Search results for phylogenetically related strains

 

Rank Compare Genome ID Species Strain BioSample ID Host Allelic distance ARGs VFs PGs PPRS
1GCA_027152825.1Lactobacillus crispatusC0006A2SAMN25045928Homo sapiens0
2GCA_027152845.1Lactobacillus crispatusC0006A3SAMN25045929Homo sapiens1
3GCA_027152885.1Lactobacillus crispatusC0006A1SAMN25045927Homo sapiens2
4GCA_027152805.1Lactobacillus crispatusC0006A5SAMN25045930Homo sapiens3
5GCA_000176975.2Lactobacillus crispatus SJ-3C-USSJ-3C-USSAMN02463837Homo sapiens115
6GCA_001546015.1Lactobacillus crispatusVMC1SAMN03893599Homo sapiens119
7GCA_009730275.1Lactobacillus crispatusFDAARGOS_743SAMN11056458Homo sapiens120
8GCA_029011475.1Lactobacillus crispatusVSI24SAMN33275449Homo sapiens121
9GCA_002861765.1Lactobacillus crispatusUMB0803SAMN08193687Homo sapiens132
10GCA_001541515.1Lactobacillus crispatusVMC5SAMN03893603Homo sapiens134
11GCA_040428735.1Lactobacillus crispatus241_B_1SAMN41996352Homo sapiens137
12GCA_038001985.1Lactobacillus crispatusLB83SAMN33861662Homo sapiens139
13GCA_040428755.1Lactobacillus crispatus197_Q4_aSAMN41996350Homo sapiens139
14GCA_040428725.1Lactobacillus crispatus197_Q2_b2SAMN41996351Homo sapiens143
15GCA_027154285.1Lactobacillus crispatusC0168C2SAMN25045860Homo sapiens146
16GCA_027154295.1Lactobacillus crispatusC0168C1SAMN25045859Homo sapiens146
17GCA_040717775.1Lactobacillus crispatusUMB6500SAMN42334630Homo sapiens154
18GCA_030218935.1Lactobacillus crispatusUMB0013SAMN34996436Homo sapiens155
19GCA_040717795.1Lactobacillus crispatusUMB6490SAMN42334631Homo sapiens155
20GCA_027156705.1Lactobacillus crispatusC0052B1SAMN25045783Homo sapiens159
21GCA_027153985.1Lactobacillus crispatusC0172A2SAMN25045871Homo sapiens160
22GCA_027154025.1Lactobacillus crispatusC0171C5SAMN25045869Homo sapiens160
23GCA_027154035.1Lactobacillus crispatusC0171C2SAMN25045868Homo sapiens160
24GCA_027154065.1Lactobacillus crispatusC0171A4SAMN25045867Homo sapiens160
25GCA_027154125.1Lactobacillus crispatusC0171A1SAMN25045864Homo sapiens160
26GCA_027154135.1Lactobacillus crispatusC0171A2SAMN25045865Homo sapiens160
27GCA_027156725.1Lactobacillus crispatusC0052B2SAMN25045784Homo sapiens160
28GCA_027153925.1Lactobacillus crispatusC0172A4SAMN25045873Homo sapiens161
29GCA_027154085.1Lactobacillus crispatusC0171A3SAMN25045866Homo sapiens162
30GCA_027154005.1Lactobacillus crispatusC0172A1SAMN25045870Homo sapiens164
31GCA_027153965.1Lactobacillus crispatusC0172A3SAMN25045872Homo sapiens165
32GCA_029011155.1Lactobacillus crispatusVSI04SAMN33275431Homo sapiens173
33GCA_030218845.1Lactobacillus crispatusUMB0020ASAMN34996442Homo sapiens179
34GCA_033803565.1Lactobacillus crispatusUMB2389SAMN38148657Homo sapiens181
35GCA_033804285.1Lactobacillus crispatusUMB4315SAMN38148619Homo sapiens181
36GCA_040717885.1Lactobacillus crispatusUMB4314BSAMN42334620Homo sapiens181
37GCA_033804305.1Lactobacillus crispatusUMB4313SAMN38148620Homo sapiens182
38GCA_033804265.1Lactobacillus crispatusUMB4340SAMN38148621Homo sapiens183
39GCA_040701525.1Lactobacillus crispatus39_01SAMN42370544Homo sapiens187
40GCA_027583975.1Lactobacillus crispatusC0096F9SAMN25046018Homo sapiens189
41GCA_027583995.1Lactobacillus crispatusC0096D5SAMN25046017Homo sapiens189
42GCA_030213125.1Lactobacillus crispatusUMB10498SAMN34996733Homo sapiens191
43GCA_030226265.1Lactobacillus crispatusUMB7805SAMN34998692Homo sapiens191
44GCA_003971565.1Lactobacillus crispatusAB70SAMN08409124Homo sapiens193
45GCA_038001445.1Lactobacillus crispatusLB138SAMN33861688Homo sapiens193
46GCA_038001965.1Lactobacillus crispatusLB86SAMN33861665Homo sapiens193
47GCA_030212455.1Lactobacillus crispatusUMB9965SAMN34996768Homo sapiens194
48GCA_018885325.1Lactobacillus crispatusPMC201SAMN19601668-197
49GCA_027153255.1Lactobacillus crispatusC0049A1SAMN25045907Homo sapiens197
50GCA_027153385.1Lactobacillus crispatusC0028A1SAMN25045906Homo sapiens198
51GCA_038001725.1Lactobacillus crispatusLB96SAMN33861675Homo sapiens198
52GCA_038001825.1Lactobacillus crispatusLB91SAMN33861670Homo sapiens198
53GCA_027584095.1Lactobacillus crispatusC0090B2SAMN25046013Homo sapiens199
54GCA_038001705.1Lactobacillus crispatusLB97SAMN33861676Homo sapiens199
55GCA_027583915.1Lactobacillus crispatusC0103D4SAMN25046021Homo sapiens201
56GCA_027584035.1Lactobacillus crispatusC0090E6SAMN25046015Homo sapiens201
57GCA_027583895.1Lactobacillus crispatusC0103E5SAMN25046022Homo sapiens202
58GCA_038001925.1Lactobacillus crispatusLB85SAMN33861664Homo sapiens203
59GCA_038001945.1Lactobacillus crispatusLB84SAMN33861663Homo sapiens203
60GCA_030222225.1Lactobacillus crispatusUMB0014SAMN34996437Homo sapiens204
61GCA_038002085.1Lactobacillus crispatusLB74SAMN33861655Homo sapiens204
62GCA_001541585.1Lactobacillus crispatusVMC8SAMN03893606Homo sapiens205
63GCA_016162155.1Lactobacillus crispatusLB61SAMN15357366Homo sapiens205
64GCA_038002125.1Lactobacillus crispatusLB75SAMN33861656Homo sapiens205
65GCA_016162145.1Lactobacillus crispatusLB58SAMN15357364Homo sapiens206
66GCA_038001485.1Lactobacillus crispatusLB133SAMN33861686Homo sapiens206
67GCA_038001865.1Lactobacillus crispatusLB89SAMN33861668Homo sapiens206
68GCA_038002025.1Lactobacillus crispatusLb82SAMN33861661Homo sapiens206
69GCA_038001805.1Lactobacillus crispatusLB92SAMN33861671Homo sapiens207
70GCA_004361075.1Lactobacillus crispatusRL32SAMN07213212Homo sapiens208
71GCA_004361095.1Lactobacillus crispatusRL31SAMN07213211Homo sapiens208
72GCA_040428575.1Lactobacillus crispatus0422_293_1_1_MRS10SAMN41996359Homo sapiens208
73GCA_027159065.1Lactobacillus crispatusC0123B3SAMN25045730Homo sapiens209
74GCA_027159085.1Lactobacillus crispatusC0123B2SAMN25045729Homo sapiens209
75GCA_040428625.1Lactobacillus crispatus294_Q3_1SAMN41996358Homo sapiens209
76GCA_004361455.1Lactobacillus crispatusRL30SAMN07213210Homo sapiens210
77GCA_015708055.1Lactobacillus crispatusCRI17SAMN14773342Homo sapiens210
78GCA_027159095.1Lactobacillus crispatusC0123B1SAMN25045728Homo sapiens210
79GCA_004361215.1Lactobacillus crispatusRL17SAMN07213198Homo sapiens211
80GCA_004361245.1Lactobacillus crispatusRL15SAMN07213196Homo sapiens211
81GCA_015708065.1Lactobacillus crispatusCRI10SAMN14772552Homo sapiens211
82GCA_040428615.1Lactobacillus crispatus294_F1_2SAMN41996357Homo sapiens211
83GCA_002861775.1Lactobacillus crispatusUMB0044SAMN08193688Homo sapiens212
84GCA_029011495.1Lactobacillus crispatusVSI21SAMN33275448Homo sapiens212
85GCA_038001545.1Lactobacillus crispatusLB105SAMN33861683Homo sapiens212
86GCA_004361395.1Lactobacillus crispatusRL33SAMN07213213Homo sapiens213
87GCA_004361125.1Lactobacillus crispatusRL28SAMN07213208Homo sapiens214
88GCA_004361265.1Lactobacillus crispatusRL13SAMN07213194Homo sapiens214
89GCA_000301135.1Lactobacillus crispatus FB077-07FB077-07SAMN02463885Homo sapiens215
90GCA_004361315.1Lactobacillus crispatusRL08SAMN07213190Homo sapiens215
91GCA_040428825.1Lactobacillus crispatus194_Q3_2SAMN41996347Homo sapiens215
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