Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
DAGPJMLO_10.01.00.0
DAGPJMLO_20.01.00.0
DAGPJMLO_30.01.00.0
DAGPJMLO_40.01.00.0
DAGPJMLO_50.01.00.0
DAGPJMLO_60.01.00.0
DAGPJMLO_70.01.00.0
DAGPJMLO_80.01.00.0
DAGPJMLO_90.01.00.0
DAGPJMLO_100.01.00.0
DAGPJMLO_110.01.00.0
DAGPJMLO_120.01.00.0
DAGPJMLO_130.01.00.0
DAGPJMLO_140.01.00.0
DAGPJMLO_150.01.00.0
DAGPJMLO_160.01.00.0
DAGPJMLO_170.01.00.0
DAGPJMLO_180.01.00.0
DAGPJMLO_190.01.00.0
DAGPJMLO_200.01.00.0
DAGPJMLO_210.01.00.0
DAGPJMLO_220.01.00.0
DAGPJMLO_230.01.00.0
DAGPJMLO_240.01.00.0
DAGPJMLO_250.01.00.0
DAGPJMLO_260.01.00.0
DAGPJMLO_270.01.00.0
DAGPJMLO_280.01.00.0
DAGPJMLO_290.01.00.0
DAGPJMLO_300.01.00.0
DAGPJMLO_310.01.00.0
DAGPJMLO_320.01.00.0
DAGPJMLO_330.01.00.0
DAGPJMLO_340.01.00.0
DAGPJMLO_350.01.00.0
DAGPJMLO_360.01.00.0
DAGPJMLO_370.01.00.0
DAGPJMLO_380.01.00.0
DAGPJMLO_391.00.01.0
DAGPJMLO_400.01.00.0
DAGPJMLO_410.01.00.0
DAGPJMLO_420.01.00.0
DAGPJMLO_430.01.00.0
DAGPJMLO_440.01.00.0
DAGPJMLO_450.01.00.0
DAGPJMLO_460.01.00.0
DAGPJMLO_470.01.00.0
DAGPJMLO_480.01.00.0
DAGPJMLO_490.01.00.0
DAGPJMLO_501.00.01.0
DAGPJMLO_510.01.00.0
DAGPJMLO_520.01.00.0
DAGPJMLO_530.01.00.0
DAGPJMLO_540.01.00.0
DAGPJMLO_550.01.00.0
DAGPJMLO_560.01.00.0
DAGPJMLO_570.01.00.0
DAGPJMLO_580.01.00.0
DAGPJMLO_590.01.00.0
DAGPJMLO_600.01.00.0
DAGPJMLO_610.01.00.0
DAGPJMLO_621.00.01.0
DAGPJMLO_630.01.00.0
DAGPJMLO_640.01.00.0
DAGPJMLO_651.00.01.0
DAGPJMLO_660.01.00.0
DAGPJMLO_670.01.00.0
DAGPJMLO_680.01.00.0
DAGPJMLO_690.01.00.0
DAGPJMLO_700.01.00.0
DAGPJMLO_710.01.00.0
DAGPJMLO_721.00.01.0
DAGPJMLO_730.01.00.0
DAGPJMLO_740.01.00.0
DAGPJMLO_751.00.01.0
DAGPJMLO_760.01.00.0
DAGPJMLO_771.00.01.0
DAGPJMLO_780.01.00.0
DAGPJMLO_791.00.01.0
DAGPJMLO_800.01.00.0
DAGPJMLO_810.01.00.0
DAGPJMLO_820.01.00.0
DAGPJMLO_830.01.00.0
DAGPJMLO_840.01.00.0
DAGPJMLO_851.00.01.0
DAGPJMLO_861.00.01.0
DAGPJMLO_871.00.01.0
DAGPJMLO_880.01.00.0
DAGPJMLO_890.01.00.0
DAGPJMLO_900.01.00.0
DAGPJMLO_911.00.01.0
DAGPJMLO_920.01.00.0
DAGPJMLO_930.01.00.0
DAGPJMLO_940.01.00.0
DAGPJMLO_951.00.01.0
DAGPJMLO_960.01.00.0
DAGPJMLO_971.00.01.0
DAGPJMLO_980.01.00.0
DAGPJMLO_991.00.01.0
DAGPJMLO_1000.01.00.0
DAGPJMLO_1010.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
DAGPJMLO_24885277791FalseMyoviridaeVOG5878,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements