Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 1 | 0 | 0 | 1.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| KGFGMFNE_395 | 5260 | 7185 | tet(Q) | ARO:3000191 | tet(Q) | 96.57 | 97.56 | Z21523.1 |
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| KGFGMFNE_395 | 5260 | 7185 | tet(Q) | Doxycycline, Tetracycline, Minocycline | 99.79 | 100.00 | L33696 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| KGFGMFNE_395 | 5260 | 7182 | tet(Q) | tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q) | BLASTX | 99.38 | 100.00 | WP_063856407.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| KGFGMFNE_350 | 183 | 763 | repUS2 | 584 / 681 | 80.48 | BFU30316 |
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| KGFGMFNE_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_2 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_4 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_12 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_14 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_20 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_21 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_23 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_25 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_26 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_27 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_30 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_31 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_32 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_33 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_35 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_36 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_37 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_38 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_39 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_40 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_41 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_42 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_43 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_44 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_45 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_48 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_49 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_50 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_51 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_52 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_53 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_54 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_56 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_57 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_62 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_63 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_64 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_65 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_67 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_68 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_70 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_72 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_73 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_74 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_75 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_76 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_80 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_81 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_82 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_83 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_84 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_86 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_87 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_88 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_89 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_90 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_91 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_92 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_93 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_94 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_95 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_96 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_97 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_98 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_99 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_101 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_102 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_103 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_105 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_106 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_107 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_108 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_109 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_110 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_111 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_112 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_113 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_115 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_116 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_117 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_118 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_119 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_120 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_121 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_122 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_123 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_124 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_125 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_126 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_127 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_128 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_129 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_130 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_131 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_133 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_134 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_135 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_137 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_138 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_140 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_142 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_143 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_144 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_147 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_148 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_149 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_150 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_151 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_154 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_155 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_156 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_158 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_161 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_163 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_164 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_165 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_167 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_168 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_169 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_170 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_174 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_175 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_176 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_180 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_181 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_182 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_183 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_186 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_187 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_188 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_189 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_191 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_194 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_195 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_196 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_197 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_198 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_199 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_200 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_202 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_203 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_204 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_208 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_209 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_210 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_212 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_213 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_217 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_218 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_219 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_221 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_224 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_225 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_226 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_228 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_229 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_231 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_232 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_233 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_234 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_236 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_237 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_238 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_239 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_240 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_241 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_242 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_243 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_245 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_247 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_248 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_249 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_252 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_253 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_254 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_255 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_257 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_259 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_262 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_263 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_268 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_269 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_271 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_272 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_274 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_276 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_278 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_279 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_280 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_282 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_284 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_286 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_288 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_290 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_291 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_292 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_295 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_296 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_297 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_298 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_299 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_300 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_301 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_303 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_304 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_305 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_306 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_307 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_308 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_309 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_311 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_312 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_313 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_315 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_316 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_317 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_318 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_319 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_321 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_323 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_324 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_326 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_327 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_328 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_329 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_331 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_333 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_334 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_335 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_336 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_337 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| KGFGMFNE_341 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_342 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_343 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_345 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| KGFGMFNE_346 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
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