Search results for phylogenetically related strains

 

Rank Compare Genome ID Species Strain BioSample ID Host Allelic distance ARGs VFs PGs PPRS
1GCA_038001985.1Lactobacillus crispatusLB83SAMN33861662Homo sapiens0
2GCA_000176975.2Lactobacillus crispatus SJ-3C-USSJ-3C-USSAMN02463837Homo sapiens127
3GCA_027152845.1Lactobacillus crispatusC0006A3SAMN25045929Homo sapiens138
4GCA_027152825.1Lactobacillus crispatusC0006A2SAMN25045928Homo sapiens139
5GCA_027152885.1Lactobacillus crispatusC0006A1SAMN25045927Homo sapiens139
6GCA_027152805.1Lactobacillus crispatusC0006A5SAMN25045930Homo sapiens140
7GCA_040428755.1Lactobacillus crispatus197_Q4_aSAMN41996350Homo sapiens145
8GCA_040428725.1Lactobacillus crispatus197_Q2_b2SAMN41996351Homo sapiens147
9GCA_029011475.1Lactobacillus crispatusVSI24SAMN33275449Homo sapiens148
10GCA_027154285.1Lactobacillus crispatusC0168C2SAMN25045860Homo sapiens153
11GCA_027154295.1Lactobacillus crispatusC0168C1SAMN25045859Homo sapiens153
12GCA_001546015.1Lactobacillus crispatusVMC1SAMN03893599Homo sapiens155
13GCA_009730275.1Lactobacillus crispatusFDAARGOS_743SAMN11056458Homo sapiens155
14GCA_027156705.1Lactobacillus crispatusC0052B1SAMN25045783Homo sapiens159
15GCA_002861765.1Lactobacillus crispatusUMB0803SAMN08193687Homo sapiens160
16GCA_027156725.1Lactobacillus crispatusC0052B2SAMN25045784Homo sapiens160
17GCA_040428735.1Lactobacillus crispatus241_B_1SAMN41996352Homo sapiens162
18GCA_040717775.1Lactobacillus crispatusUMB6500SAMN42334630Homo sapiens163
19GCA_040717795.1Lactobacillus crispatusUMB6490SAMN42334631Homo sapiens164
20GCA_029011155.1Lactobacillus crispatusVSI04SAMN33275431Homo sapiens167
21GCA_027153925.1Lactobacillus crispatusC0172A4SAMN25045873Homo sapiens168
22GCA_027153985.1Lactobacillus crispatusC0172A2SAMN25045871Homo sapiens168
23GCA_027154025.1Lactobacillus crispatusC0171C5SAMN25045869Homo sapiens168
24GCA_027154035.1Lactobacillus crispatusC0171C2SAMN25045868Homo sapiens168
25GCA_027154065.1Lactobacillus crispatusC0171A4SAMN25045867Homo sapiens168
26GCA_027154125.1Lactobacillus crispatusC0171A1SAMN25045864Homo sapiens168
27GCA_027154135.1Lactobacillus crispatusC0171A2SAMN25045865Homo sapiens168
28GCA_027154085.1Lactobacillus crispatusC0171A3SAMN25045866Homo sapiens170
29GCA_027154005.1Lactobacillus crispatusC0172A1SAMN25045870Homo sapiens171
30GCA_001541515.1Lactobacillus crispatusVMC5SAMN03893603Homo sapiens172
31GCA_027153965.1Lactobacillus crispatusC0172A3SAMN25045872Homo sapiens173
32GCA_030218935.1Lactobacillus crispatusUMB0013SAMN34996436Homo sapiens179
33GCA_040701525.1Lactobacillus crispatus39_01SAMN42370544Homo sapiens182
34GCA_027583975.1Lactobacillus crispatusC0096F9SAMN25046018Homo sapiens184
35GCA_027583995.1Lactobacillus crispatusC0096D5SAMN25046017Homo sapiens184
36GCA_030226265.1Lactobacillus crispatusUMB7805SAMN34998692Homo sapiens185
37GCA_033803565.1Lactobacillus crispatusUMB2389SAMN38148657Homo sapiens185
38GCA_033804285.1Lactobacillus crispatusUMB4315SAMN38148619Homo sapiens185
39GCA_033804305.1Lactobacillus crispatusUMB4313SAMN38148620Homo sapiens186
40GCA_003971565.1Lactobacillus crispatusAB70SAMN08409124Homo sapiens187
41GCA_030213125.1Lactobacillus crispatusUMB10498SAMN34996733Homo sapiens187
42GCA_033804265.1Lactobacillus crispatusUMB4340SAMN38148621Homo sapiens187
43GCA_038001965.1Lactobacillus crispatusLB86SAMN33861665Homo sapiens187
44GCA_040717885.1Lactobacillus crispatusUMB4314BSAMN42334620Homo sapiens188
45GCA_030212455.1Lactobacillus crispatusUMB9965SAMN34996768Homo sapiens189
46GCA_038001445.1Lactobacillus crispatusLB138SAMN33861688Homo sapiens189
47GCA_038001705.1Lactobacillus crispatusLB97SAMN33861676Homo sapiens192
48GCA_018885325.1Lactobacillus crispatusPMC201SAMN19601668-193
49GCA_038001725.1Lactobacillus crispatusLB96SAMN33861675Homo sapiens193
50GCA_027584095.1Lactobacillus crispatusC0090B2SAMN25046013Homo sapiens196
51GCA_038001925.1Lactobacillus crispatusLB85SAMN33861664Homo sapiens198
52GCA_038001945.1Lactobacillus crispatusLB84SAMN33861663Homo sapiens198
53GCA_027584035.1Lactobacillus crispatusC0090E6SAMN25046015Homo sapiens199
54GCA_027153255.1Lactobacillus crispatusC0049A1SAMN25045907Homo sapiens200
55GCA_030218845.1Lactobacillus crispatusUMB0020ASAMN34996442Homo sapiens200
56GCA_038002085.1Lactobacillus crispatusLB74SAMN33861655Homo sapiens200
57GCA_016162155.1Lactobacillus crispatusLB61SAMN15357366Homo sapiens201
58GCA_027583915.1Lactobacillus crispatusC0103D4SAMN25046021Homo sapiens201
59GCA_038002025.1Lactobacillus crispatusLb82SAMN33861661Homo sapiens201
60GCA_038002125.1Lactobacillus crispatusLB75SAMN33861656Homo sapiens201
61GCA_027153385.1Lactobacillus crispatusC0028A1SAMN25045906Homo sapiens202
62GCA_027583895.1Lactobacillus crispatusC0103E5SAMN25046022Homo sapiens202
63GCA_038001865.1Lactobacillus crispatusLB89SAMN33861668Homo sapiens203
64GCA_038001805.1Lactobacillus crispatusLB92SAMN33861671Homo sapiens205
65GCA_038001485.1Lactobacillus crispatusLB133SAMN33861686Homo sapiens208
66GCA_016162145.1Lactobacillus crispatusLB58SAMN15357364Homo sapiens209
67GCA_030222225.1Lactobacillus crispatusUMB0014SAMN34996437Homo sapiens209
68GCA_004361455.1Lactobacillus crispatusRL30SAMN07213210Homo sapiens212
69GCA_004361245.1Lactobacillus crispatusRL15SAMN07213196Homo sapiens213
70GCA_040428575.1Lactobacillus crispatus0422_293_1_1_MRS10SAMN41996359Homo sapiens213
71GCA_004361215.1Lactobacillus crispatusRL17SAMN07213198Homo sapiens214
72GCA_015708065.1Lactobacillus crispatusCRI10SAMN14772552Homo sapiens216
73GCA_027159065.1Lactobacillus crispatusC0123B3SAMN25045730Homo sapiens216
74GCA_027159085.1Lactobacillus crispatusC0123B2SAMN25045729Homo sapiens216
75GCA_027159095.1Lactobacillus crispatusC0123B1SAMN25045728Homo sapiens216
76GCA_038001825.1Lactobacillus crispatusLB91SAMN33861670Homo sapiens216
77GCA_004361315.1Lactobacillus crispatusRL08SAMN07213190Homo sapiens217
78GCA_000301135.1Lactobacillus crispatus FB077-07FB077-07SAMN02463885Homo sapiens218
79GCA_015708055.1Lactobacillus crispatusCRI17SAMN14773342Homo sapiens218
80GCA_001541585.1Lactobacillus crispatusVMC8SAMN03893606Homo sapiens221
81GCA_004361265.1Lactobacillus crispatusRL13SAMN07213194Homo sapiens222
82GCA_004361125.1Lactobacillus crispatusRL28SAMN07213208Homo sapiens223
83GCA_004361295.1Lactobacillus crispatusRL11SAMN07213193Homo sapiens224
84GCA_004361395.1Lactobacillus crispatusRL33SAMN07213213Homo sapiens224
85GCA_002861775.1Lactobacillus crispatusUMB0044SAMN08193688Homo sapiens225
86GCA_004361095.1Lactobacillus crispatusRL31SAMN07213211Homo sapiens225
87GCA_016162165.1Lactobacillus crispatusLB59SAMN15357365Homo sapiens225
88GCA_038001505.1Lactobacillus crispatusLB135SAMN33861687Homo sapiens225
89GCA_040428515.1Lactobacillus crispatus0795_578_1_1_MRS1SAMN41996363Homo sapiens225
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91GCA_004361175.1Lactobacillus crispatusRL26SAMN07213206Homo sapiens226
92GCA_038001905.1Lactobacillus crispatusLB87SAMN33861667Homo sapiens226
93GCA_004361115.1Lactobacillus crispatusRL29SAMN07213209Homo sapiens227
94GCA_027160285.1Lactobacillus crispatusC0002A4SAMN25045689Homo sapiens227
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100GCA_038001845.1Lactobacillus crispatusLB90SAMN33861669Homo sapiens229