Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
IGCMKJBP_10.01.00.0
IGCMKJBP_20.01.00.0
IGCMKJBP_30.01.00.0
IGCMKJBP_40.01.00.0
IGCMKJBP_50.01.00.0
IGCMKJBP_60.01.00.0
IGCMKJBP_70.01.00.0
IGCMKJBP_80.01.00.0
IGCMKJBP_90.01.00.0
IGCMKJBP_100.01.00.0
IGCMKJBP_110.01.00.0
IGCMKJBP_120.01.00.0
IGCMKJBP_131.00.01.0
IGCMKJBP_140.01.00.0
IGCMKJBP_150.01.00.0
IGCMKJBP_160.01.00.0
IGCMKJBP_170.01.00.0
IGCMKJBP_180.01.00.0
IGCMKJBP_190.01.00.0
IGCMKJBP_200.01.00.0
IGCMKJBP_210.01.00.0
IGCMKJBP_220.01.00.0
IGCMKJBP_230.01.00.0
IGCMKJBP_240.01.00.0
IGCMKJBP_250.01.00.0
IGCMKJBP_261.00.01.0
IGCMKJBP_270.01.00.0
IGCMKJBP_280.01.00.0
IGCMKJBP_290.01.00.0
IGCMKJBP_300.01.00.0
IGCMKJBP_310.01.00.0
IGCMKJBP_321.00.01.0
IGCMKJBP_330.01.00.0
IGCMKJBP_340.01.00.0
IGCMKJBP_350.01.00.0
IGCMKJBP_360.01.00.0
IGCMKJBP_370.01.00.0
IGCMKJBP_380.01.00.0
IGCMKJBP_390.01.00.0
IGCMKJBP_400.01.00.0
IGCMKJBP_410.01.00.0
IGCMKJBP_421.00.01.0
IGCMKJBP_430.01.00.0
IGCMKJBP_440.01.00.0
IGCMKJBP_450.01.00.0
IGCMKJBP_460.01.00.0
IGCMKJBP_470.01.00.0
IGCMKJBP_480.01.00.0
IGCMKJBP_490.01.00.0
IGCMKJBP_500.01.00.0
IGCMKJBP_510.01.00.0
IGCMKJBP_520.01.00.0
IGCMKJBP_530.01.00.0
IGCMKJBP_540.01.00.0
IGCMKJBP_550.01.00.0
IGCMKJBP_561.00.01.0
IGCMKJBP_571.00.01.0
IGCMKJBP_580.01.00.0
IGCMKJBP_590.01.00.0
IGCMKJBP_600.01.00.0
IGCMKJBP_610.01.00.0
IGCMKJBP_620.01.00.0
IGCMKJBP_630.01.00.0
IGCMKJBP_640.01.00.0
IGCMKJBP_650.01.00.0
IGCMKJBP_660.01.00.0
IGCMKJBP_670.01.00.0
IGCMKJBP_680.01.00.0
IGCMKJBP_690.01.00.0
IGCMKJBP_700.01.00.0
IGCMKJBP_711.00.01.0
IGCMKJBP_720.01.00.0
IGCMKJBP_730.01.00.0
IGCMKJBP_740.01.00.0
IGCMKJBP_751.00.01.0
IGCMKJBP_760.01.00.0
IGCMKJBP_770.01.00.0
IGCMKJBP_780.01.00.0
IGCMKJBP_790.01.00.0
IGCMKJBP_800.01.00.0
IGCMKJBP_810.01.00.0
IGCMKJBP_821.00.01.0
IGCMKJBP_830.01.00.0
IGCMKJBP_840.01.00.0
IGCMKJBP_850.01.00.0
IGCMKJBP_860.01.00.0
IGCMKJBP_870.01.00.0
IGCMKJBP_880.01.00.0
IGCMKJBP_890.01.00.0
IGCMKJBP_900.01.00.0
IGCMKJBP_910.01.00.0
IGCMKJBP_920.01.00.0
IGCMKJBP_930.01.00.0
IGCMKJBP_940.01.00.0
IGCMKJBP_950.01.00.0
IGCMKJBP_960.01.00.0
IGCMKJBP_970.01.00.0
IGCMKJBP_981.00.01.0
IGCMKJBP_991.00.01.0
IGCMKJBP_1000.01.00.0
IGCMKJBP_1010.01.00.0
IGCMKJBP_1020.01.00.0
IGCMKJBP_1030.01.00.0
IGCMKJBP_1040.01.00.0
IGCMKJBP_1050.01.00.0
IGCMKJBP_1061.00.01.0
IGCMKJBP_1071.00.01.0
IGCMKJBP_1080.01.00.0
IGCMKJBP_1091.00.01.0
IGCMKJBP_1100.01.00.0
IGCMKJBP_1110.01.00.0
IGCMKJBP_1120.01.00.0
IGCMKJBP_1130.01.00.0
IGCMKJBP_1140.01.00.0
IGCMKJBP_1151.00.01.0
IGCMKJBP_1160.01.00.0
IGCMKJBP_1170.01.00.0
IGCMKJBP_1180.01.00.0
IGCMKJBP_1191.00.01.0
IGCMKJBP_1200.01.00.0
IGCMKJBP_1210.01.00.0
IGCMKJBP_1220.01.00.0
IGCMKJBP_1230.01.00.0
IGCMKJBP_1240.01.00.0
IGCMKJBP_1250.01.00.0
IGCMKJBP_1261.00.01.0
IGCMKJBP_1271.00.01.0
IGCMKJBP_1281.00.01.0
IGCMKJBP_1291.00.01.0
IGCMKJBP_1300.01.00.0
IGCMKJBP_1310.01.00.0
IGCMKJBP_1320.01.00.0
IGCMKJBP_1330.01.00.0
IGCMKJBP_1341.00.01.0
IGCMKJBP_1350.01.00.0
IGCMKJBP_1360.01.00.0
IGCMKJBP_1370.01.00.0
IGCMKJBP_1380.01.00.0
IGCMKJBP_1391.00.01.0
IGCMKJBP_1400.01.00.0
IGCMKJBP_1411.00.01.0
IGCMKJBP_1421.00.01.0
IGCMKJBP_1430.01.00.0
IGCMKJBP_1440.01.00.0
IGCMKJBP_1450.01.00.0
IGCMKJBP_1460.01.00.0
IGCMKJBP_1470.01.00.0
IGCMKJBP_1481.00.01.0
IGCMKJBP_1491.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
IGCMKJBP_371355916956FalseSiphoviridaeVOG0685,
IGCMKJBP_42112919068FalseSiphoviridaeVOG10013,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements