Search results for phylogenetically related strains

 

Rank Compare Genome ID Species Strain BioSample ID Host Allelic distance ARGs VFs PGs PPRS
1GCA_027584035.1Lactobacillus crispatusC0090E6SAMN25046015Homo sapiens0
2GCA_027584095.1Lactobacillus crispatusC0090B2SAMN25046013Homo sapiens8
3GCA_040701525.1Lactobacillus crispatus39_01SAMN42370544Homo sapiens34
4GCA_027583975.1Lactobacillus crispatusC0096F9SAMN25046018Homo sapiens35
5GCA_027583995.1Lactobacillus crispatusC0096D5SAMN25046017Homo sapiens35
6GCA_030213125.1Lactobacillus crispatusUMB10498SAMN34996733Homo sapiens37
7GCA_003971565.1Lactobacillus crispatusAB70SAMN08409124Homo sapiens39
8GCA_030226265.1Lactobacillus crispatusUMB7805SAMN34998692Homo sapiens39
9GCA_038001965.1Lactobacillus crispatusLB86SAMN33861665Homo sapiens39
10GCA_038001445.1Lactobacillus crispatusLB138SAMN33861688Homo sapiens42
11GCA_038001705.1Lactobacillus crispatusLB97SAMN33861676Homo sapiens49
12GCA_038001725.1Lactobacillus crispatusLB96SAMN33861675Homo sapiens52
13GCA_018885325.1Lactobacillus crispatusPMC201SAMN19601668-54
14GCA_038002085.1Lactobacillus crispatusLB74SAMN33861655Homo sapiens55
15GCA_038002125.1Lactobacillus crispatusLB75SAMN33861656Homo sapiens57
16GCA_016162155.1Lactobacillus crispatusLB61SAMN15357366Homo sapiens58
17GCA_038001865.1Lactobacillus crispatusLB89SAMN33861668Homo sapiens60
18GCA_038001925.1Lactobacillus crispatusLB85SAMN33861664Homo sapiens64
19GCA_038001945.1Lactobacillus crispatusLB84SAMN33861663Homo sapiens64
20GCA_038001485.1Lactobacillus crispatusLB133SAMN33861686Homo sapiens66
21GCA_038002025.1Lactobacillus crispatusLb82SAMN33861661Homo sapiens67
22GCA_038001805.1Lactobacillus crispatusLB92SAMN33861671Homo sapiens69
23GCA_030219025.1Lactobacillus crispatusUMB7847SAMN34996431Homo sapiens112
24GCA_027583915.1Lactobacillus crispatusC0103D4SAMN25046021Homo sapiens144
25GCA_027583895.1Lactobacillus crispatusC0103E5SAMN25046022Homo sapiens145
26GCA_012030075.1Lactobacillus crispatusUMB1163SAMN14478482Homo sapiens178
27GCA_029011155.1Lactobacillus crispatusVSI04SAMN33275431Homo sapiens181
28GCA_027154285.1Lactobacillus crispatusC0168C2SAMN25045860Homo sapiens189
29GCA_027154295.1Lactobacillus crispatusC0168C1SAMN25045859Homo sapiens189
30GCA_027156705.1Lactobacillus crispatusC0052B1SAMN25045783Homo sapiens192
31GCA_027156725.1Lactobacillus crispatusC0052B2SAMN25045784Homo sapiens193
32GCA_000176975.2Lactobacillus crispatus SJ-3C-USSJ-3C-USSAMN02463837Homo sapiens195
33GCA_038001985.1Lactobacillus crispatusLB83SAMN33861662Homo sapiens199
34GCA_027152845.1Lactobacillus crispatusC0006A3SAMN25045929Homo sapiens200
35GCA_027152825.1Lactobacillus crispatusC0006A2SAMN25045928Homo sapiens201
36GCA_027152885.1Lactobacillus crispatusC0006A1SAMN25045927Homo sapiens201
37GCA_027152805.1Lactobacillus crispatusC0006A5SAMN25045930Homo sapiens202
38GCA_002861765.1Lactobacillus crispatusUMB0803SAMN08193687Homo sapiens207
39GCA_001541515.1Lactobacillus crispatusVMC5SAMN03893603Homo sapiens208
40GCA_040428755.1Lactobacillus crispatus197_Q4_aSAMN41996350Homo sapiens209
41GCA_040428725.1Lactobacillus crispatus197_Q2_b2SAMN41996351Homo sapiens212
42GCA_040717775.1Lactobacillus crispatusUMB6500SAMN42334630Homo sapiens213
43GCA_040717795.1Lactobacillus crispatusUMB6490SAMN42334631Homo sapiens213
44GCA_029011475.1Lactobacillus crispatusVSI24SAMN33275449Homo sapiens215
45GCA_001546015.1Lactobacillus crispatusVMC1SAMN03893599Homo sapiens217
46GCA_009730275.1Lactobacillus crispatusFDAARGOS_743SAMN11056458Homo sapiens217
47GCA_027153985.1Lactobacillus crispatusC0172A2SAMN25045871Homo sapiens218
48GCA_027154025.1Lactobacillus crispatusC0171C5SAMN25045869Homo sapiens218
49GCA_027154035.1Lactobacillus crispatusC0171C2SAMN25045868Homo sapiens218
50GCA_027154065.1Lactobacillus crispatusC0171A4SAMN25045867Homo sapiens218
51GCA_027154125.1Lactobacillus crispatusC0171A1SAMN25045864Homo sapiens218
52GCA_027154135.1Lactobacillus crispatusC0171A2SAMN25045865Homo sapiens218
53GCA_027153925.1Lactobacillus crispatusC0172A4SAMN25045873Homo sapiens219
54GCA_027154085.1Lactobacillus crispatusC0171A3SAMN25045866Homo sapiens220
55GCA_027154005.1Lactobacillus crispatusC0172A1SAMN25045870Homo sapiens221
56GCA_027153965.1Lactobacillus crispatusC0172A3SAMN25045872Homo sapiens223
57GCA_001541585.1Lactobacillus crispatusVMC8SAMN03893606Homo sapiens224
58GCA_040428735.1Lactobacillus crispatus241_B_1SAMN41996352Homo sapiens229
59GCA_030212455.1Lactobacillus crispatusUMB9965SAMN34996768Homo sapiens232
60GCA_027153255.1Lactobacillus crispatusC0049A1SAMN25045907Homo sapiens234
61GCA_030218935.1Lactobacillus crispatusUMB0013SAMN34996436Homo sapiens235
62GCA_027153385.1Lactobacillus crispatusC0028A1SAMN25045906Homo sapiens236
63GCA_029011495.1Lactobacillus crispatusVSI21SAMN33275448Homo sapiens237
64GCA_030218845.1Lactobacillus crispatusUMB0020ASAMN34996442Homo sapiens247
65GCA_002861775.1Lactobacillus crispatusUMB0044SAMN08193688Homo sapiens248
66GCA_040428625.1Lactobacillus crispatus294_Q3_1SAMN41996358Homo sapiens248
67GCA_033803565.1Lactobacillus crispatusUMB2389SAMN38148657Homo sapiens250
68GCA_033804285.1Lactobacillus crispatusUMB4315SAMN38148619Homo sapiens250
69GCA_040428615.1Lactobacillus crispatus294_F1_2SAMN41996357Homo sapiens250
70GCA_016162145.1Lactobacillus crispatusLB58SAMN15357364Homo sapiens251
71GCA_033804305.1Lactobacillus crispatusUMB4313SAMN38148620Homo sapiens251
72GCA_004361215.1Lactobacillus crispatusRL17SAMN07213198Homo sapiens252
73GCA_004361245.1Lactobacillus crispatusRL15SAMN07213196Homo sapiens252
74GCA_004361455.1Lactobacillus crispatusRL30SAMN07213210Homo sapiens252
75GCA_033804265.1Lactobacillus crispatusUMB4340SAMN38148621Homo sapiens252
76GCA_015708055.1Lactobacillus crispatusCRI17SAMN14773342Homo sapiens253
77GCA_040717885.1Lactobacillus crispatusUMB4314BSAMN42334620Homo sapiens253
78GCA_004361315.1Lactobacillus crispatusRL08SAMN07213190Homo sapiens255
79GCA_015708065.1Lactobacillus crispatusCRI10SAMN14772552Homo sapiens255
80GCA_000301135.1Lactobacillus crispatus FB077-07FB077-07SAMN02463885Homo sapiens256
81GCA_004361125.1Lactobacillus crispatusRL28SAMN07213208Homo sapiens256
82GCA_004361265.1Lactobacillus crispatusRL13SAMN07213194Homo sapiens257
83GCA_004361395.1Lactobacillus crispatusRL33SAMN07213213Homo sapiens257
84GCA_040428575.1Lactobacillus crispatus0422_293_1_1_MRS10SAMN41996359Homo sapiens257
85GCA_040428515.1Lactobacillus crispatus0795_578_1_1_MRS1SAMN41996363Homo sapiens258
86GCA_004361095.1Lactobacillus crispatusRL31SAMN07213211Homo sapiens260
87GCA_004361175.1Lactobacillus crispatusRL26SAMN07213206Homo sapiens260
88GCA_030222225.1Lactobacillus crispatusUMB0014SAMN34996437Homo sapiens260
89GCA_038001505.1Lactobacillus crispatusLB135SAMN33861687Homo sapiens260
90GCA_001541505.1Lactobacillus crispatusVMC6SAMN03893604Homo sapiens261
91GCA_004361075.1Lactobacillus crispatusRL32SAMN07213212Homo sapiens261
92GCA_004361115.1Lactobacillus crispatusRL29SAMN07213209Homo sapiens261
93GCA_004361205.1Lactobacillus crispatusRL19SAMN07213199Homo sapiens261
94GCA_004361295.1Lactobacillus crispatusRL11SAMN07213193Homo sapiens261
95GCA_004361185.1Lactobacillus crispatusRL24SAMN07213204Homo sapiens263
96GCA_027160285.1Lactobacillus crispatusC0002A4SAMN25045689Homo sapiens263
97GCA_038001565.1Lactobacillus crispatusLB129SAMN33861685Homo sapiens263
98GCA_015708075.1Lactobacillus crispatusCRI8SAMN14771635Homo sapiens264
99GCA_027159065.1Lactobacillus crispatusC0123B3SAMN25045730Homo sapiens266
100GCA_027159085.1Lactobacillus crispatusC0123B2SAMN25045729Homo sapiens266