.0
GCCKEJEH_2290.01.00.0
GCCKEJEH_2300.01.00.0
GCCKEJEH_2310.01.00.0
GCCKEJEH_2320.01.00.0
GCCKEJEH_2330.01.00.0
GCCKEJEH_2340.01.00.0
GCCKEJEH_2350.01.00.0
GCCKEJEH_2361.00.01.0
GCCKEJEH_2370.01.00.0
GCCKEJEH_2380.01.00.0
GCCKEJEH_2390.01.00.0
GCCKEJEH_2400.01.00.0
GCCKEJEH_2410.01.00.0
GCCKEJEH_2420.01.00.0
GCCKEJEH_2430.01.00.0
GCCKEJEH_2440.01.00.0
GCCKEJEH_2451.00.01.0
GCCKEJEH_2460.01.00.0
GCCKEJEH_2471.00.01.0
GCCKEJEH_2480.01.00.0
GCCKEJEH_2490.01.00.0
GCCKEJEH_2501.00.01.0
GCCKEJEH_2511.00.01.0
GCCKEJEH_2520.01.00.0
GCCKEJEH_2530.01.00.0
GCCKEJEH_2541.00.01.0
GCCKEJEH_2550.01.00.0
GCCKEJEH_2560.01.00.0
GCCKEJEH_2571.00.01.0
GCCKEJEH_2580.01.00.0
GCCKEJEH_2590.01.00.0
GCCKEJEH_2600.01.00.0
GCCKEJEH_2610.01.00.0
GCCKEJEH_2620.01.00.0
GCCKEJEH_2630.01.00.0
GCCKEJEH_2640.01.00.0
GCCKEJEH_2650.01.00.0
GCCKEJEH_2661.00.01.0
GCCKEJEH_2671.00.01.0
GCCKEJEH_2681.00.01.0
GCCKEJEH_2690.01.00.0
GCCKEJEH_2700.01.00.0
GCCKEJEH_2710.01.00.0
GCCKEJEH_2720.01.00.0
GCCKEJEH_2730.01.00.0
GCCKEJEH_2740.01.00.0
GCCKEJEH_2751.00.01.0
GCCKEJEH_2761.00.01.0
GCCKEJEH_2770.01.00.0
GCCKEJEH_2780.01.00.0
GCCKEJEH_2790.01.00.0
GCCKEJEH_2800.01.00.0
GCCKEJEH_2811.00.01.0
GCCKEJEH_2820.01.00.0
GCCKEJEH_2830.01.00.0
GCCKEJEH_2841.00.01.0
GCCKEJEH_2850.01.00.0
GCCKEJEH_2860.01.00.0
GCCKEJEH_2870.01.00.0
GCCKEJEH_2880.01.00.0
GCCKEJEH_2890.01.00.0
GCCKEJEH_2900.01.00.0
GCCKEJEH_2911.00.01.0
GCCKEJEH_2920.01.00.0
GCCKEJEH_2930.01.00.0
GCCKEJEH_2940.01.00.0
GCCKEJEH_2950.01.00.0
GCCKEJEH_2960.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
GCCKEJEH_24515851545FalseSiphoviridaeVOG7624,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements