Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
CJCDJNGP_10.01.00.0
CJCDJNGP_20.01.00.0
CJCDJNGP_30.01.00.0
CJCDJNGP_40.01.00.0
CJCDJNGP_50.01.00.0
CJCDJNGP_60.01.00.0
CJCDJNGP_70.01.00.0
CJCDJNGP_80.01.00.0
CJCDJNGP_90.01.00.0
CJCDJNGP_100.01.00.0
CJCDJNGP_110.01.00.0
CJCDJNGP_120.01.00.0
CJCDJNGP_131.00.01.0
CJCDJNGP_140.01.00.0
CJCDJNGP_150.01.00.0
CJCDJNGP_160.01.00.0
CJCDJNGP_170.01.00.0
CJCDJNGP_180.01.00.0
CJCDJNGP_190.01.00.0
CJCDJNGP_200.01.00.0
CJCDJNGP_210.01.00.0
CJCDJNGP_220.01.00.0
CJCDJNGP_230.01.00.0
CJCDJNGP_240.01.00.0
CJCDJNGP_251.00.01.0
CJCDJNGP_261.00.01.0
CJCDJNGP_270.01.00.0
CJCDJNGP_281.00.01.0
CJCDJNGP_291.00.01.0
CJCDJNGP_301.00.01.0
CJCDJNGP_310.01.00.0
CJCDJNGP_321.00.01.0
CJCDJNGP_330.01.00.0
CJCDJNGP_340.01.00.0
CJCDJNGP_351.00.01.0
CJCDJNGP_361.00.01.0
CJCDJNGP_370.01.00.0
CJCDJNGP_381.00.01.0
CJCDJNGP_390.01.00.0
CJCDJNGP_400.01.00.0
CJCDJNGP_410.01.00.0
CJCDJNGP_420.01.00.0
CJCDJNGP_430.01.00.0
CJCDJNGP_440.01.00.0
CJCDJNGP_450.01.00.0
CJCDJNGP_460.01.00.0
CJCDJNGP_471.00.01.0
CJCDJNGP_480.01.00.0
CJCDJNGP_490.01.00.0
CJCDJNGP_500.01.00.0
CJCDJNGP_511.00.01.0
CJCDJNGP_520.01.00.0
CJCDJNGP_531.00.01.0
CJCDJNGP_540.01.00.0
CJCDJNGP_551.00.01.0
CJCDJNGP_560.01.00.0
CJCDJNGP_570.01.00.0
CJCDJNGP_580.01.00.0
CJCDJNGP_590.01.00.0
CJCDJNGP_600.01.00.0
CJCDJNGP_610.01.00.0
CJCDJNGP_620.01.00.0
CJCDJNGP_630.01.00.0
CJCDJNGP_640.01.00.0
CJCDJNGP_650.01.00.0
CJCDJNGP_660.01.00.0
CJCDJNGP_670.01.00.0
CJCDJNGP_681.00.01.0
CJCDJNGP_690.01.00.0
CJCDJNGP_700.01.00.0
CJCDJNGP_710.01.00.0
CJCDJNGP_720.01.00.0
CJCDJNGP_730.01.00.0
CJCDJNGP_741.00.01.0
CJCDJNGP_751.00.01.0
CJCDJNGP_760.01.00.0
CJCDJNGP_770.01.00.0
CJCDJNGP_780.01.00.0
CJCDJNGP_790.01.00.0
CJCDJNGP_800.01.00.0
CJCDJNGP_811.00.01.0
CJCDJNGP_820.01.00.0
CJCDJNGP_830.01.00.0
CJCDJNGP_840.01.00.0
CJCDJNGP_850.01.00.0
CJCDJNGP_861.00.01.0
CJCDJNGP_870.01.00.0
CJCDJNGP_881.00.01.0
CJCDJNGP_890.01.00.0
CJCDJNGP_901.00.01.0
CJCDJNGP_910.01.00.0
CJCDJNGP_921.00.01.0
CJCDJNGP_930.01.00.0
CJCDJNGP_940.01.00.0
CJCDJNGP_950.01.00.0
CJCDJNGP_961.00.01.0
CJCDJNGP_970.01.00.0
CJCDJNGP_980.01.00.0
CJCDJNGP_990.01.00.0
CJCDJNGP_1000.01.00.0
CJCDJNGP_1010.01.00.0
CJCDJNGP_1020.01.00.0
CJCDJNGP_1031.00.01.0
CJCDJNGP_1041.00.01.0
CJCDJNGP_1051.00.01.0
CJCDJNGP_1060.01.00.0
CJCDJNGP_1070.01.00.0
CJCDJNGP_1081.00.01.0
CJCDJNGP_1090.01.00.0
CJCDJNGP_1101.00.01.0
CJCDJNGP_1111.00.01.0
CJCDJNGP_1121.00.01.0
CJCDJNGP_1131.00.01.0
CJCDJNGP_1140.01.00.0
CJCDJNGP_1151.00.01.0
CJCDJNGP_1161.00.01.0
CJCDJNGP_1171.00.01.0
CJCDJNGP_1181.00.01.0
CJCDJNGP_1190.01.00.0
CJCDJNGP_1200.01.00.0
CJCDJNGP_1211.00.01.0
CJCDJNGP_1220.01.00.0
CJCDJNGP_1230.01.00.0
CJCDJNGP_1240.01.00.0
CJCDJNGP_1251.00.01.0
CJCDJNGP_1260.01.00.0
CJCDJNGP_1270.01.00.0
CJCDJNGP_1280.01.00.0
CJCDJNGP_1290.01.00.0
CJCDJNGP_1300.01.00.0
CJCDJNGP_1310.01.00.0
CJCDJNGP_1321.00.01.0
CJCDJNGP_1331.00.01.0
CJCDJNGP_1341.00.01.0
CJCDJNGP_1351.00.01.0
CJCDJNGP_1361.00.01.0
CJCDJNGP_1370.01.00.0
CJCDJNGP_1381.00.01.0
CJCDJNGP_1390.01.00.0
CJCDJNGP_1400.01.00.0
CJCDJNGP_1410.01.00.0
CJCDJNGP_1421.00.01.0
CJCDJNGP_1431.00.01.0
CJCDJNGP_1441.00.01.0
CJCDJNGP_1450.01.00.0
CJCDJNGP_1461.00.01.0
CJCDJNGP_1471.00.01.0
CJCDJNGP_1481.00.01.0
CJCDJNGP_1490.01.00.0
CJCDJNGP_1500.01.00.0
CJCDJNGP_1511.00.01.0
CJCDJNGP_1520.01.00.0
CJCDJNGP_1530.01.00.0
CJCDJNGP_1540.01.00.0
CJCDJNGP_1551.00.01.0
CJCDJNGP_1560.01.00.0
CJCDJNGP_1571.00.01.0
CJCDJNGP_1581.00.01.0
CJCDJNGP_1590.01.00.0
CJCDJNGP_1600.01.00.0
CJCDJNGP_1611.00.01.0
CJCDJNGP_1620.01.00.0
CJCDJNGP_1630.01.00.0
CJCDJNGP_1640.01.00.0
CJCDJNGP_1651.00.01.0
CJCDJNGP_1661.00.01.0
CJCDJNGP_1670.01.00.0
CJCDJNGP_1680.01.00.0
CJCDJNGP_1691.00.01.0
CJCDJNGP_1700.01.00.0
CJCDJNGP_1711.00.01.0
CJCDJNGP_1721.00.01.0
CJCDJNGP_1730.01.00.0
CJCDJNGP_1740.01.00.0
CJCDJNGP_1750.01.00.0
CJCDJNGP_1761.00.01.0
CJCDJNGP_1771.00.01.0
CJCDJNGP_1781.00.01.0
CJCDJNGP_1790.01.00.0
CJCDJNGP_1800.01.00.0
CJCDJNGP_1811.00.01.0
CJCDJNGP_1821.00.01.0
CJCDJNGP_1830.01.00.0
CJCDJNGP_1840.01.00.0
CJCDJNGP_1850.01.00.0
CJCDJNGP_1861.00.01.0
CJCDJNGP_1870.01.00.0
CJCDJNGP_1880.01.00.0
CJCDJNGP_1891.00.01.0
CJCDJNGP_1901.00.01.0
CJCDJNGP_1911.00.01.0
CJCDJNGP_1921.00.01.0
CJCDJNGP_1931.00.01.0
CJCDJNGP_1940.01.00.0
CJCDJNGP_1950.01.00.0
CJCDJNGP_1960.01.00.0
CJCDJNGP_1971.00.01.0
CJCDJNGP_1981.00.01.0
CJCDJNGP_1990.01.00.0
CJCDJNGP_2001.00.01.0
CJCDJNGP_2011.00.01.0
CJCDJNGP_2021.00.01.0
CJCDJNGP_2030.01.00.0
CJCDJNGP_2040.01.00.0
CJCDJNGP_2050.01.00.0
CJCDJNGP_2061.00.01.0
CJCDJNGP_2071.00.01.0
CJCDJNGP_2081.00.01.0
CJCDJNGP_2090.01.00.0
CJCDJNGP_2100.01.00.0
CJCDJNGP_2110.01.00.0
CJCDJNGP_2120.01.00.0
CJCDJNGP_2131.00.01.0
CJCDJNGP_2141.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
CJCDJNGP_14575982622FalseMyoviridaeVOG7643,
CJCDJNGP_22181649368FalseMyoviridaeVOG0641,
CJCDJNGP_3946931188FalseSiphoviridaeVOG0992,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements