Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
2002.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
EAOMFAOK_255342450tet(O)ARO:3000190tet(O)98.28100.00M18896.2

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
EAOMFAOK_255342452tet(O)Doxycycline, Tetracycline, Minocycline100.0099.95Y07780

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
EAOMFAOK_255342450tet(O)tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(O)EXACTX100.00100.00WP_000691759.1
EAOMFAOK_1811542915629vanU-Gglycopeptide resistance transcriptional regulator VanU-GPARTIALX80.6089.33WP_021418929.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
EAOMFAOK_10.01.00.0
EAOMFAOK_21.00.01.0
EAOMFAOK_30.01.00.0
EAOMFAOK_40.01.00.0
EAOMFAOK_51.00.01.0
EAOMFAOK_61.00.01.0
EAOMFAOK_70.01.00.0
EAOMFAOK_90.01.00.0
EAOMFAOK_100.01.00.0
EAOMFAOK_111.00.01.0
EAOMFAOK_121.00.01.0
EAOMFAOK_130.01.00.0
EAOMFAOK_141.00.01.0
EAOMFAOK_150.01.00.0
EAOMFAOK_160.01.00.0
EAOMFAOK_170.01.00.0
EAOMFAOK_180.01.00.0
EAOMFAOK_191.00.01.0
EAOMFAOK_200.01.00.0
EAOMFAOK_210.01.00.0
EAOMFAOK_221.00.01.0
EAOMFAOK_231.00.01.0
EAOMFAOK_240.01.00.0
EAOMFAOK_251.00.01.0
EAOMFAOK_261.00.01.0
EAOMFAOK_270.01.00.0
EAOMFAOK_280.01.00.0
EAOMFAOK_291.00.01.0
EAOMFAOK_301.00.01.0
EAOMFAOK_311.00.01.0
EAOMFAOK_320.01.00.0
EAOMFAOK_330.01.00.0
EAOMFAOK_341.00.01.0
EAOMFAOK_350.01.00.0
EAOMFAOK_361.00.01.0
EAOMFAOK_371.00.01.0
EAOMFAOK_380.01.00.0
EAOMFAOK_391.00.01.0
EAOMFAOK_401.00.01.0
EAOMFAOK_411.00.01.0
EAOMFAOK_421.00.01.0
EAOMFAOK_430.01.00.0
EAOMFAOK_440.01.00.0
EAOMFAOK_451.00.01.0
EAOMFAOK_460.01.00.0
EAOMFAOK_470.01.00.0
EAOMFAOK_480.01.00.0
EAOMFAOK_490.01.00.0
EAOMFAOK_501.00.01.0
EAOMFAOK_511.00.01.0
EAOMFAOK_520.01.00.0
EAOMFAOK_530.01.00.0
EAOMFAOK_541.00.01.0
EAOMFAOK_551.00.01.0
EAOMFAOK_561.00.01.0
EAOMFAOK_570.01.00.0
EAOMFAOK_591.00.01.0
EAOMFAOK_601.00.01.0
EAOMFAOK_610.01.00.0
EAOMFAOK_621.00.01.0
EAOMFAOK_630.01.00.0
EAOMFAOK_641.00.01.0
EAOMFAOK_650.01.00.0
EAOMFAOK_661.00.01.0
EAOMFAOK_681.00.01.0
EAOMFAOK_690.01.00.0
EAOMFAOK_730.01.00.0
EAOMFAOK_800.01.00.0
EAOMFAOK_900.01.00.0
EAOMFAOK_990.01.00.0
EAOMFAOK_1000.01.00.0
EAOMFAOK_1070.01.00.0
EAOMFAOK_1160.01.00.0
EAOMFAOK_1260.01.00.0
EAOMFAOK_1340.01.00.0
EAOMFAOK_1390.01.00.0
EAOMFAOK_1430.01.00.0
EAOMFAOK_1480.01.00.0
EAOMFAOK_1510.01.00.0
EAOMFAOK_1540.01.00.0
EAOMFAOK_1590.01.00.0
EAOMFAOK_1600.01.00.0
EAOMFAOK_1610.01.00.0
EAOMFAOK_1620.01.00.0
EAOMFAOK_1630.01.00.0
EAOMFAOK_1640.01.00.0
EAOMFAOK_1650.01.00.0
EAOMFAOK_1660.01.00.0
EAOMFAOK_1670.01.00.0
EAOMFAOK_1680.01.00.0
EAOMFAOK_1690.01.00.0
EAOMFAOK_1700.01.00.0
EAOMFAOK_1710.01.00.0
EAOMFAOK_1720.01.00.0
EAOMFAOK_1730.01.00.0
EAOMFAOK_1740.01.00.0
EAOMFAOK_1750.01.00.0
EAOMFAOK_1760.01.00.0
EAOMFAOK_1770.01.00.0
EAOMFAOK_1780.01.00.0
EAOMFAOK_1790.01.00.0
EAOMFAOK_1800.01.00.0
EAOMFAOK_1810.01.00.0
EAOMFAOK_1820.01.00.0
EAOMFAOK_1830.01.00.0
EAOMFAOK_1840.01.00.0
EAOMFAOK_1850.01.00.0
EAOMFAOK_1860.01.00.0
EAOMFAOK_1870.01.00.0
EAOMFAOK_1880.01.00.0
EAOMFAOK_1890.01.00.0
EAOMFAOK_1901.00.01.0
EAOMFAOK_1910.01.00.0
EAOMFAOK_1920.01.00.0
EAOMFAOK_1930.01.00.0
EAOMFAOK_1940.01.00.0
EAOMFAOK_1950.01.00.0
EAOMFAOK_1960.01.00.0
EAOMFAOK_1970.01.00.0
EAOMFAOK_1980.01.00.0
EAOMFAOK_1990.01.00.0
EAOMFAOK_2000.01.00.0
EAOMFAOK_2011.00.01.0
EAOMFAOK_2020.01.00.0
EAOMFAOK_2030.01.00.0
EAOMFAOK_2040.01.00.0
EAOMFAOK_2050.01.00.0
EAOMFAOK_2061.00.01.0
EAOMFAOK_2071.00.01.0
EAOMFAOK_2080.01.00.0
EAOMFAOK_2091.00.01.0
EAOMFAOK_2101.00.01.0
EAOMFAOK_2110.01.00.0
EAOMFAOK_2120.01.00.0
EAOMFAOK_2130.01.00.0
EAOMFAOK_2141.00.01.0
EAOMFAOK_2150.01.00.0
EAOMFAOK_2160.01.00.0
EAOMFAOK_2170.01.00.0
EAOMFAOK_2180.01.00.0
EAOMFAOK_2190.01.00.0
EAOMFAOK_2200.01.00.0
EAOMFAOK_2210.01.00.0
EAOMFAOK_2221.00.01.0
EAOMFAOK_2230.01.00.0
EAOMFAOK_2240.01.00.0
EAOMFAOK_2250.01.00.0
EAOMFAOK_2260.01.00.0
EAOMFAOK_2270.01.00.0
EAOMFAOK_2281.00.01.0
EAOMFAOK_2290.01.00.0
EAOMFAOK_2301.00.01.0
EAOMFAOK_2311.00.01.0
EAOMFAOK_2320.01.00.0
EAOMFAOK_2331.00.01.0
EAOMFAOK_2341.00.01.0
EAOMFAOK_2351.00.01.0
EAOMFAOK_2361.00.01.0
EAOMFAOK_2370.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
EAOMFAOK_2371206625592FalseSiphoviridaeVOG9113,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements