Search results for phylogenetically related strains

 

Rank Compare Genome ID Species Strain BioSample ID Host Allelic distance ARGs VFs PGs PPRS
1GCA_038001705.1Lactobacillus crispatusLB97SAMN33861676Homo sapiens0
2GCA_038001725.1Lactobacillus crispatusLB96SAMN33861675Homo sapiens11
3GCA_027583975.1Lactobacillus crispatusC0096F9SAMN25046018Homo sapiens29
4GCA_027583995.1Lactobacillus crispatusC0096D5SAMN25046017Homo sapiens29
5GCA_040701525.1Lactobacillus crispatus39_01SAMN42370544Homo sapiens29
6GCA_030213125.1Lactobacillus crispatusUMB10498SAMN34996733Homo sapiens31
7GCA_003971565.1Lactobacillus crispatusAB70SAMN08409124Homo sapiens33
8GCA_030226265.1Lactobacillus crispatusUMB7805SAMN34998692Homo sapiens34
9GCA_038001445.1Lactobacillus crispatusLB138SAMN33861688Homo sapiens35
10GCA_038001965.1Lactobacillus crispatusLB86SAMN33861665Homo sapiens35
11GCA_027584095.1Lactobacillus crispatusC0090B2SAMN25046013Homo sapiens45
12GCA_018885325.1Lactobacillus crispatusPMC201SAMN19601668-49
13GCA_027584035.1Lactobacillus crispatusC0090E6SAMN25046015Homo sapiens49
14GCA_038002085.1Lactobacillus crispatusLB74SAMN33861655Homo sapiens51
15GCA_038002125.1Lactobacillus crispatusLB75SAMN33861656Homo sapiens51
16GCA_016162155.1Lactobacillus crispatusLB61SAMN15357366Homo sapiens52
17GCA_038001925.1Lactobacillus crispatusLB85SAMN33861664Homo sapiens55
18GCA_038001945.1Lactobacillus crispatusLB84SAMN33861663Homo sapiens55
19GCA_038001865.1Lactobacillus crispatusLB89SAMN33861668Homo sapiens56
20GCA_038002025.1Lactobacillus crispatusLb82SAMN33861661Homo sapiens60
21GCA_038001485.1Lactobacillus crispatusLB133SAMN33861686Homo sapiens64
22GCA_038001805.1Lactobacillus crispatusLB92SAMN33861671Homo sapiens65
23GCA_030219025.1Lactobacillus crispatusUMB7847SAMN34996431Homo sapiens107
24GCA_027583915.1Lactobacillus crispatusC0103D4SAMN25046021Homo sapiens139
25GCA_027583895.1Lactobacillus crispatusC0103E5SAMN25046022Homo sapiens140
26GCA_012030075.1Lactobacillus crispatusUMB1163SAMN14478482Homo sapiens174
27GCA_029011155.1Lactobacillus crispatusVSI04SAMN33275431Homo sapiens176
28GCA_027154285.1Lactobacillus crispatusC0168C2SAMN25045860Homo sapiens182
29GCA_027154295.1Lactobacillus crispatusC0168C1SAMN25045859Homo sapiens182
30GCA_027156705.1Lactobacillus crispatusC0052B1SAMN25045783Homo sapiens187
31GCA_027156725.1Lactobacillus crispatusC0052B2SAMN25045784Homo sapiens188
32GCA_000176975.2Lactobacillus crispatus SJ-3C-USSJ-3C-USSAMN02463837Homo sapiens189
33GCA_038001985.1Lactobacillus crispatusLB83SAMN33861662Homo sapiens192
34GCA_027152845.1Lactobacillus crispatusC0006A3SAMN25045929Homo sapiens198
35GCA_002861765.1Lactobacillus crispatusUMB0803SAMN08193687Homo sapiens199
36GCA_027152825.1Lactobacillus crispatusC0006A2SAMN25045928Homo sapiens199
37GCA_027152885.1Lactobacillus crispatusC0006A1SAMN25045927Homo sapiens199
38GCA_027152805.1Lactobacillus crispatusC0006A5SAMN25045930Homo sapiens200
39GCA_040428755.1Lactobacillus crispatus197_Q4_aSAMN41996350Homo sapiens201
40GCA_001541515.1Lactobacillus crispatusVMC5SAMN03893603Homo sapiens202
41GCA_040428725.1Lactobacillus crispatus197_Q2_b2SAMN41996351Homo sapiens203
42GCA_029011475.1Lactobacillus crispatusVSI24SAMN33275449Homo sapiens208
43GCA_040717775.1Lactobacillus crispatusUMB6500SAMN42334630Homo sapiens208
44GCA_040717795.1Lactobacillus crispatusUMB6490SAMN42334631Homo sapiens209
45GCA_001546015.1Lactobacillus crispatusVMC1SAMN03893599Homo sapiens212
46GCA_009730275.1Lactobacillus crispatusFDAARGOS_743SAMN11056458Homo sapiens212
47GCA_027153985.1Lactobacillus crispatusC0172A2SAMN25045871Homo sapiens212
48GCA_027154025.1Lactobacillus crispatusC0171C5SAMN25045869Homo sapiens212
49GCA_027154035.1Lactobacillus crispatusC0171C2SAMN25045868Homo sapiens212
50GCA_027154065.1Lactobacillus crispatusC0171A4SAMN25045867Homo sapiens212
51GCA_027154125.1Lactobacillus crispatusC0171A1SAMN25045864Homo sapiens212
52GCA_027154135.1Lactobacillus crispatusC0171A2SAMN25045865Homo sapiens212
53GCA_027153925.1Lactobacillus crispatusC0172A4SAMN25045873Homo sapiens213
54GCA_027154085.1Lactobacillus crispatusC0171A3SAMN25045866Homo sapiens214
55GCA_027154005.1Lactobacillus crispatusC0172A1SAMN25045870Homo sapiens215
56GCA_027153965.1Lactobacillus crispatusC0172A3SAMN25045872Homo sapiens217
57GCA_001541585.1Lactobacillus crispatusVMC8SAMN03893606Homo sapiens218
58GCA_040428735.1Lactobacillus crispatus241_B_1SAMN41996352Homo sapiens223
59GCA_029011495.1Lactobacillus crispatusVSI21SAMN33275448Homo sapiens226
60GCA_030212455.1Lactobacillus crispatusUMB9965SAMN34996768Homo sapiens227
61GCA_027153255.1Lactobacillus crispatusC0049A1SAMN25045907Homo sapiens230
62GCA_030218935.1Lactobacillus crispatusUMB0013SAMN34996436Homo sapiens231
63GCA_027153385.1Lactobacillus crispatusC0028A1SAMN25045906Homo sapiens232
64GCA_004361215.1Lactobacillus crispatusRL17SAMN07213198Homo sapiens242
65GCA_004361245.1Lactobacillus crispatusRL15SAMN07213196Homo sapiens242
66GCA_004361455.1Lactobacillus crispatusRL30SAMN07213210Homo sapiens242
67GCA_040428625.1Lactobacillus crispatus294_Q3_1SAMN41996358Homo sapiens242
68GCA_002861775.1Lactobacillus crispatusUMB0044SAMN08193688Homo sapiens243
69GCA_015708055.1Lactobacillus crispatusCRI17SAMN14773342Homo sapiens243
70GCA_000301135.1Lactobacillus crispatus FB077-07FB077-07SAMN02463885Homo sapiens244
71GCA_030218845.1Lactobacillus crispatusUMB0020ASAMN34996442Homo sapiens244
72GCA_040428615.1Lactobacillus crispatus294_F1_2SAMN41996357Homo sapiens244
73GCA_004361315.1Lactobacillus crispatusRL08SAMN07213190Homo sapiens245
74GCA_033803565.1Lactobacillus crispatusUMB2389SAMN38148657Homo sapiens245
75GCA_033804285.1Lactobacillus crispatusUMB4315SAMN38148619Homo sapiens245
76GCA_015708065.1Lactobacillus crispatusCRI10SAMN14772552Homo sapiens246
77GCA_033804305.1Lactobacillus crispatusUMB4313SAMN38148620Homo sapiens246
78GCA_016162145.1Lactobacillus crispatusLB58SAMN15357364Homo sapiens247
79GCA_033804265.1Lactobacillus crispatusUMB4340SAMN38148621Homo sapiens247
80GCA_004361125.1Lactobacillus crispatusRL28SAMN07213208Homo sapiens248
81GCA_004361395.1Lactobacillus crispatusRL33SAMN07213213Homo sapiens248
82GCA_040717885.1Lactobacillus crispatusUMB4314BSAMN42334620Homo sapiens248
83GCA_004361265.1Lactobacillus crispatusRL13SAMN07213194Homo sapiens249
84GCA_038001505.1Lactobacillus crispatusLB135SAMN33861687Homo sapiens249
85GCA_004361095.1Lactobacillus crispatusRL31SAMN07213211Homo sapiens250
86GCA_004361175.1Lactobacillus crispatusRL26SAMN07213206Homo sapiens250
87GCA_038001565.1Lactobacillus crispatusLB129SAMN33861685Homo sapiens250
88GCA_001541505.1Lactobacillus crispatusVMC6SAMN03893604Homo sapiens251
89GCA_004361075.1Lactobacillus crispatusRL32SAMN07213212Homo sapiens251
90GCA_004361115.1Lactobacillus crispatusRL29SAMN07213209Homo sapiens251
91GCA_004361185.1Lactobacillus crispatusRL24SAMN07213204Homo sapiens251
92GCA_004361205.1Lactobacillus crispatusRL19SAMN07213199Homo sapiens251
93GCA_040428515.1Lactobacillus crispatus0795_578_1_1_MRS1SAMN41996363Homo sapiens251
94GCA_040428575.1Lactobacillus crispatus0422_293_1_1_MRS10SAMN41996359Homo sapiens251
95GCA_004361295.1Lactobacillus crispatusRL11SAMN07213193Homo sapiens252
96GCA_027160285.1Lactobacillus crispatusC0002A4SAMN25045689Homo sapiens252
97GCA_015708075.1Lactobacillus crispatusCRI8SAMN14771635Homo sapiens254
98GCA_027160325.1Lactobacillus crispatusC0002A5SAMN25045690Homo sapiens255
99GCA_038001825.1Lactobacillus crispatusLB91SAMN33861670Homo sapiens255
100GCA_030222225.1Lactobacillus crispatusUMB0014SAMN34996437Homo sapiens256